Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-139■■■■■ 890.4
WDR43Q15061 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.543e-34■■■■■ 689.1
WDR43Q15061 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt14.88□□□□□ -0.033e-34■■■■■ 689.1
WDR43Q15061 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt14.76□□□□□ -0.053e-34■■■■■ 689.1
WDR43Q15061 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.34■□□□□ 0.531e-32■■■■■ 257.9
WDR43Q15061 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC14.88□□□□□ -0.031e-32■■■■■ 257.9
WDR43Q15061 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.051e-32■■■■■ 257.9
WDR43Q15061 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)27.28■■□□□ 1.961e-323■■■■■ 131.2
WDR43Q15061 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-323■■■■■ 131.2
WDR43Q15061 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.2■■■□□ 2.915e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)28.99■■■□□ 2.235e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 225.41■■□□□ 1.665e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 224.29■■□□□ 1.485e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.425e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 223.22■■□□□ 1.315e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.145e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.935e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.35e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.265e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 312.09□□□□□ -0.475e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 512.09□□□□□ -0.475e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 310.6□□□□□ -0.715e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 43.04□□□□□ -1.925e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 50.83□□□□□ -2.285e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.52□□□□□ -2.335e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.385e-20■■■■■ 85.2
WDR43Q15061 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.674e-9■■■■■ 77.9
WDR43Q15061 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.534e-9■■■■■ 77.9
WDR43Q15061 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)23.59■■□□□ 1.374e-9■■■■■ 77.9
WDR43Q15061 ERCC2-210ENST00000587376 817 ntTSL 520.29■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 77.9
WDR43Q15061 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 77.9
WDR43Q15061 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.623e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.623e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.153e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.873e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 519.81■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 212.46□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 70.1
WDR43Q15061 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 228.56■■■□□ 2.162e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)25.55■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 222.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 518.78■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 415.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 214.11□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 62.3
WDR43Q15061 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 219.11■□□□□ 0.651e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 PRH1-202ENST00000536086 554 ntTSL 53.19□□□□□ -1.91e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 PRR4-214ENST00000546317 281 ntTSL 51.22□□□□□ -2.211e-9■■■■■ 59.8
WDR43Q15061 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 537.17■■■■□ 3.547e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 231.39■■■□□ 2.627e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 531.37■■■□□ 2.617e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 231.09■■■□□ 2.577e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)29.57■■■□□ 2.327e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.457e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.237e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.077e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.957e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 27.42□□□□□ -1.227e-25■■■■■ 56.8
WDR43Q15061 SGSM3-207ENST00000469719 1029 ntTSL 520.78■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 SGSM3-202ENST00000417424 666 ntTSL 519.83■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.455e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.345e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 516.2■□□□□ 0.185e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 215.99■□□□□ 0.155e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.635e-9■■■■■ 55.5
WDR43Q15061 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 55.3
WDR43Q15061 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.52e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.342e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ARFIP2-207ENST00000529847 920 ntTSL 228.67■■■□□ 2.182e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.052e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 22e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 226.25■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ARFIP2-208ENST00000530410 971 ntTSL 225.29■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 222.94■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 54.5
WDR43Q15061 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 222.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 54.5
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 30.5 ms