Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.221e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 BCAR1-210ENST00000561970 594 ntTSL 430.51■■■□□ 2.473e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SPIRE2-206ENST00000564878 663 ntTSL 318.63■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 CCND1-206ENST00000545484 430 ntTSL 522.29■■□□□ 1.162e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 413.86□□□□□ -0.191e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 FOXK2-204ENST00000527313 779 ntTSL 320.91■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 FOXK2-207ENST00000570585 756 ntTSL 314.23□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.542e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 BCAR1-219ENST00000567215 581 ntTSL 414.62□□□□□ -0.075e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 CSNK1G2-205ENST00000589385 896 ntTSL 519.13■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.771e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 BIVM-206ENST00000491929 674 ntTSL 323.74■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.68■■□□□ 1.223e-12■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TTC39B-204ENST00000505732 1881 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.151e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SH3GL1-205ENST00000598230 577 ntTSL 519.3■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 218.9■□□□□ 0.621e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 218.82■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.583e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-208ENST00000587747 1898 ntTSL 517.61■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.343e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 416.89■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-204ENST00000536343 1575 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.073e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.013e-12■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SH3GL1-203ENST00000593591 1036 ntTSL 414.67□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 514.51□□□□□ -0.093e-12■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.133e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 LINC00242-201ENST00000437615 2418 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TTC39B-205ENST00000506891 900 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 AC131212.2-201ENST00000622917 1355 ntBASIC11.93□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.621e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 410.99□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-206ENST00000417540 525 ntTSL 410.53□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-216ENST00000428482 1096 ntTSL 510.53□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-205ENST00000413241 581 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-230ENST00000462130 464 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 510.06□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.861e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.971e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.091e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 38.18□□□□□ -1.11e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-12■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 36.08□□□□□ -1.441e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 321.11■□□□□ 0.971e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 319.14■□□□□ 0.651e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 514.79□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 414.78□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.894e-9■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.113e-6■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.768e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.248e-7■■□□□ 14
SLTMQ9NWH9 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-8■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.53e-8■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 PPP2R3B-203ENST00000445792 1998 ntTSL 227.68■■■□□ 2.022e-6■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 RASGRP2-220ENST00000480443 546 ntTSL 424.73■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.542e-6■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 RASGRP2-213ENST00000421556 2168 ntTSL 224.32■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 RASGRP2-214ENST00000430645 598 ntTSL 424.31■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 13.9
SLTMQ9NWH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.362e-6■■□□□ 13.9
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