RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491929.1

BIVM-206, Transcript of basic, immunoglobulin-like variable motif containing, humanhuman

TSL 3

Gene BIVM, Length 674 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-206ENST00000491929 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.33■■■■■ 6.61
BIVM-206ENST00000491929 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.37■■■■■ 5.65
BIVM-206ENST00000491929 ABCC9O60706 1549 aa49.83■■■■■ 5.57
BIVM-206ENST00000491929 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.5■■■■■ 5.19
BIVM-206ENST00000491929 NACADO15069 1562 aa47.26■■■■■ 5.16
BIVM-206ENST00000491929 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.08■■■■■ 5.13
BIVM-206ENST00000491929 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
BIVM-206ENST00000491929 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
BIVM-206ENST00000491929 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.69■■■■■ 5.07
BIVM-206ENST00000491929 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.66■■■■■ 5.06
BIVM-206ENST00000491929 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.53■■■■■ 5.04
BIVM-206ENST00000491929 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.47■■■■■ 5.03
BIVM-206ENST00000491929 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.13■■■■■ 4.97
BIVM-206ENST00000491929 SCRIBQ14160 1630 aa45.77■■■■■ 4.92
BIVM-206ENST00000491929 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.52■■■■■ 4.88
BIVM-206ENST00000491929 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.01■■■■■ 4.8
BIVM-206ENST00000491929 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
BIVM-206ENST00000491929 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.87■■■■■ 4.77
BIVM-206ENST00000491929 SMARCA4P51532 1647 aa43.83■■■■■ 4.61
BIVM-206ENST00000491929 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
BIVM-206ENST00000491929 NCAPD3P42695 1498 aa43.64■■■■■ 4.58
BIVM-206ENST00000491929 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.53■■■■■ 4.56
BIVM-206ENST00000491929 SMARCA2P51531 1590 aa43.52■■■■■ 4.56
BIVM-206ENST00000491929 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.46■■■■■ 4.55
BIVM-206ENST00000491929 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
BIVM-206ENST00000491929 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.4■■■■■ 4.54
BIVM-206ENST00000491929 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
BIVM-206ENST00000491929 ERCC6Q03468 1493 aa43■■■■■ 4.47
BIVM-206ENST00000491929 WIZO95785 1651 aa42.99■■■■■ 4.47
BIVM-206ENST00000491929 CUX2O14529 1486 aa42.88■■■■■ 4.46
BIVM-206ENST00000491929 NESP48681 1621 aa42.86■■■■■ 4.45
BIVM-206ENST00000491929 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
BIVM-206ENST00000491929 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.72■■■■■ 4.43
BIVM-206ENST00000491929 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.59■■■■■ 4.41
BIVM-206ENST00000491929 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
BIVM-206ENST00000491929 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.37■■■■■ 4.37
BIVM-206ENST00000491929 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
BIVM-206ENST00000491929 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.33■■■■■ 4.37
BIVM-206ENST00000491929 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.28■■■■■ 4.36
BIVM-206ENST00000491929 CFTRP13569 1480 aa41.98■■■■■ 4.31
BIVM-206ENST00000491929 PRDM2Q13029 1718 aa41.96■■■■■ 4.31
BIVM-206ENST00000491929 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.96■■■■■ 4.31
BIVM-206ENST00000491929 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.92■■■■■ 4.3
BIVM-206ENST00000491929 WDR62O43379 1518 aa41.85■■■■■ 4.29
BIVM-206ENST00000491929 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.83■■■■■ 4.29
BIVM-206ENST00000491929 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.81■■■■■ 4.28
BIVM-206ENST00000491929 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
