RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568266.5

ATXN2L-223, Transcript of ataxin 2 like, human

TSL 5

Gene ATXN2L, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN2L-223	ENST00000568266	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ATXN2L-223	ENST00000568266	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.61	■■■■□ 3.61
ATXN2L-223	ENST00000568266	ABCC9	O60706	1549 aa		37.05	■■■■□ 3.52
ATXN2L-223	ENST00000568266	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.51	■■■■□ 3.27
ATXN2L-223	ENST00000568266	NACAD	O15069	1562 aa		35.42	■■■■□ 3.26
ATXN2L-223	ENST00000568266	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.38	■■■■□ 3.25
ATXN2L-223	ENST00000568266	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.15	■■■■□ 3.22
ATXN2L-223	ENST00000568266	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.13	■■■■□ 3.21
ATXN2L-223	ENST00000568266	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.91	■■■■□ 3.18
ATXN2L-223	ENST00000568266	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.69	■■■■□ 3.14
ATXN2L-223	ENST00000568266	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.6	■■■■□ 3.13
ATXN2L-223	ENST00000568266	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.48	■■■■□ 3.11
ATXN2L-223	ENST00000568266	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.34	■■■■□ 3.09
ATXN2L-223	ENST00000568266	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.21	■■■■□ 3.07
ATXN2L-223	ENST00000568266	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.05	■■■■□ 3.04
ATXN2L-223	ENST00000568266	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ATXN2L-223	ENST00000568266	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ATXN2L-223	ENST00000568266	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ATXN2L-223	ENST00000568266	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.81	■■■□□ 2.84
ATXN2L-223	ENST00000568266	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
ATXN2L-223	ENST00000568266	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ATXN2L-223	ENST00000568266	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ATXN2L-223	ENST00000568266	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ATXN2L-223	ENST00000568266	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ATXN2L-223	ENST00000568266	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.51	■■■□□ 2.8
ATXN2L-223	ENST00000568266	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ATXN2L-223	ENST00000568266	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
ATXN2L-223	ENST00000568266	WIZ	O95785	1651 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ATXN2L-223	ENST00000568266	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ATXN2L-223	ENST00000568266	NES	P48681	1621 aa		32.01	■■■□□ 2.72
ATXN2L-223	ENST00000568266	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ATXN2L-223	ENST00000568266	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ATXN2L-223	ENST00000568266	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
ATXN2L-223	ENST00000568266	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ATXN2L-223	ENST00000568266	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ATXN2L-223	ENST00000568266	CUX2	O14529	1486 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ATXN2L-223	ENST00000568266	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ATXN2L-223	ENST00000568266	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
ATXN2L-223	ENST00000568266	CFTR	P13569	1480 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ATXN2L-223	ENST00000568266	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ATXN2L-223	ENST00000568266	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.38	■■■□□ 2.61
ATXN2L-223	ENST00000568266	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ATXN2L-223	ENST00000568266	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ATXN2L-223	ENST00000568266	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ATXN2L-223	ENST00000568266	WDR62	O43379	1518 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ATXN2L-223	ENST00000568266	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.2	■■■□□ 2.58
ATXN2L-223	ENST00000568266	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
ATXN2L-223	ENST00000568266	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ATXN2L-223	ENST00000568266	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.86	■■■□□ 2.53
ATXN2L-223	ENST00000568266	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.8	■■■□□ 2.52
ATXN2L-223	ENST00000568266	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.79	■■■□□ 2.52
ATXN2L-223	ENST00000568266	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.7	■■■□□ 2.51
ATXN2L-223	ENST00000568266	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.62	■■■□□ 2.49
ATXN2L-223	ENST00000568266	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.59	■■■□□ 2.49
ATXN2L-223	ENST00000568266	CUX1	P39880	1505 aa		30.56	■■■□□ 2.48
ATXN2L-223	ENST00000568266	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.53	■■■□□ 2.48
ATXN2L-223	ENST00000568266	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.49	■■■□□ 2.47
ATXN2L-223	ENST00000568266	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.47	■■■□□ 2.47
ATXN2L-223	ENST00000568266	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.46	■■■□□ 2.47
ATXN2L-223	ENST00000568266	SOGA1	O94964	1423 aa		30.45	■■■□□ 2.46
ATXN2L-223	ENST00000568266	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.4	■■■□□ 2.46	1e-10	■■■■■ 31.1
ATXN2L-223	ENST00000568266	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.32	■■■□□ 2.44
ATXN2L-223	ENST00000568266	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.31	■■■□□ 2.44
ATXN2L-223	ENST00000568266	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.28	■■■□□ 2.44
ATXN2L-223	ENST00000568266	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.25	■■■□□ 2.43
ATXN2L-223	ENST00000568266	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.23	■■■□□ 2.43
ATXN2L-223	ENST00000568266	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.22	■■■□□ 2.43
ATXN2L-223	ENST00000568266	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.22	■■■□□ 2.43
ATXN2L-223	ENST00000568266	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.19	■■■□□ 2.42
ATXN2L-223	ENST00000568266	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.17	■■■□□ 2.42
ATXN2L-223	ENST00000568266	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.12	■■■□□ 2.41
ATXN2L-223	ENST00000568266	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.12	■■■□□ 2.41
ATXN2L-223	ENST00000568266	CHD1	O14646	1710 aa		30.1	■■■□□ 2.41
ATXN2L-223	ENST00000568266	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.09	■■■□□ 2.41
ATXN2L-223	ENST00000568266	FBLN2	P98095	1184 aa		30.07	■■■□□ 2.4
ATXN2L-223	ENST00000568266	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.07	■■■□□ 2.4
ATXN2L-223	ENST00000568266	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
ATXN2L-223	ENST00000568266	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.03	■■■□□ 2.4
ATXN2L-223	ENST00000568266	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
ATXN2L-223	ENST00000568266	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.94	■■■□□ 2.38
ATXN2L-223	ENST00000568266	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ATXN2L-223	ENST00000568266	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ATXN2L-223	ENST00000568266	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ATXN2L-223	ENST00000568266	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ATXN2L-223	ENST00000568266	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ATXN2L-223	ENST00000568266	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ATXN2L-223	ENST00000568266	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.79	■■■□□ 2.36
ATXN2L-223	ENST00000568266	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.74	■■■□□ 2.35
ATXN2L-223	ENST00000568266	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.74	■■■□□ 2.35
ATXN2L-223	ENST00000568266	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ATXN2L-223	ENST00000568266	NUP160	Q12769	1436 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ATXN2L-223	ENST00000568266	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.61	■■■□□ 2.33
ATXN2L-223	ENST00000568266	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ATXN2L-223	ENST00000568266	IGF1R	P08069	1367 aa		29.57	■■■□□ 2.32
ATXN2L-223	ENST00000568266	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.57	■■■□□ 2.32
ATXN2L-223	ENST00000568266	CUL7	Q14999	1698 aa		29.47	■■■□□ 2.31
ATXN2L-223	ENST00000568266	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ATXN2L-223	ENST00000568266	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.39	■■■□□ 2.3
ATXN2L-223	ENST00000568266	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ATXN2L-223	ENST00000568266	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.37	■■■□□ 2.29

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