RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339209.8

PHF10-201, Transcript of PHD finger protein 10, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHF10, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF10-201ENST00000339209 NISCHQ9Y2I1 1504 aa76,38■■■■■ 9,82
PHF10-201ENST00000339209 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa67,37■■■■■ 8,38
PHF10-201ENST00000339209 ABCC9O60706 1549 aa64,78■■■■■ 7,96
PHF10-201ENST00000339209 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP63,9■■■■■ 7,82
PHF10-201ENST00000339209 DCAF8L2P0C7V8 631 aa63,41■■■■■ 7,74
PHF10-201ENST00000339209 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa63,17■■■■■ 7,7
PHF10-201ENST00000339209 NACADO15069 1562 aa62,99■■■■■ 7,67
PHF10-201ENST00000339209 MYO15BQ96JP2 1530 aa62,95■■■■■ 7,67
PHF10-201ENST00000339209 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa62,8■■■■■ 7,64
PHF10-201ENST00000339209 SCRIBQ14160 1630 aa61,69■■■■■ 7,47
PHF10-201ENST00000339209 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61,56■■■■■ 7,45
PHF10-201ENST00000339209 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa61,27■■■■■ 7,4
PHF10-201ENST00000339209 BICRAQ9NZM4 1560 aa60,89■■■■■ 7,34
PHF10-201ENST00000339209 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP60,74■■■■■ 7,314e-6■■□□□ 13,1
PHF10-201ENST00000339209 CECR2Q9BXF3 1484 aa59,42■■■■■ 7,1
PHF10-201ENST00000339209 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59,18■■■■■ 7,06
PHF10-201ENST00000339209 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP59,12■■■■■ 7,06
PHF10-201ENST00000339209 SMARCA4P51532 1647 aa59,05■■■■■ 7,04
PHF10-201ENST00000339209 MROH2BQ7Z745 1585 aa58,94■■■■■ 7,03
PHF10-201ENST00000339209 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP58,67■■■■■ 6,98
PHF10-201ENST00000339209 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa58,65■■■■■ 6,98
PHF10-201ENST00000339209 WIZO95785 1651 aa58,44■■■■■ 6,95
PHF10-201ENST00000339209 PEG3Q9GZU2 1588 aa58,38■■■■■ 6,94
PHF10-201ENST00000339209 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa58,35■■■■■ 6,93
PHF10-201ENST00000339209 SMARCA2P51531 1590 aa58,34■■■■■ 6,93
PHF10-201ENST00000339209 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58,27■■■■■ 6,92
PHF10-201ENST00000339209 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP58,24■■■■■ 6,91
PHF10-201ENST00000339209 NCAPD3P42695 1498 aa58,08■■■■■ 6,89
PHF10-201ENST00000339209 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57,99■■■■■ 6,87
PHF10-201ENST00000339209 HMGXB3Q12766 1538 aa57,96■■■■■ 6,87
PHF10-201ENST00000339209 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP57,8■■■■■ 6,84
PHF10-201ENST00000339209 CCDC88BA6NC98 1476 aa57,12■■■■■ 6,73
PHF10-201ENST00000339209 CADPSQ9ULU8 1353 aa56,47■■■■■ 6,63
PHF10-201ENST00000339209 NESP48681 1621 aa56,45■■■■■ 6,63
PHF10-201ENST00000339209 CFTRP13569 1480 aa56,42■■■■■ 6,62
PHF10-201ENST00000339209 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56,41■■■■■ 6,62
PHF10-201ENST00000339209 PRDM2Q13029 1718 aa56,24■■■■■ 6,59
PHF10-201ENST00000339209 PDS5BQ9NTI5 1447 aa55,95■■■■■ 6,55
PHF10-201ENST00000339209 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55,89■■■■■ 6,54
PHF10-201ENST00000339209 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa55,87■■■■■ 6,54
PHF10-201ENST00000339209 ERCC6Q03468 1493 aa55,72■■■■■ 6,51
PHF10-201ENST00000339209 CEP164Q9UPV0 1460 aa55,7■■■■■ 6,51
PHF10-201ENST00000339209 ABCC8Q09428 1581 aa55,52■■■■■ 6,48
PHF10-201ENST00000339209 MRC2Q9UBG0 1479 aa55,34■■■■■ 6,45
PHF10-201ENST00000339209 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP55,3■■■■■ 6,44
PHF10-201ENST00000339209 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP55,3■■■■■ 6,44
PHF10-201ENST00000339209 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55,26■■■■■ 6,44
PHF10-201ENST00000339209 CUX1P39880 1505 aa55,22■■■■■ 6,43
