Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.954e-6■■□□□ 12.5
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NIPBLQ6KC79 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.119e-12■■□□□ 12.3
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NIPBLQ6KC79 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 59.83□□□□□ -0.846e-16■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 59.56□□□□□ -0.886e-16■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 34.4□□□□□ -1.716e-16■■□□□ 12.3
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NIPBLQ6KC79 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 CECR7-201ENST00000414401 546 ntTSL 414.77□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 CECR7-203ENST00000609596 2283 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 12.3
NIPBLQ6KC79 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.722e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 518.15■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 515.02□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 USP20-204ENST00000472108 1811 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12.2
NIPBLQ6KC79 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 12.2
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