RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494697.5

NOP56-217, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene NOP56, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-217ENST00000494697 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.5■■■□□ 2.79
NOP56-217ENST00000494697 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.05■■■□□ 2.24
NOP56-217ENST00000494697 ABCC9O60706 1549 aa28.54■■■□□ 2.16
NOP56-217ENST00000494697 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.36■■□□□ 1.97
NOP56-217ENST00000494697 NACADO15069 1562 aa27.27■■□□□ 1.96
NOP56-217ENST00000494697 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
NOP56-217ENST00000494697 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.07■■□□□ 1.92
NOP56-217ENST00000494697 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.95■■□□□ 1.9
NOP56-217ENST00000494697 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.89■■□□□ 1.89
NOP56-217ENST00000494697 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.88■■□□□ 1.89
NOP56-217ENST00000494697 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.66■■□□□ 1.86
NOP56-217ENST00000494697 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
NOP56-217ENST00000494697 SCRIBQ14160 1630 aa26.48■■□□□ 1.83
NOP56-217ENST00000494697 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.37■■□□□ 1.81
NOP56-217ENST00000494697 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.28■■□□□ 1.8
NOP56-217ENST00000494697 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NOP56-217ENST00000494697 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.85■■□□□ 1.73
NOP56-217ENST00000494697 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.66■■□□□ 1.7
NOP56-217ENST00000494697 SMARCA4P51532 1647 aa25.31■■□□□ 1.64
NOP56-217ENST00000494697 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NOP56-217ENST00000494697 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
NOP56-217ENST00000494697 NCAPD3P42695 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
NOP56-217ENST00000494697 SMARCA2P51531 1590 aa25.1■■□□□ 1.61
NOP56-217ENST00000494697 HMGXB3Q12766 1538 aa25.09■■□□□ 1.61
NOP56-217ENST00000494697 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.08■■□□□ 1.61
NOP56-217ENST00000494697 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.08■■□□□ 1.61
NOP56-217ENST00000494697 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NOP56-217ENST00000494697 WIZO95785 1651 aa24.81■■□□□ 1.56
NOP56-217ENST00000494697 NESP48681 1621 aa24.68■■□□□ 1.54
NOP56-217ENST00000494697 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NOP56-217ENST00000494697 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.55■■□□□ 1.52
NOP56-217ENST00000494697 ERCC6Q03468 1493 aa24.55■■□□□ 1.52
NOP56-217ENST00000494697 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NOP56-217ENST00000494697 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NOP56-217ENST00000494697 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.43■■□□□ 1.5
NOP56-217ENST00000494697 CUX2O14529 1486 aa24.42■■□□□ 1.5
NOP56-217ENST00000494697 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.37■■□□□ 1.49
NOP56-217ENST00000494697 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.29■■□□□ 1.48
NOP56-217ENST00000494697 CFTRP13569 1480 aa24.25■■□□□ 1.47
NOP56-217ENST00000494697 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.18■■□□□ 1.46
NOP56-217ENST00000494697 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.16■■□□□ 1.46
NOP56-217ENST00000494697 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
NOP56-217ENST00000494697 WDR62O43379 1518 aa24.15■■□□□ 1.46
NOP56-217ENST00000494697 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.14■■□□□ 1.46
NOP56-217ENST00000494697 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.13■■□□□ 1.45
NOP56-217ENST00000494697 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
NOP56-217ENST00000494697 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.81■■□□□ 1.4
NOP56-217ENST00000494697 TOPBP1Q92547 1522 aa23.76■■□□□ 1.39
NOP56-217ENST00000494697 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.74■■□□□ 1.39
NOP56-217ENST00000494697 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
NOP56-217ENST00000494697 ABCC8Q09428 1581 aa23.63■■□□□ 1.37
NOP56-217ENST00000494697 IFT140Q96RY7 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
NOP56-217ENST00000494697 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
NOP56-217ENST00000494697 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
NOP56-217ENST00000494697 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
NOP56-217ENST00000494697 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NOP56-217ENST00000494697 CUX1P39880 1505 aa23.54■■□□□ 1.36
NOP56-217ENST00000494697 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.46■■□□□ 1.35
NOP56-217ENST00000494697 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.43■■□□□ 1.34
NOP56-217ENST00000494697 WDR97A6NE52 1622 aa23.41■■□□□ 1.34
NOP56-217ENST00000494697 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.331e-12■■■■■ 34.4
NOP56-217ENST00000494697 SOGA1O94964 1423 aa23.34■■□□□ 1.33
NOP56-217ENST00000494697 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
NOP56-217ENST00000494697 SYNJ1O43426 1573 aa23.31■■□□□ 1.32
NOP56-217ENST00000494697 CHD1O14646 1710 aa23.28■■□□□ 1.32
NOP56-217ENST00000494697 TOP2BQ02880 1626 aa23.28■■□□□ 1.32
NOP56-217ENST00000494697 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NOP56-217ENST00000494697 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.23■■□□□ 1.31
NOP56-217ENST00000494697 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
NOP56-217ENST00000494697 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.22■■□□□ 1.31
NOP56-217ENST00000494697 PBRM1Q86U86 1689 aa23.2■■□□□ 1.3
NOP56-217ENST00000494697 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.2■■□□□ 1.3
NOP56-217ENST00000494697 OSCARQ8IYS5 282 aa23.19■■□□□ 1.3
NOP56-217ENST00000494697 GRIN2BQ13224 1484 aa23.15■■□□□ 1.3
NOP56-217ENST00000494697 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
NOP56-217ENST00000494697 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.11■■□□□ 1.29
NOP56-217ENST00000494697 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.08■■□□□ 1.29
NOP56-217ENST00000494697 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.08■■□□□ 1.29
NOP56-217ENST00000494697 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.08■■□□□ 1.29
NOP56-217ENST00000494697 SYNJ2O15056 1496 aa23.04■■□□□ 1.28
NOP56-217ENST00000494697 ARHGEF11O15085 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-217ENST00000494697 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-217ENST00000494697 ADAMTS12P58397 1594 aa23.01■■□□□ 1.27
NOP56-217ENST00000494697 FBLN2P98095 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-217ENST00000494697 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.92■■□□□ 1.26
NOP56-217ENST00000494697 TRIM41Q8WV44 630 aa22.9■■□□□ 1.26
NOP56-217ENST00000494697 GRIN2AQ12879 1464 aa22.89■■□□□ 1.25
NOP56-217ENST00000494697 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NOP56-217ENST00000494697 ARAP1Q96P48 1450 aa22.86■■□□□ 1.25
NOP56-217ENST00000494697 CEP170Q5SW79 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
NOP56-217ENST00000494697 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.83■■□□□ 1.25
NOP56-217ENST00000494697 NUP160Q12769 1436 aa22.81■■□□□ 1.24
NOP56-217ENST00000494697 SHROOM2Q13796 1616 aa22.73■■□□□ 1.23
NOP56-217ENST00000494697 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.72■■□□□ 1.23
NOP56-217ENST00000494697 KIF27Q86VH2 1401 aa22.71■■□□□ 1.23
NOP56-217ENST00000494697 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.71■■□□□ 1.23
NOP56-217ENST00000494697 CUL7Q14999 1698 aa22.71■■□□□ 1.23
NOP56-217ENST00000494697 IGF1RP08069 1367 aa22.65■■□□□ 1.22
NOP56-217ENST00000494697 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-217ENST00000494697 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms