Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.144e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 SLC20A1-207ENST00000490674 3202 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 26.1
WDR43Q15061 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 322.22■■□□□ 1.153e-22■■■■□ 26
WDR43Q15061 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.274e-10■■■■□ 26
WDR43Q15061 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC13.52□□□□□ -0.254e-10■■■■□ 26
WDR43Q15061 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.29□□□□□ -1.564e-10■■■■□ 26
WDR43Q15061 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.768e-8■■■■□ 26
WDR43Q15061 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.318e-8■■■■□ 26
WDR43Q15061 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.228e-8■■■■□ 26
WDR43Q15061 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 521.85■■□□□ 1.098e-8■■■■□ 26
WDR43Q15061 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 517.42■□□□□ 0.388e-8■■■■□ 26
WDR43Q15061 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 322.25■■□□□ 1.159e-7■■■■□ 25.9
WDR43Q15061 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 219.16■□□□□ 0.669e-7■■■■□ 25.9
WDR43Q15061 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.781e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)23.71■■□□□ 1.391e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 421.57■■□□□ 1.041e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 417.69■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 212.24□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 38.57□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.884e-10■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.444e-10■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-10■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 513.05□□□□□ -0.326e-11■■■■□ 25.6
WDR43Q15061 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 13e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 220.4■□□□□ 0.863e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-213ENST00000489003 976 ntTSL 220.15■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-216ENST00000491013 912 ntTSL 519.42■□□□□ 0.73e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.683e-7■■■■□ 25.4
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WDR43Q15061 FDPS-204ENST00000461507 1022 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-217ENST00000492244 673 ntTSL 315.36■□□□□ 0.053e-7■■■■□ 25.4
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WDR43Q15061 FDPS-209ENST00000471117 630 ntTSL 311.1□□□□□ -0.633e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 FDPS-218ENST00000492887 554 ntTSL 210.79□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 25.4
WDR43Q15061 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.15e-6■■■■□ 25.3
WDR43Q15061 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-8■■■■□ 25.3
WDR43Q15061 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-8■■■■□ 25.3
WDR43Q15061 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 417.57■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 25
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WDR43Q15061 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 25
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WDR43Q15061 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 232.39■■■□□ 2.783e-7■■■■□ 24.7
WDR43Q15061 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 231.14■■■□□ 2.583e-7■■■■□ 24.7
WDR43Q15061 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.223e-7■■■■□ 24.7
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WDR43Q15061 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.773e-7■■■■□ 24.7
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WDR43Q15061 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 PSME2-204ENST00000558931 2754 ntTSL 518.97■□□□□ 0.631e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.521e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 FANCA-226ENST00000567879 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 318■□□□□ 0.471e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 FRAS1-202ENST00000502446 2217 ntTSL 516.92■□□□□ 0.31e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.261e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 316.48■□□□□ 0.231e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 FRAS1-203ENST00000508900 2169 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.231e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.211e-5■■■■□ 24.6
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WDR43Q15061 ERBB2-206ENST00000578373 4523 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.171e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.151e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 LAMB2-216ENST00000494831 582 ntTSL 215.9■□□□□ 0.141e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 FANCA-215ENST00000564475 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.71■□□□□ 0.111e-5■■■■□ 24.6
WDR43Q15061 PSME2-214ENST00000560592 760 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-5■■■■□ 24.6
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