RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448828.5

NME4-206, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,167 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-206ENST00000448828 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.96■■■■■ 6.55
NME4-206ENST00000448828 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.03■■■■■ 5.6
NME4-206ENST00000448828 ABCC9O60706 1549 aa49.6■■■■■ 5.53
NME4-206ENST00000448828 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.41■■■■■ 5.18
NME4-206ENST00000448828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.16■■■■■ 5.14
NME4-206ENST00000448828 NACADO15069 1562 aa47.15■■■■■ 5.14
NME4-206ENST00000448828 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.58■■■■■ 5.05
NME4-206ENST00000448828 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
NME4-206ENST00000448828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.31■■■■■ 5
NME4-206ENST00000448828 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.23■■■■■ 4.991e-8■■□□□ 14.2
NME4-206ENST00000448828 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.2■■■■■ 4.99
NME4-206ENST00000448828 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.92■■■■■ 4.94
NME4-206ENST00000448828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.91■■■■■ 4.94
NME4-206ENST00000448828 SCRIBQ14160 1630 aa45.72■■■■■ 4.91
NME4-206ENST00000448828 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
NME4-206ENST00000448828 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.76
NME4-206ENST00000448828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.79■■■■■ 4.76
NME4-206ENST00000448828 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.59■■■■■ 4.73
NME4-206ENST00000448828 SMARCA4P51532 1647 aa43.59■■■■■ 4.57
NME4-206ENST00000448828 NCAPD3P42695 1498 aa43.46■■■■■ 4.55
NME4-206ENST00000448828 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
NME4-206ENST00000448828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.45■■■■■ 4.55
NME4-206ENST00000448828 SMARCA2P51531 1590 aa43.41■■■■■ 4.54
NME4-206ENST00000448828 HMGXB3Q12766 1538 aa43.26■■■■■ 4.52
NME4-206ENST00000448828 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
NME4-206ENST00000448828 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.15■■■■■ 4.5
NME4-206ENST00000448828 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.08■■■■■ 4.49
NME4-206ENST00000448828 ERCC6Q03468 1493 aa42.84■■■■■ 4.45
NME4-206ENST00000448828 NESP48681 1621 aa42.71■■■■■ 4.43
NME4-206ENST00000448828 WIZO95785 1651 aa42.7■■■■■ 4.43
NME4-206ENST00000448828 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
NME4-206ENST00000448828 CUX2O14529 1486 aa42.47■■■■■ 4.39
NME4-206ENST00000448828 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
NME4-206ENST00000448828 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.22■■■■■ 4.35
NME4-206ENST00000448828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.22■■■■■ 4.35
NME4-206ENST00000448828 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.21■■■■■ 4.35
NME4-206ENST00000448828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
NME4-206ENST00000448828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
NME4-206ENST00000448828 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.85■■■■■ 4.29
NME4-206ENST00000448828 CFTRP13569 1480 aa41.83■■■■■ 4.29
NME4-206ENST00000448828 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.82■■■■■ 4.29
NME4-206ENST00000448828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.79■■■■■ 4.28
NME4-206ENST00000448828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.79■■■■■ 4.28
NME4-206ENST00000448828 WDR62O43379 1518 aa41.7■■■■■ 4.27
NME4-206ENST00000448828 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.66■■■■■ 4.26
NME4-206ENST00000448828 PRDM2Q13029 1718 aa41.55■■■■■ 4.24
NME4-206ENST00000448828 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
NME4-206ENST00000448828 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
NME4-206ENST00000448828 TOPBP1Q92547 1522 aa41.04■■■■■ 4.16
NME4-206ENST00000448828 ABCC8Q09428 1581 aa40.96■■■■■ 4.15
NME4-206ENST00000448828 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.95■■■■■ 4.15
NME4-206ENST00000448828 IFT140Q96RY7 1462 aa40.92■■■■■ 4.14
NME4-206ENST00000448828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
NME4-206ENST00000448828 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
NME4-206ENST00000448828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
NME4-206ENST00000448828 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
NME4-206ENST00000448828 OSCARQ8IYS5 282 aa40.61■■■■■ 4.09
NME4-206ENST00000448828 CUX1P39880 1505 aa40.52■■■■■ 4.08
NME4-206ENST00000448828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.51■■■■■ 4.08
NME4-206ENST00000448828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.072e-7■■■■■ 32.9
NME4-206ENST00000448828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.51■■■■■ 4.07
NME4-206ENST00000448828 SOGA1O94964 1423 aa40.48■■■■■ 4.07
NME4-206ENST00000448828 TRIM41Q8WV44 630 aa40.37■■■■■ 4.05
NME4-206ENST00000448828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
NME4-206ENST00000448828 CHD1O14646 1710 aa40.27■■■■■ 4.04
NME4-206ENST00000448828 WDR97A6NE52 1622 aa40.24■■■■■ 4.03
NME4-206ENST00000448828 FBLN2P98095 1184 aa40.23■■■■■ 4.03
NME4-206ENST00000448828 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.15■■■■■ 4.02
NME4-206ENST00000448828 GRIN2BQ13224 1484 aa40.08■■■■■ 4.01
NME4-206ENST00000448828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.08■■■■■ 4.01
NME4-206ENST00000448828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.08■■■■■ 4.01
NME4-206ENST00000448828 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.08■■■■■ 4.01
NME4-206ENST00000448828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.07■■■■■ 42e-6■■■□□ 15
NME4-206ENST00000448828 PBRM1Q86U86 1689 aa40.02■■■■■ 4
NME4-206ENST00000448828 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.02■■■■■ 4
NME4-206ENST00000448828 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.02■■■■■ 4
NME4-206ENST00000448828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
NME4-206ENST00000448828 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
NME4-206ENST00000448828 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.01■■■■■ 4
NME4-206ENST00000448828 SYNJ1O43426 1573 aa40.01■■■■□ 3.99
NME4-206ENST00000448828 ARHGEF11O15085 1522 aa40■■■■□ 3.99
NME4-206ENST00000448828 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
NME4-206ENST00000448828 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.95■■■■□ 3.99
NME4-206ENST00000448828 SYNJ2O15056 1496 aa39.88■■■■□ 3.98
NME4-206ENST00000448828 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.75■■■■□ 3.95
NME4-206ENST00000448828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.68■■■■□ 3.94
NME4-206ENST00000448828 ADAMTS12P58397 1594 aa39.64■■■■□ 3.94
NME4-206ENST00000448828 ARAP1Q96P48 1450 aa39.62■■■■□ 3.93
NME4-206ENST00000448828 GRIN2AQ12879 1464 aa39.57■■■■□ 3.93
NME4-206ENST00000448828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
NME4-206ENST00000448828 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.5■■■■□ 3.91
NME4-206ENST00000448828 CEP170Q5SW79 1584 aa39.42■■■■□ 3.9
NME4-206ENST00000448828 NUP160Q12769 1436 aa39.37■■■■□ 3.89
NME4-206ENST00000448828 KIF27Q86VH2 1401 aa39.27■■■■□ 3.88
NME4-206ENST00000448828 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.19■■■■□ 3.86
NME4-206ENST00000448828 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
NME4-206ENST00000448828 SHROOM2Q13796 1616 aa39.14■■■■□ 3.86
NME4-206ENST00000448828 CUL7Q14999 1698 aa39.13■■■■□ 3.85
NME4-206ENST00000448828 IGF1RP08069 1367 aa39.1■■■■□ 3.85
NME4-206ENST00000448828 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.08■■■■□ 3.85
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