RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486234.1

AUP1-208, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene AUP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-208ENST00000486234 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.14■■■□□ 2.58
AUP1-208ENST00000486234 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.49■■□□□ 1.99
AUP1-208ENST00000486234 ABCC9O60706 1549 aa26.66■■□□□ 1.86
AUP1-208ENST00000486234 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
AUP1-208ENST00000486234 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.94■■□□□ 1.74
AUP1-208ENST00000486234 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.9■■□□□ 1.74
AUP1-208ENST00000486234 NACADO15069 1562 aa25.9■■□□□ 1.74
AUP1-208ENST00000486234 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.85■■□□□ 1.73
AUP1-208ENST00000486234 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.82■■□□□ 1.72
AUP1-208ENST00000486234 SCRIBQ14160 1630 aa25.04■■□□□ 1.6
AUP1-208ENST00000486234 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.593e-7■■□□□ 14.5
AUP1-208ENST00000486234 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.97■■□□□ 1.59
AUP1-208ENST00000486234 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.93■■□□□ 1.58
AUP1-208ENST00000486234 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.91■■□□□ 1.58
AUP1-208ENST00000486234 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
AUP1-208ENST00000486234 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.26■■□□□ 1.47
AUP1-208ENST00000486234 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.17■■□□□ 1.46
AUP1-208ENST00000486234 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
AUP1-208ENST00000486234 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.1■■□□□ 1.45
AUP1-208ENST00000486234 SMARCA4P51532 1647 aa24.03■■□□□ 1.44
AUP1-208ENST00000486234 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.95■■□□□ 1.42
AUP1-208ENST00000486234 NCAPD3P42695 1498 aa23.94■■□□□ 1.42
AUP1-208ENST00000486234 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.94■■□□□ 1.42
AUP1-208ENST00000486234 SMARCA2P51531 1590 aa23.92■■□□□ 1.42
AUP1-208ENST00000486234 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.86■■□□□ 1.41
AUP1-208ENST00000486234 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
AUP1-208ENST00000486234 HMGXB3Q12766 1538 aa23.77■■□□□ 1.4
AUP1-208ENST00000486234 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
AUP1-208ENST00000486234 WIZO95785 1651 aa23.62■■□□□ 1.37
AUP1-208ENST00000486234 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AUP1-208ENST00000486234 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
AUP1-208ENST00000486234 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.27■■□□□ 1.31
AUP1-208ENST00000486234 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-208ENST00000486234 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.18■■□□□ 1.3
AUP1-208ENST00000486234 CFTRP13569 1480 aa23.14■■□□□ 1.29
AUP1-208ENST00000486234 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.12■■□□□ 1.29
AUP1-208ENST00000486234 NESP48681 1621 aa23.11■■□□□ 1.29
AUP1-208ENST00000486234 ERCC6Q03468 1493 aa23.03■■□□□ 1.28
AUP1-208ENST00000486234 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.92■■□□□ 1.26
AUP1-208ENST00000486234 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.86■■□□□ 1.25
AUP1-208ENST00000486234 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.79■■□□□ 1.24
AUP1-208ENST00000486234 PRDM2Q13029 1718 aa22.75■■□□□ 1.23
AUP1-208ENST00000486234 CUX2O14529 1486 aa22.74■■□□□ 1.23
AUP1-208ENST00000486234 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.74■■□□□ 1.23
AUP1-208ENST00000486234 ABCC8Q09428 1581 aa22.7■■□□□ 1.22
AUP1-208ENST00000486234 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
AUP1-208ENST00000486234 WDR62O43379 1518 aa22.67■■□□□ 1.22
AUP1-208ENST00000486234 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
