Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-213ENST00000541953 570 ntTSL 514.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 314.2□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CDS2-205ENST00000468817 2706 ntTSL 214.14□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DDX49-207ENST00000598972 753 ntTSL 313.92□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EBP-206ENST00000498425 796 ntTSL 313.89□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-216ENST00000545663 533 ntTSL 413.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PRPF8-214ENST00000576585 2157 ntTSL 213.46□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-209ENST00000488426 1855 ntTSL 512.89□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-208ENST00000496805 742 ntTSL 512.84□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-218ENST00000496775 729 ntTSL 212.75□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DDX49-202ENST00000593361 557 ntTSL 312.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AC008575.2-201ENST00000503445 506 ntTSL 312.6□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 HDGFL2-202ENST00000589486 805 ntTSL 512.55□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 512.43□□□□□ -0.425e-10■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 512.42□□□□□ -0.425e-10■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-205ENST00000535452 533 ntTSL 412.41□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-213ENST00000480992 929 ntTSL 512.3□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-208ENST00000538933 583 ntTSL 312.14□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-206ENST00000434467 2413 ntTSL 211.91□□□□□ -0.55e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PRPF8-212ENST00000575116 460 ntTSL 311.84□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTY2D1-202ENST00000536336 2167 ntTSL 211.82□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 AC008575.2-202ENST00000506997 1643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCNL1-213ENST00000471044 753 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTBN2-206ENST00000530775 473 ntTSL 311.61□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 511.54□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-207ENST00000515755 631 ntTSL 211.53□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-202ENST00000461006 732 ntTSL 511.49□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPM4-212ENST00000590180 521 ntTSL 311.46□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 DDX49-203ENST00000594021 721 ntTSL 411.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RTCB-202ENST00000463455 628 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 411.1□□□□□ -0.636e-10■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-15■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-211ENST00000541667 671 ntTSL 410.99□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-211ENST00000473525 1430 ntTSL 510.76□□□□□ -0.695e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NCAPH-207ENST00000477409 1573 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-209ENST00000539982 570 ntTSL 410.7□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PRRC2A-209ENST00000482441 719 ntTSL 210.63□□□□□ -0.716e-9■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.715e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RBM8A-208ENST00000634130 565 ntTSL 210.54□□□□□ -0.726e-19■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NELFE-205ENST00000441998 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.47□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ZFP69-201ENST00000372705 2104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EFNA3-203ENST00000498667 776 ntTSL 210.25□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT11-213ENST00000512778 610 ntTSL 310.18□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NCAPH-204ENST00000435975 1852 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPM4-209ENST00000588483 801 ntTSL 59.95□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SPTY2D1-203ENST00000543776 543 ntTSL 49.79□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-205ENST00000478502 750 ntTSL 29.71□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CD59-213ENST00000533403 1847 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-208ENST00000442522 2188 ntTSL 59.55□□□□□ -0.885e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CDS2-201ENST00000379070 2713 ntTSL 29.39□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 SEPT8-202ENST00000371478 737 ntTSL 39.38□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CLSTN3-203ENST00000534830 547 ntTSL 49.36□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CD59-208ENST00000527577 686 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-210ENST00000460838 744 ntTSL 39.26□□□□□ -0.935e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PLEKHG4-210ENST00000565773 542 ntTSL 49.12□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 CCDC66-207ENST00000439445 709 ntTSL 39.1□□□□□ -0.955e-13■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 STT3A-203ENST00000525431 552 ntTSL 49.02□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 EBP-204ENST00000466461 694 ntTSL 28.99□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -15e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 ARHGEF12-206ENST00000528225 2647 ntTSL 58.74□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 PEF1-203ENST00000471219 401 ntTSL 38.61□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 NCAPH-202ENST00000427946 2363 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.065e-7■■■■■ 36.5
EFTUD2Q15029 TPT1-207ENST00000490277 1851 ntTSL 28.32□□□□□ -1.081e-15■■■■■ 36.5
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