Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 514.89□□□□□ -0.036e-126■■■■■ 151
SLTMQ9NWH9 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-19■■■■■ 90.4
SLTMQ9NWH9 FAM182B-205ENST00000478164 992 ntTSL 516.19■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 64.3
SLTMQ9NWH9 FAM182B-207ENST00000582267 832 ntTSL 514.69□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 64.3
SLTMQ9NWH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.344e-8■■■■■ 64
SLTMQ9NWH9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.891e-10■■■■■ 57.2
SLTMQ9NWH9 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 220■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 57.2
SLTMQ9NWH9 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.331e-10■■■■■ 57.2
SLTMQ9NWH9 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 411.51□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 57.2
SLTMQ9NWH9 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 411.19□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 57.2
SLTMQ9NWH9 NEDD8-207ENST00000533242 2300 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.052e-10■■■■■ 55.6
SLTMQ9NWH9 FAM118A-211ENST00000477714 756 ntTSL 213.97□□□□□ -0.174e-13■■■■■ 54.5
SLTMQ9NWH9 SHANK2-212ENST00000458632 635 ntTSL 312.94□□□□□ -0.344e-10■■■■■ 54
SLTMQ9NWH9 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 312.15□□□□□ -0.464e-10■■■■■ 54
SLTMQ9NWH9 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 315.77■□□□□ 0.121e-16■■■■■ 51.1
SLTMQ9NWH9 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 MAP3K13-211ENST00000447637 618 ntTSL 214.33□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 MAP3K13-205ENST00000433092 1460 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 MAP3K13-210ENST00000446828 2737 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 MAP3K13-204ENST00000428617 573 ntTSL 48.03□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 50.8
SLTMQ9NWH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.37e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 420.29■□□□□ 0.847e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 419.75■□□□□ 0.757e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 218.35■□□□□ 0.537e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 TPM4-205ENST00000586833 558 ntTSL 514.69□□□□□ -0.067e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.137e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 TPM4-210ENST00000588507 367 ntTSL 37.29□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 49
SLTMQ9NWH9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.143e-13■■■■■ 48.7
SLTMQ9NWH9 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.098e-8■■■■■ 48.6
SLTMQ9NWH9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.237e-13■■■■■ 47.4
SLTMQ9NWH9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-13■■■■■ 47.4
SLTMQ9NWH9 ANKMY1-220ENST00000477316 431 ntTSL 515.43■□□□□ 0.067e-13■■■■■ 47.4
SLTMQ9NWH9 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.37e-13■■■■■ 47.4
SLTMQ9NWH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.383e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 415.38■□□□□ 0.053e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 PCMTD2-201ENST00000266078 2371 ntTSL 212.52□□□□□ -0.43e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 47.04□□□□□ -1.283e-12■■■■■ 46.3
SLTMQ9NWH9 GMCL1-202ENST00000468386 808 ntTSL 525.48■■□□□ 1.672e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 320.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 420.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 418.82■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 MGST2-203ENST00000503816 1780 ntTSL 517.36■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 313.3□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 MGST2-206ENST00000515137 1013 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 26.84□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 44.5
SLTMQ9NWH9 KDM4B-212ENST00000624683 5076 nt16.18■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 44.3
SLTMQ9NWH9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.037e-12■■■■■ 43.8
SLTMQ9NWH9 AL121832.3-201ENST00000616512 3700 ntBASIC10.54□□□□□ -0.727e-12■■■■■ 43.8
SLTMQ9NWH9 GAK-216ENST00000511345 3567 ntTSL 214.5□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 43.5
SLTMQ9NWH9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 758 ntTSL 515.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-MDP1-203ENST00000604306 681 ntTSL 512.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-205ENST00000527046 847 ntTSL 211.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-204ENST00000526430 286 ntTSL 311.2□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-202ENST00000396828 626 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 510.42□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-206ENST00000531430 651 ntTSL 29.5□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 471 ntTSL 28.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 42.9
SLTMQ9NWH9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.31■□□□□ 0.24e-11■■■■■ 42.3
SLTMQ9NWH9 MIER2-203ENST00000587966 462 ntTSL 516.29■□□□□ 0.24e-11■■■■■ 42.3
SLTMQ9NWH9 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -04e-11■■■■■ 42.3
SLTMQ9NWH9 MIER2-202ENST00000586994 1002 ntTSL 214.61□□□□□ -0.074e-11■■■■■ 42.3
SLTMQ9NWH9 MIER2-207ENST00000635755 440 ntTSL 513.85□□□□□ -0.194e-11■■■■■ 42.3
SLTMQ9NWH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.78e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 224.77■■□□□ 1.568e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.028e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.18e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.188e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 37.09□□□□□ -1.278e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 57.09□□□□□ -1.278e-10■■■■■ 42.1
SLTMQ9NWH9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 41.7
SLTMQ9NWH9 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 41.7
SLTMQ9NWH9 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 41.7
SLTMQ9NWH9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 41.5
SLTMQ9NWH9 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 41.5
SLTMQ9NWH9 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 41.5
SLTMQ9NWH9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.299e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.919e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 41.3
SLTMQ9NWH9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.499e-8■■■■■ 41.3
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