RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587747.5

MGRN1-208, Transcript of mahogunin ring finger 1, humanhuman

TSL 5

Gene MGRN1, Length 1,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1-208ENST00000587747 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.8■■■■□ 3.96
MGRN1-208ENST00000587747 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.11■■■■□ 3.21
MGRN1-208ENST00000587747 ABCC9O60706 1549 aa34.08■■■■□ 3.05
MGRN1-208ENST00000587747 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
MGRN1-208ENST00000587747 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.17■■■□□ 2.9
MGRN1-208ENST00000587747 NACADO15069 1562 aa32.9■■■□□ 2.86
MGRN1-208ENST00000587747 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.85■■■□□ 2.85
MGRN1-208ENST00000587747 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.84■■■□□ 2.85
MGRN1-208ENST00000587747 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.8■■■□□ 2.84
MGRN1-208ENST00000587747 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.24■■■□□ 2.75
MGRN1-208ENST00000587747 SCRIBQ14160 1630 aa32.22■■■□□ 2.75
MGRN1-208ENST00000587747 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.71
MGRN1-208ENST00000587747 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.95■■■□□ 2.71
MGRN1-208ENST00000587747 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.87■■■□□ 2.69
MGRN1-208ENST00000587747 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.05■■■□□ 2.56
MGRN1-208ENST00000587747 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
MGRN1-208ENST00000587747 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.96■■■□□ 2.55
MGRN1-208ENST00000587747 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.81■■■□□ 2.52
MGRN1-208ENST00000587747 SMARCA4P51532 1647 aa30.8■■■□□ 2.52
MGRN1-208ENST00000587747 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
MGRN1-208ENST00000587747 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.75■■■□□ 2.51
MGRN1-208ENST00000587747 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
MGRN1-208ENST00000587747 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.51■■■□□ 2.48
MGRN1-208ENST00000587747 WIZO95785 1651 aa30.46■■■□□ 2.47
MGRN1-208ENST00000587747 SMARCA2P51531 1590 aa30.43■■■□□ 2.46
MGRN1-208ENST00000587747 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.43■■■□□ 2.46
MGRN1-208ENST00000587747 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
MGRN1-208ENST00000587747 NCAPD3P42695 1498 aa30.38■■■□□ 2.45
MGRN1-208ENST00000587747 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
MGRN1-208ENST00000587747 HMGXB3Q12766 1538 aa30.26■■■□□ 2.43
MGRN1-208ENST00000587747 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
MGRN1-208ENST00000587747 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.77■■■□□ 2.36
MGRN1-208ENST00000587747 NESP48681 1621 aa29.66■■■□□ 2.34
MGRN1-208ENST00000587747 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.54■■■□□ 2.32
MGRN1-208ENST00000587747 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.49■■■□□ 2.31
MGRN1-208ENST00000587747 CFTRP13569 1480 aa29.46■■■□□ 2.31
MGRN1-208ENST00000587747 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.28■■■□□ 2.28
MGRN1-208ENST00000587747 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.27■■■□□ 2.28
MGRN1-208ENST00000587747 ERCC6Q03468 1493 aa29.27■■■□□ 2.28
MGRN1-208ENST00000587747 PRDM2Q13029 1718 aa29.26■■■□□ 2.27
MGRN1-208ENST00000587747 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.23■■■□□ 2.27
MGRN1-208ENST00000587747 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.12■■■□□ 2.25
MGRN1-208ENST00000587747 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
MGRN1-208ENST00000587747 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.98■■■□□ 2.23
MGRN1-208ENST00000587747 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.97■■■□□ 2.23
MGRN1-208ENST00000587747 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
MGRN1-208ENST00000587747 ABCC8Q09428 1581 aa28.88■■■□□ 2.21