AUP1-208ENST00000486234 TOPBP1Q92547 1522 aa22.57■■□□□ 1.2
AUP1-208ENST00000486234 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.55■■□□□ 1.2
AUP1-208ENST00000486234 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
AUP1-208ENST00000486234 CUX1P39880 1505 aa22.45■■□□□ 1.18
AUP1-208ENST00000486234 IFT140Q96RY7 1462 aa22.42■■□□□ 1.18
AUP1-208ENST00000486234 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
AUP1-208ENST00000486234 SOGA1O94964 1423 aa22.37■■□□□ 1.17
AUP1-208ENST00000486234 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.35■■□□□ 1.17
AUP1-208ENST00000486234 TOP2BQ02880 1626 aa22.34■■□□□ 1.17
AUP1-208ENST00000486234 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.28■■□□□ 1.16
AUP1-208ENST00000486234 SYNJ1O43426 1573 aa22.28■■□□□ 1.16
AUP1-208ENST00000486234 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.26■■□□□ 1.15
AUP1-208ENST00000486234 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
AUP1-208ENST00000486234 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
AUP1-208ENST00000486234 TRIM41Q8WV44 630 aa22.19■■□□□ 1.14
AUP1-208ENST00000486234 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
AUP1-208ENST00000486234 WDR97A6NE52 1622 aa22.19■■□□□ 1.14
AUP1-208ENST00000486234 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AUP1-208ENST00000486234 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.132e-23■■■■■ 48.7
AUP1-208ENST00000486234 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
AUP1-208ENST00000486234 GRIN2BQ13224 1484 aa22.07■■□□□ 1.12
AUP1-208ENST00000486234 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AUP1-208ENST00000486234 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.05■■□□□ 1.12
AUP1-208ENST00000486234 KIF27Q86VH2 1401 aa22.05■■□□□ 1.12
AUP1-208ENST00000486234 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.99■■□□□ 1.11
AUP1-208ENST00000486234 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
AUP1-208ENST00000486234 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.95■■□□□ 1.1
AUP1-208ENST00000486234 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.93■■□□□ 1.1
AUP1-208ENST00000486234 IGF1RP08069 1367 aa21.92■■□□□ 1.1
AUP1-208ENST00000486234 OSCARQ8IYS5 282 aa21.91■■□□□ 1.1
AUP1-208ENST00000486234 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
AUP1-208ENST00000486234 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.89■■□□□ 1.09
AUP1-208ENST00000486234 SYNJ2O15056 1496 aa21.88■■□□□ 1.09
AUP1-208ENST00000486234 FBLN2P98095 1184 aa21.87■■□□□ 1.09
AUP1-208ENST00000486234 EEA1Q15075 1411 aa21.85■■□□□ 1.09
AUP1-208ENST00000486234 PBRM1Q86U86 1689 aa21.83■■□□□ 1.09
AUP1-208ENST00000486234 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
AUP1-208ENST00000486234 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.79■■□□□ 1.08
AUP1-208ENST00000486234 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-208ENST00000486234 ADAMTS12P58397 1594 aa21.77■■□□□ 1.08
AUP1-208ENST00000486234 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.76■■□□□ 1.07
AUP1-208ENST00000486234 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.75■■□□□ 1.07
AUP1-208ENST00000486234 GRIN2AQ12879 1464 aa21.74■■□□□ 1.07
AUP1-208ENST00000486234 CUL7Q14999 1698 aa21.73■■□□□ 1.07
AUP1-208ENST00000486234 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.67■■□□□ 1.06
AUP1-208ENST00000486234 NUP160Q12769 1436 aa21.67■■□□□ 1.06
AUP1-208ENST00000486234 PRXQ9BXM0 1461 aa21.65■■□□□ 1.06
AUP1-208ENST00000486234 CHD1O14646 1710 aa21.65■■□□□ 1.06
AUP1-208ENST00000486234 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
AUP1-208ENST00000486234 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.56■■□□□ 1.04
AUP1-208ENST00000486234 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.55■■□□□ 1.04
AUP1-208ENST00000486234 CEP170Q5SW79 1584 aa21.53■■□□□ 1.04
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