RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.08■■■□□ 2.89
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NOP56-204ENST00000460258 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.91■■■□□ 2.54
NOP56-204ENST00000460258 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.28■■■□□ 2.44
NOP56-204ENST00000460258 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.49■■■□□ 2.31
NOP56-204ENST00000460258 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.36■■■□□ 2.29
NOP56-204ENST00000460258 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
NOP56-204ENST00000460258 NACADO15069 1562 aa28.95■■■□□ 2.22
NOP56-204ENST00000460258 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.86■■■□□ 2.21
NOP56-204ENST00000460258 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.7■■■□□ 2.18
NOP56-204ENST00000460258 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.64■■■□□ 2.17
NOP56-204ENST00000460258 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.56■■■□□ 2.16
NOP56-204ENST00000460258 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.51■■■□□ 2.15
NOP56-204ENST00000460258 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.12■■■□□ 2.09
NOP56-204ENST00000460258 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
NOP56-204ENST00000460258 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.07■■■□□ 2.08
NOP56-204ENST00000460258 CUX2O14529 1486 aa27.8■■■□□ 2.04
NOP56-204ENST00000460258 TRIM41Q8WV44 630 aa27.54■■■□□ 2
NOP56-204ENST00000460258 SCRIBQ14160 1630 aa27.53■■■□□ 2
NOP56-204ENST00000460258 ERCC6Q03468 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
NOP56-204ENST00000460258 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.21■■□□□ 1.95
NOP56-204ENST00000460258 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NOP56-204ENST00000460258 NESP48681 1621 aa26.79■■□□□ 1.88
NOP56-204ENST00000460258 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
NOP56-204ENST00000460258 NCAPD3P42695 1498 aa26.74■■□□□ 1.87
NOP56-204ENST00000460258 SMARCA2P51531 1590 aa26.52■■□□□ 1.84
NOP56-204ENST00000460258 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.48■■□□□ 1.83
NOP56-204ENST00000460258 HMGXB3Q12766 1538 aa26.41■■□□□ 1.82
NOP56-204ENST00000460258 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.41■■□□□ 1.82
NOP56-204ENST00000460258 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
NOP56-204ENST00000460258 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.36■■□□□ 1.81
NOP56-204ENST00000460258 OSCARQ8IYS5 282 aa26.32■■□□□ 1.8
NOP56-204ENST00000460258 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
NOP56-204ENST00000460258 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NOP56-204ENST00000460258 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NOP56-204ENST00000460258 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.14■■□□□ 1.78
NOP56-204ENST00000460258 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.14■■□□□ 1.78
NOP56-204ENST00000460258 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.14■■□□□ 1.78
NOP56-204ENST00000460258 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.11■■□□□ 1.77
NOP56-204ENST00000460258 SMARCA4P51532 1647 aa26.11■■□□□ 1.77
NOP56-204ENST00000460258 WDR62O43379 1518 aa26.09■■□□□ 1.77
NOP56-204ENST00000460258 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
NOP56-204ENST00000460258 ARHGEF11O15085 1522 aa25.91■■□□□ 1.74
NOP56-204ENST00000460258 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.87■■□□□ 1.73
NOP56-204ENST00000460258 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.85■■□□□ 1.73
NOP56-204ENST00000460258 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.82■■□□□ 1.72
NOP56-204ENST00000460258 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.73■■□□□ 1.71
NOP56-204ENST00000460258 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.59■■□□□ 1.69
NOP56-204ENST00000460258 ARAP1Q96P48 1450 aa25.56■■□□□ 1.68
NOP56-204ENST00000460258 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.49■■□□□ 1.67
NOP56-204ENST00000460258 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NOP56-204ENST00000460258 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
NOP56-204ENST00000460258 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NOP56-204ENST00000460258 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NOP56-204ENST00000460258 CFTRP13569 1480 aa25.28■■□□□ 1.64
NOP56-204ENST00000460258 IFT140Q96RY7 1462 aa25.27■■□□□ 1.64
NOP56-204ENST00000460258 CHD1O14646 1710 aa25.26■■□□□ 1.63
NOP56-204ENST00000460258 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NOP56-204ENST00000460258 WIZO95785 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
NOP56-204ENST00000460258 FBLN2P98095 1184 aa25.11■■□□□ 1.61
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NOP56-204ENST00000460258 TOPBP1Q92547 1522 aa24.95■■□□□ 1.58
NOP56-204ENST00000460258 PRDM2Q13029 1718 aa24.94■■□□□ 1.58
NOP56-204ENST00000460258 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
NOP56-204ENST00000460258 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NOP56-204ENST00000460258 ABCC8Q09428 1581 aa24.78■■□□□ 1.56
NOP56-204ENST00000460258 SYNJ1O43426 1573 aa24.77■■□□□ 1.56
NOP56-204ENST00000460258 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.77■■□□□ 1.56
NOP56-204ENST00000460258 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.73■■□□□ 1.55
NOP56-204ENST00000460258 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.69■■□□□ 1.54
NOP56-204ENST00000460258 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NOP56-204ENST00000460258 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
NOP56-204ENST00000460258 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.68■■□□□ 1.54
NOP56-204ENST00000460258 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NOP56-204ENST00000460258 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
NOP56-204ENST00000460258 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.61■■□□□ 1.53
NOP56-204ENST00000460258 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.56■■□□□ 1.52
NOP56-204ENST00000460258 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
NOP56-204ENST00000460258 SYNJ2O15056 1496 aa24.49■■□□□ 1.51
NOP56-204ENST00000460258 SOGA1O94964 1423 aa24.47■■□□□ 1.51
NOP56-204ENST00000460258 WDR97A6NE52 1622 aa24.46■■□□□ 1.51
NOP56-204ENST00000460258 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.45■■□□□ 1.5
NOP56-204ENST00000460258 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.44■■□□□ 1.5
NOP56-204ENST00000460258 GRIN2BQ13224 1484 aa24.4■■□□□ 1.5
NOP56-204ENST00000460258 KDM6BO15054 1643 aa24.32■■□□□ 1.48
NOP56-204ENST00000460258 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.32■■□□□ 1.48
NOP56-204ENST00000460258 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.28■■□□□ 1.48
NOP56-204ENST00000460258 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
NOP56-204ENST00000460258 CEP170Q5SW79 1584 aa24.26■■□□□ 1.47
NOP56-204ENST00000460258 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.26■■□□□ 1.47
NOP56-204ENST00000460258 FBXO41Q8TF61 875 aa24.25■■□□□ 1.47
NOP56-204ENST00000460258 PBRM1Q86U86 1689 aa24.24■■□□□ 1.47
NOP56-204ENST00000460258 ADGRL1O94910 1474 aa24.16■■□□□ 1.46
NOP56-204ENST00000460258 DIP2BQ9P265 1576 aa24.16■■□□□ 1.46
NOP56-204ENST00000460258 SHROOM2Q13796 1616 aa24.12■■□□□ 1.45
NOP56-204ENST00000460258 TSPOAP1O95153 1857 aa24.11■■□□□ 1.45
NOP56-204ENST00000460258 GRIN2AQ12879 1464 aa24.1■■□□□ 1.45
NOP56-204ENST00000460258 MAPKBP1O60336 1514 aa24.09■■□□□ 1.45
NOP56-204ENST00000460258 NUP160Q12769 1436 aa24.07■■□□□ 1.44
NOP56-204ENST00000460258 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
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