Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 LSM7-207ENST00000591745 543 ntTSL 211.86□□□□□ -0.511e-8■□□□□ 10
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SRSF7Q16629 RPL13A-208ENST00000477613 796 ntTSL 513.79□□□□□ -0.23e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-209ENST00000479992 850 ntTSL 312.79□□□□□ -0.363e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-214ENST00000624069 1122 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.483e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-212ENST00000488946 2312 ntTSL 212.05□□□□□ -0.483e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-202ENST00000467825 660 ntTSL 511.69□□□□□ -0.543e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-16■□□□□ 10
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SRSF7Q16629 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-207ENST00000476300 619 ntTSL 38.72□□□□□ -1.013e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 RPL13A-205ENST00000474171 521 ntTSL 28.6□□□□□ -1.033e-16■□□□□ 10
SRSF7Q16629 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 416.64■□□□□ 0.253e-7■□□□□ 9.9
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SRSF7Q16629 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 415.06■□□□□ 03e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 313.38□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SLC22A23-212ENST00000497691 2555 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 9.9
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SRSF7Q16629 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-7■□□□□ 9.9
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SRSF7Q16629 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SLC22A23-206ENST00000467144 542 ntTSL 410.4□□□□□ -0.743e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 49.11□□□□□ -0.953e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)4.89□□□□□ -1.633e-7■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-9■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-9■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.835e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-205ENST00000444799 1590 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.965e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -15e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-206ENST00000449279 699 ntTSL 38□□□□□ -1.135e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.155e-11■□□□□ 9.9
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SRSF7Q16629 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.255e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 27□□□□□ -1.295e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 26.29□□□□□ -1.45e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 25.08□□□□□ -1.65e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 24.48□□□□□ -1.695e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 24.13□□□□□ -1.755e-11■□□□□ 9.9
SRSF7Q16629 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 22.17□□□□□ -2.065e-11■□□□□ 9.9
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SRSF7Q16629 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.9
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SRSF7Q16629 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.671e-323■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.034e-7■□□□□ 9.8
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SRSF7Q16629 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.228e-10■□□□□ 9.8
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SRSF7Q16629 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 513.32□□□□□ -0.288e-10■□□□□ 9.8
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SRSF7Q16629 NECAB3-204ENST00000463246 766 ntTSL 312.73□□□□□ -0.378e-10■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 511.07□□□□□ -0.648e-10■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 511.07□□□□□ -0.648e-10■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 55.67□□□□□ -1.51e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 33.89□□□□□ -1.791e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RN7SKP80-201ENST00000365188 283 ntBASIC8.82□□□□□ -15e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-205ENST00000463912 2382 ntTSL 25.9□□□□□ -1.461e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 23.3□□□□□ -1.881e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.261e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.111e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 521.64■■□□□ 1.051e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 520.27■□□□□ 0.831e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 520.22■□□□□ 0.831e-7■□□□□ 9.8
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