RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.55■■■□□ 2.32
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3-211ENST00000541667 ABCC9O60706 1549 aa26.29■■□□□ 1.8
CLSTN3-211ENST00000541667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3-211ENST00000541667 NACADO15069 1562 aa24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3-211ENST00000541667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.71■■□□□ 1.55
CLSTN3-211ENST00000541667 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CLSTN3-211ENST00000541667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.49■■□□□ 1.51
CLSTN3-211ENST00000541667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 SCRIBQ14160 1630 aa24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.74■■□□□ 1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.66■■□□□ 1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 NCAPD3P42695 1498 aa23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3-211ENST00000541667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.02■■□□□ 1.28
CLSTN3-211ENST00000541667 SMARCA4P51532 1647 aa22.97■■□□□ 1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SMARCA2P51531 1590 aa22.88■■□□□ 1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 HMGXB3Q12766 1538 aa22.83■■□□□ 1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.79■■□□□ 1.24
CLSTN3-211ENST00000541667 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.79■■□□□ 1.24
CLSTN3-211ENST00000541667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CLSTN3-211ENST00000541667 NESP48681 1621 aa22.66■■□□□ 1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 ERCC6Q03468 1493 aa22.6■■□□□ 1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 CUX2O14529 1486 aa22.56■■□□□ 1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.51■■□□□ 1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 WIZO95785 1651 aa22.48■■□□□ 1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.45■■□□□ 1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.38■■□□□ 1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.33■■□□□ 1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.29■■□□□ 1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 CFTRP13569 1480 aa22.15■■□□□ 1.14
CLSTN3-211ENST00000541667 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.12■■□□□ 1.13
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR62O43379 1518 aa22.08■■□□□ 1.13
CLSTN3-211ENST00000541667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.08■■□□□ 1.12
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.04■■□□□ 1.12
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC88BA6NC98 1476 aa22■■□□□ 1.11
CLSTN3-211ENST00000541667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 PRDM2Q13029 1718 aa21.79■■□□□ 1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TOPBP1Q92547 1522 aa21.69■■□□□ 1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 IFT140Q96RY7 1462 aa21.63■■□□□ 1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 OSCARQ8IYS5 282 aa21.62■■□□□ 1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 ABCC8Q09428 1581 aa21.61■■□□□ 1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.57■■□□□ 1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM41Q8WV44 630 aa21.48■■□□□ 1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 35
CLSTN3-211ENST00000541667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLSTN3-211ENST00000541667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 SOGA1O94964 1423 aa21.39■■□□□ 1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 CUX1P39880 1505 aa21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.34■■□□□ 1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
CLSTN3-211ENST00000541667 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
CLSTN3-211ENST00000541667 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
CLSTN3-211ENST00000541667 CHD1O14646 1710 aa21.24■□□□□ 0.99
CLSTN3-211ENST00000541667 FBLN2P98095 1184 aa21.23■□□□□ 0.99
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGEF11O15085 1522 aa21.23■□□□□ 0.99
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR97A6NE52 1622 aa21.2■□□□□ 0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.19■□□□□ 0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 GRIN2BQ13224 1484 aa21.15■□□□□ 0.98
CLSTN3-211ENST00000541667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.13■□□□□ 0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.12■□□□□ 0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.11■□□□□ 0.97
CLSTN3-211ENST00000541667 SYNJ2O15056 1496 aa21.07■□□□□ 0.96
CLSTN3-211ENST00000541667 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.06■□□□□ 0.96
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CLSTN3-211ENST00000541667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.05■□□□□ 0.96
CLSTN3-211ENST00000541667 ARAP1Q96P48 1450 aa21.05■□□□□ 0.96
CLSTN3-211ENST00000541667 TOP2BQ02880 1626 aa21.04■□□□□ 0.96
CLSTN3-211ENST00000541667 SYNJ1O43426 1573 aa21.03■□□□□ 0.96
CLSTN3-211ENST00000541667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.02■□□□□ 0.96
CLSTN3-211ENST00000541667 PBRM1Q86U86 1689 aa21.02■□□□□ 0.95
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CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTS12P58397 1594 aa20.86■□□□□ 0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.86■□□□□ 0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 NUP160Q12769 1436 aa20.86■□□□□ 0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.83■□□□□ 0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP170Q5SW79 1584 aa20.81■□□□□ 0.92
CLSTN3-211ENST00000541667 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.78■□□□□ 0.92
CLSTN3-211ENST00000541667 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CLSTN3-211ENST00000541667 IGF1RP08069 1367 aa20.72■□□□□ 0.91
CLSTN3-211ENST00000541667 SHROOM2Q13796 1616 aa20.71■□□□□ 0.91
CLSTN3-211ENST00000541667 JPH4Q96JJ6 628 aa20.68■□□□□ 0.9
CLSTN3-211ENST00000541667 KIF27Q86VH2 1401 aa20.63■□□□□ 0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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