PHF10-201ENST00000339209 DNMBPQ6XZF7 1577 aa55,19■■■■■ 6,42
PHF10-201ENST00000339209 SYNJ1O43426 1573 aa55,18■■■■■ 6,42
PHF10-201ENST00000339209 TOPBP1Q92547 1522 aa55,14■■■■■ 6,42
PHF10-201ENST00000339209 WDR62O43379 1518 aa55,12■■■■■ 6,41
PHF10-201ENST00000339209 TOP2BQ02880 1626 aa55,07■■■■■ 6,41
PHF10-201ENST00000339209 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa55,07■■■■■ 6,41
PHF10-201ENST00000339209 CHIC1Q5VXU3 224 aa55,01■■■■■ 6,4
PHF10-201ENST00000339209 TRIM41Q8WV44 630 aa54,87■■■■■ 6,37
PHF10-201ENST00000339209 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54,83■■■■■ 6,37
PHF10-201ENST00000339209 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54,77■■■■■ 6,36
PHF10-201ENST00000339209 CUX2O14529 1486 aa54,6■■■■■ 6,33
PHF10-201ENST00000339209 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54,54■■■■■ 6,32
PHF10-201ENST00000339209 SOGA1O94964 1423 aa54,53■■■■■ 6,32
PHF10-201ENST00000339209 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP54,46■■■■■ 6,31
PHF10-201ENST00000339209 IFT140Q96RY7 1462 aa54,44■■■■■ 6,3
PHF10-201ENST00000339209 WDR97A6NE52 1622 aa54,36■■■■■ 6,29
PHF10-201ENST00000339209 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa54,31■■■■■ 6,28
PHF10-201ENST00000339209 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54,17■■■■■ 6,26
PHF10-201ENST00000339209 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54,11■■■■■ 6,25
PHF10-201ENST00000339209 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54,05■■■■■ 6,24
PHF10-201ENST00000339209 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa54,04■■■■■ 6,24
PHF10-201ENST00000339209 KIF27Q86VH2 1401 aa54,02■■■■■ 6,24
PHF10-201ENST00000339209 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa54,02■■■■■ 6,24
PHF10-201ENST00000339209 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP54,01■■■■■ 6,244e-10■■■■■ 35,9
PHF10-201ENST00000339209 GAPVD1Q14C86 1478 aa53,94■■■■■ 6,22
PHF10-201ENST00000339209 PBRM1Q86U86 1689 aa53,86■■■■■ 6,21
PHF10-201ENST00000339209 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP53,82■■■■■ 6,21
PHF10-201ENST00000339209 EEA1Q15075 1411 aa53,78■■■■■ 6,2
PHF10-201ENST00000339209 GRIN2BQ13224 1484 aa53,73■■■■■ 6,19
PHF10-201ENST00000339209 ERICH3Q5RHP9 1530 aa53,68■■■■■ 6,18
PHF10-201ENST00000339209 IGF1RP08069 1367 aa53,62■■■■■ 6,17
PHF10-201ENST00000339209 CSRNP3Q8WYN3 585 aa53,56■■■■■ 6,16
PHF10-201ENST00000339209 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53,55■■■■■ 6,16
PHF10-201ENST00000339209 CUL7Q14999 1698 aa53,49■■■■■ 6,15
PHF10-201ENST00000339209 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53,46■■■■■ 6,15
PHF10-201ENST00000339209 ADAMTS12P58397 1594 aa53,44■■■■■ 6,15
PHF10-201ENST00000339209 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa53,36■■■■■ 6,13
PHF10-201ENST00000339209 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53,32■■■■■ 6,13
PHF10-201ENST00000339209 PRXQ9BXM0 1461 aa53,3■■■■■ 6,12
PHF10-201ENST00000339209 SYNJ2O15056 1496 aa53,25■■■■■ 6,11
PHF10-201ENST00000339209 KIF21BO75037 1637 aa53,22■■■■■ 6,11
PHF10-201ENST00000339209 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa53,2■■■■■ 6,11
PHF10-201ENST00000339209 CHD1O14646 1710 aa53,18■■■■■ 6,1
PHF10-201ENST00000339209 FBLN2P98095 1184 aa53,14■■■■■ 6,1
PHF10-201ENST00000339209 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53,13■■■■■ 6,1
PHF10-201ENST00000339209 EHMT2Q96KQ7 1210 aa53,11■■■■■ 6,09
PHF10-201ENST00000339209 GRIN2AQ12879 1464 aa53,08■■■■■ 6,09
PHF10-201ENST00000339209 GOLGA3Q08378 1498 aa53■■■■■ 6,07
PHF10-201ENST00000339209 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa52,83■■■■■ 6,05
PHF10-201ENST00000339209 CEP170Q5SW79 1584 aa52,81■■■■■ 6,04
PHF10-201ENST00000339209 UBTFP17480 764 aaKnown RBP52,77■■■■■ 6,04
PHF10-201ENST00000339209 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa52,75■■■■■ 6,04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10,6 ms