BIVM-206ENST00000491929 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
BIVM-206ENST00000491929 TOPBP1Q92547 1522 aa41.1■■■■■ 4.17
BIVM-206ENST00000491929 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.09■■■■■ 4.17
BIVM-206ENST00000491929 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
BIVM-206ENST00000491929 OSCARQ8IYS5 282 aa41.02■■■■■ 4.16
BIVM-206ENST00000491929 IFT140Q96RY7 1462 aa41.01■■■■■ 4.16
BIVM-206ENST00000491929 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
BIVM-206ENST00000491929 TRIM41Q8WV44 630 aa40.87■■■■■ 4.13
BIVM-206ENST00000491929 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
BIVM-206ENST00000491929 CUX1P39880 1505 aa40.74■■■■■ 4.11
BIVM-206ENST00000491929 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
BIVM-206ENST00000491929 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
BIVM-206ENST00000491929 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.59■■■■■ 4.09
BIVM-206ENST00000491929 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.09
BIVM-206ENST00000491929 WDR97A6NE52 1622 aa40.5■■■■■ 4.07
BIVM-206ENST00000491929 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.49■■■■■ 4.07
BIVM-206ENST00000491929 SOGA1O94964 1423 aa40.49■■■■■ 4.07
BIVM-206ENST00000491929 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.47■■■■■ 4.07
BIVM-206ENST00000491929 TOP2BQ02880 1626 aa40.4■■■■■ 4.06
BIVM-206ENST00000491929 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.38■■■■■ 4.05
BIVM-206ENST00000491929 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.38■■■■■ 4.05
BIVM-206ENST00000491929 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.38■■■■■ 4.05
BIVM-206ENST00000491929 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
BIVM-206ENST00000491929 SYNJ1O43426 1573 aa40.36■■■■■ 4.05
BIVM-206ENST00000491929 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.04
BIVM-206ENST00000491929 CHD1O14646 1710 aa40.31■■■■■ 4.04
BIVM-206ENST00000491929 FBLN2P98095 1184 aa40.29■■■■■ 4.04
BIVM-206ENST00000491929 ARHGEF11O15085 1522 aa40.28■■■■■ 4.04
BIVM-206ENST00000491929 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.22■■■■■ 4.03
BIVM-206ENST00000491929 PBRM1Q86U86 1689 aa40.2■■■■■ 4.03
BIVM-206ENST00000491929 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.2■■■■■ 4.03
BIVM-206ENST00000491929 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.14■■■■■ 4.02
BIVM-206ENST00000491929 GRIN2BQ13224 1484 aa40.08■■■■■ 4.01
BIVM-206ENST00000491929 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
BIVM-206ENST00000491929 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.05■■■■■ 4
BIVM-206ENST00000491929 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.04■■■■■ 4
BIVM-206ENST00000491929 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
BIVM-206ENST00000491929 SYNJ2O15056 1496 aa39.93■■■■□ 3.98
BIVM-206ENST00000491929 ARAP1Q96P48 1450 aa39.9■■■■□ 3.98
BIVM-206ENST00000491929 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.89■■■■□ 3.98
BIVM-206ENST00000491929 ADAMTS12P58397 1594 aa39.78■■■■□ 3.96
BIVM-206ENST00000491929 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.76■■■■□ 3.96
BIVM-206ENST00000491929 GRIN2AQ12879 1464 aa39.6■■■■□ 3.93
BIVM-206ENST00000491929 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.92
BIVM-206ENST00000491929 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
BIVM-206ENST00000491929 CEP170Q5SW79 1584 aa39.47■■■■□ 3.91
BIVM-206ENST00000491929 KIF27Q86VH2 1401 aa39.47■■■■□ 3.91
BIVM-206ENST00000491929 CUL7Q14999 1698 aa39.45■■■■□ 3.91
BIVM-206ENST00000491929 NUP160Q12769 1436 aa39.44■■■■□ 3.9
BIVM-206ENST00000491929 IGF1RP08069 1367 aa39.32■■■■□ 3.88
BIVM-206ENST00000491929 SHROOM2Q13796 1616 aa39.3■■■■□ 3.88
BIVM-206ENST00000491929 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.28■■■■□ 3.88
BIVM-206ENST00000491929 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.23■■■■□ 3.87
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