RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.13■■■■□ 3.53
USP20-204ENST00000472108 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.35■■■□□ 2.77
USP20-204ENST00000472108 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
USP20-204ENST00000472108 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.71■■■□□ 2.51
USP20-204ENST00000472108 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.68■■■□□ 2.5
USP20-204ENST00000472108 ABCC9O60706 1549 aa30.63■■■□□ 2.49
USP20-204ENST00000472108 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
USP20-204ENST00000472108 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.23■■■□□ 2.43
USP20-204ENST00000472108 NACADO15069 1562 aa30.17■■■□□ 2.42
USP20-204ENST00000472108 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.91■■■□□ 2.38
USP20-204ENST00000472108 SCRIBQ14160 1630 aa29.73■■■□□ 2.35
USP20-204ENST00000472108 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.25■■■□□ 2.27
USP20-204ENST00000472108 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
USP20-204ENST00000472108 BICRAQ9NZM4 1560 aa29■■■□□ 2.23
USP20-204ENST00000472108 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
USP20-204ENST00000472108 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.85■■■□□ 2.21
USP20-204ENST00000472108 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
USP20-204ENST00000472108 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.67■■■□□ 2.18
USP20-204ENST00000472108 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
USP20-204ENST00000472108 SMARCA4P51532 1647 aa28.52■■■□□ 2.16
USP20-204ENST00000472108 WIZO95785 1651 aa28.41■■■□□ 2.14
USP20-204ENST00000472108 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.2■■■□□ 2.1
USP20-204ENST00000472108 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
USP20-204ENST00000472108 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
USP20-204ENST00000472108 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.09■■■□□ 2.09
USP20-204ENST00000472108 SMARCA2P51531 1590 aa28.06■■■□□ 2.08
USP20-204ENST00000472108 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
USP20-204ENST00000472108 NCAPD3P42695 1498 aa27.88■■■□□ 2.05
USP20-204ENST00000472108 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.88■■■□□ 2.05
USP20-204ENST00000472108 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.87■■■□□ 2.05
USP20-204ENST00000472108 HMGXB3Q12766 1538 aa27.8■■■□□ 2.04
USP20-204ENST00000472108 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.71■■■□□ 2.03
USP20-204ENST00000472108 TRIM41Q8WV44 630 aa27.4■■□□□ 1.98
USP20-204ENST00000472108 CFTRP13569 1480 aa27.24■■□□□ 1.95
USP20-204ENST00000472108 ABCC8Q09428 1581 aa27.23■■□□□ 1.95
USP20-204ENST00000472108 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.16■■□□□ 1.94
USP20-204ENST00000472108 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
USP20-204ENST00000472108 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.08■■□□□ 1.93
USP20-204ENST00000472108 PRDM2Q13029 1718 aa27.02■■□□□ 1.92
USP20-204ENST00000472108 SYNJ1O43426 1573 aa26.95■■□□□ 1.91
USP20-204ENST00000472108 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.9■■□□□ 1.9
USP20-204ENST00000472108 NESP48681 1621 aa26.88■■□□□ 1.89
USP20-204ENST00000472108 TOP2BQ02880 1626 aa26.87■■□□□ 1.89
USP20-204ENST00000472108 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USP20-204ENST00000472108 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.83■■□□□ 1.89
USP20-204ENST00000472108 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.83■■□□□ 1.89
USP20-204ENST00000472108 CUX1P39880 1505 aa26.8■■□□□ 1.88
USP20-204ENST00000472108 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.8■■□□□ 1.88
USP20-204ENST00000472108 SOGA1O94964 1423 aa26.75■■□□□ 1.87
USP20-204ENST00000472108 EEA1Q15075 1411 aa26.72■■□□□ 1.87
USP20-204ENST00000472108 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.72■■□□□ 1.87
USP20-204ENST00000472108 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.66■■□□□ 1.86
USP20-204ENST00000472108 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.64■■□□□ 1.86
USP20-204ENST00000472108 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.59■■□□□ 1.85
USP20-204ENST00000472108 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.57■■□□□ 1.84
USP20-204ENST00000472108 TOPBP1Q92547 1522 aa26.54■■□□□ 1.84
USP20-204ENST00000472108 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.53■■□□□ 1.84
USP20-204ENST00000472108 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.52■■□□□ 1.84
USP20-204ENST00000472108 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
USP20-204ENST00000472108 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.45■■□□□ 1.82
USP20-204ENST00000472108 KIF27Q86VH2 1401 aa26.43■■□□□ 1.82
USP20-204ENST00000472108 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
USP20-204ENST00000472108 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.35■■□□□ 1.81
USP20-204ENST00000472108 CUX2O14529 1486 aa26.34■■□□□ 1.81
USP20-204ENST00000472108 KIF21BO75037 1637 aa26.33■■□□□ 1.81
USP20-204ENST00000472108 GOLGA3Q08378 1498 aa26.32■■□□□ 1.8
USP20-204ENST00000472108 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.32■■□□□ 1.8
USP20-204ENST00000472108 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.3■■□□□ 1.8
USP20-204ENST00000472108 ERCC6Q03468 1493 aa26.27■■□□□ 1.8
USP20-204ENST00000472108 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.26■■□□□ 1.79
USP20-204ENST00000472108 PRXQ9BXM0 1461 aa26.24■■□□□ 1.79
USP20-204ENST00000472108 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
USP20-204ENST00000472108 IGF1RP08069 1367 aa26.22■■□□□ 1.79
USP20-204ENST00000472108 WDR62O43379 1518 aa26.21■■□□□ 1.79
USP20-204ENST00000472108 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.2■■□□□ 1.79
USP20-204ENST00000472108 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.18■■□□□ 1.78
USP20-204ENST00000472108 WDR97A6NE52 1622 aa26.16■■□□□ 1.78
USP20-204ENST00000472108 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
USP20-204ENST00000472108 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
USP20-204ENST00000472108 CEP162Q5TB80 1403 aa26.09■■□□□ 1.77
USP20-204ENST00000472108 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.08■■□□□ 1.77
USP20-204ENST00000472108 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
USP20-204ENST00000472108 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.06■■□□□ 1.76
USP20-204ENST00000472108 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
USP20-204ENST00000472108 IFT140Q96RY7 1462 aa26.03■■□□□ 1.76
USP20-204ENST00000472108 CUL7Q14999 1698 aa25.96■■□□□ 1.75
USP20-204ENST00000472108 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.746e-7■■□□□ 12.1
USP20-204ENST00000472108 CLIP1P30622 1438 aa25.9■■□□□ 1.74
USP20-204ENST00000472108 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
USP20-204ENST00000472108 GRIN2BQ13224 1484 aa25.84■■□□□ 1.73
USP20-204ENST00000472108 PBRM1Q86U86 1689 aa25.83■■□□□ 1.73
USP20-204ENST00000472108 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
USP20-204ENST00000472108 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.77■■□□□ 1.72
USP20-204ENST00000472108 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
USP20-204ENST00000472108 ADAMTS12P58397 1594 aa25.71■■□□□ 1.71
USP20-204ENST00000472108 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.67■■□□□ 1.7
USP20-204ENST00000472108 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.65■■□□□ 1.7
USP20-204ENST00000472108 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.65■■□□□ 1.7
USP20-204ENST00000472108 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.64■■□□□ 1.7
USP20-204ENST00000472108 ARAP1Q96P48 1450 aa25.64■■□□□ 1.69
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