RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.75■■■■■ 6.2
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NME4-201ENST00000219479 SCRIBQ14160 1630 aa44.06■■■■■ 4.64
NME4-201ENST00000219479 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.88■■■■■ 4.61
NME4-201ENST00000219479 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.75■■■■■ 4.59
NME4-201ENST00000219479 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
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NME4-201ENST00000219479 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.07■■■■■ 4.33
NME4-201ENST00000219479 SMARCA4P51532 1647 aa42.02■■■■■ 4.32
NME4-201ENST00000219479 SMARCA2P51531 1590 aa41.94■■■■■ 4.3
NME4-201ENST00000219479 HMGXB3Q12766 1538 aa41.93■■■■■ 4.3
NME4-201ENST00000219479 CUX2O14529 1486 aa41.92■■■■■ 4.3
NME4-201ENST00000219479 ERCC6Q03468 1493 aa41.91■■■■■ 4.3
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NME4-201ENST00000219479 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
NME4-201ENST00000219479 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.6■■■■■ 4.25
NME4-201ENST00000219479 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.42■■■■■ 4.22
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NME4-201ENST00000219479 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.33■■■■■ 4.21
NME4-201ENST00000219479 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.17■■■■■ 4.18
NME4-201ENST00000219479 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.04■■■■■ 4.16
NME4-201ENST00000219479 WIZO95785 1651 aa40.94■■■■■ 4.15
NME4-201ENST00000219479 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.9■■■■■ 4.14
NME4-201ENST00000219479 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.75■■■■■ 4.11
NME4-201ENST00000219479 WDR62O43379 1518 aa40.68■■■■■ 4.1
NME4-201ENST00000219479 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.53■■■■■ 4.08
NME4-201ENST00000219479 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.47■■■■■ 4.07
NME4-201ENST00000219479 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
NME4-201ENST00000219479 CFTRP13569 1480 aa40.42■■■■■ 4.06
NME4-201ENST00000219479 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
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NME4-201ENST00000219479 TRIM41Q8WV44 630 aa40.15■■■■■ 4.02
NME4-201ENST00000219479 PRDM2Q13029 1718 aa40.11■■■■■ 4.01
NME4-201ENST00000219479 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.91■■■■□ 3.98
NME4-201ENST00000219479 OSCARQ8IYS5 282 aa39.89■■■■□ 3.98
NME4-201ENST00000219479 IFT140Q96RY7 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
NME4-201ENST00000219479 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
NME4-201ENST00000219479 TOPBP1Q92547 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
NME4-201ENST00000219479 ABCC8Q09428 1581 aa39.55■■■■□ 3.92
NME4-201ENST00000219479 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.55■■■■□ 3.92
NME4-201ENST00000219479 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
NME4-201ENST00000219479 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
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NME4-201ENST00000219479 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.12■■■■□ 3.85
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NME4-201ENST00000219479 FBLN2P98095 1184 aa39.01■■■■□ 3.84
NME4-201ENST00000219479 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.99■■■■□ 3.83
NME4-201ENST00000219479 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
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NME4-201ENST00000219479 WDR97A6NE52 1622 aa38.96■■■■□ 3.83
NME4-201ENST00000219479 ARAP1Q96P48 1450 aa38.96■■■■□ 3.83
NME4-201ENST00000219479 CUX1P39880 1505 aa38.94■■■■□ 3.82
NME4-201ENST00000219479 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.92■■■■□ 3.82
NME4-201ENST00000219479 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.8■■■■□ 3.8
NME4-201ENST00000219479 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
NME4-201ENST00000219479 GRIN2BQ13224 1484 aa38.75■■■■□ 3.79
NME4-201ENST00000219479 SYNJ1O43426 1573 aa38.74■■■■□ 3.79
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NME4-201ENST00000219479 PBRM1Q86U86 1689 aa38.68■■■■□ 3.78
NME4-201ENST00000219479 SYNJ2O15056 1496 aa38.66■■■■□ 3.78
NME4-201ENST00000219479 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
NME4-201ENST00000219479 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.59■■■■□ 3.77
NME4-201ENST00000219479 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.55■■■■□ 3.76
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NME4-201ENST00000219479 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.722e-6■■■□□ 15
NME4-201ENST00000219479 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.29■■■■□ 3.72
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NME4-201ENST00000219479 ADAMTS12P58397 1594 aa38.27■■■■□ 3.72
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NME4-201ENST00000219479 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.19■■■■□ 3.7
NME4-201ENST00000219479 CEP170Q5SW79 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
NME4-201ENST00000219479 NUP160Q12769 1436 aa38.16■■■■□ 3.7
NME4-201ENST00000219479 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.08■■■■□ 3.69
NME4-201ENST00000219479 SHROOM2Q13796 1616 aa38.06■■■■□ 3.68
NME4-201ENST00000219479 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.05■■■■□ 3.68
NME4-201ENST00000219479 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
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NME4-201ENST00000219479 JPH4Q96JJ6 628 aa37.68■■■■□ 3.62
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