MGRN1-208ENST00000587747 WDR62O43379 1518 aa28.88■■■□□ 2.21
MGRN1-208ENST00000587747 TOPBP1Q92547 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
MGRN1-208ENST00000587747 CUX1P39880 1505 aa28.8■■■□□ 2.2
MGRN1-208ENST00000587747 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.79■■■□□ 2.2
MGRN1-208ENST00000587747 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
MGRN1-208ENST00000587747 CUX2O14529 1486 aa28.73■■■□□ 2.19
MGRN1-208ENST00000587747 SYNJ1O43426 1573 aa28.71■■■□□ 2.19
MGRN1-208ENST00000587747 TRIM41Q8WV44 630 aa28.63■■■□□ 2.17
MGRN1-208ENST00000587747 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.62■■■□□ 2.17
MGRN1-208ENST00000587747 TOP2BQ02880 1626 aa28.62■■■□□ 2.17
MGRN1-208ENST00000587747 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
MGRN1-208ENST00000587747 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.61■■■□□ 2.17
MGRN1-208ENST00000587747 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.54■■■□□ 2.16
MGRN1-208ENST00000587747 SOGA1O94964 1423 aa28.49■■■□□ 2.15
MGRN1-208ENST00000587747 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
MGRN1-208ENST00000587747 IFT140Q96RY7 1462 aa28.47■■■□□ 2.15
MGRN1-208ENST00000587747 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
MGRN1-208ENST00000587747 WDR97A6NE52 1622 aa28.35■■■□□ 2.13
MGRN1-208ENST00000587747 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
MGRN1-208ENST00000587747 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.31■■■□□ 2.12
MGRN1-208ENST00000587747 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.121e-6■■■■■ 36.1
MGRN1-208ENST00000587747 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
MGRN1-208ENST00000587747 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.19■■■□□ 2.1
MGRN1-208ENST00000587747 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.16■■■□□ 2.1
MGRN1-208ENST00000587747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.12■■■□□ 2.09
MGRN1-208ENST00000587747 PBRM1Q86U86 1689 aa28.1■■■□□ 2.09
MGRN1-208ENST00000587747 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
MGRN1-208ENST00000587747 KIF27Q86VH2 1401 aa28.07■■■□□ 2.08
MGRN1-208ENST00000587747 GRIN2BQ13224 1484 aa28.06■■■□□ 2.08
MGRN1-208ENST00000587747 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.03■■■□□ 2.08
MGRN1-208ENST00000587747 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.95■■■□□ 2.07
MGRN1-208ENST00000587747 IGF1RP08069 1367 aa27.95■■■□□ 2.07
MGRN1-208ENST00000587747 EEA1Q15075 1411 aa27.94■■■□□ 2.06
MGRN1-208ENST00000587747 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
MGRN1-208ENST00000587747 ADAMTS12P58397 1594 aa27.89■■■□□ 2.05
MGRN1-208ENST00000587747 FBLN2P98095 1184 aa27.87■■■□□ 2.05
MGRN1-208ENST00000587747 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.87■■■□□ 2.05
MGRN1-208ENST00000587747 CHD1O14646 1710 aa27.86■■■□□ 2.05
MGRN1-208ENST00000587747 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.86■■■□□ 2.05
MGRN1-208ENST00000587747 SYNJ2O15056 1496 aa27.83■■■□□ 2.05
MGRN1-208ENST00000587747 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.82■■■□□ 2.04
MGRN1-208ENST00000587747 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
MGRN1-208ENST00000587747 CUL7Q14999 1698 aa27.79■■■□□ 2.04
MGRN1-208ENST00000587747 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.78■■■□□ 2.04
MGRN1-208ENST00000587747 GRIN2AQ12879 1464 aa27.73■■■□□ 2.03
MGRN1-208ENST00000587747 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.68■■■□□ 2.02
MGRN1-208ENST00000587747 PRXQ9BXM0 1461 aa27.68■■■□□ 2.02
MGRN1-208ENST00000587747 OSCARQ8IYS5 282 aa27.66■■■□□ 2.02
MGRN1-208ENST00000587747 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.64■■■□□ 2.02
MGRN1-208ENST00000587747 CEP170Q5SW79 1584 aa27.63■■■□□ 2.01
MGRN1-208ENST00000587747 NUP160Q12769 1436 aa27.58■■■□□ 2.01
MGRN1-208ENST00000587747 KIF21BO75037 1637 aa27.58■■■□□ 2.01
MGRN1-208ENST00000587747 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.53■■■□□ 2
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