Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 UBN1-207ENST00000589191 705 ntTSL 317.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 36.22□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 23.84□□□□□ -1.793e-7■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 33.5□□□□□ -1.853e-7■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 TELO2-207ENST00000568240 1327 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.179e-8■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.129e-8■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 316.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 PRRC2C-205ENST00000463586 3771 ntTSL 26.19□□□□□ -1.421e-10■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 48.69□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GOLGA8A-205ENST00000569781 653 ntTSL 527.32■■□□□ 1.963e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GALNT11-212ENST00000482812 580 ntTSL 423.13■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-227ENST00000569571 959 ntTSL 521.26■□□□□ 0.991e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 CDC42-204ENST00000411827 597 ntTSL 317.72■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GALNT11-209ENST00000446096 521 ntTSL 317.54■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GALNT11-210ENST00000447778 1231 ntTSL 517.48■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 HSPG2-204ENST00000412328 828 ntTSL 217.29■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-205ENST00000562050 1005 ntTSL 316.58■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-220ENST00000566657 584 ntTSL 216.58■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GALNT11-206ENST00000431668 626 ntTSL 315.71■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-212ENST00000564050 846 ntTSL 515.68■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-209ENST00000486825 850 ntTSL 515.58■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-206ENST00000562381 713 ntTSL 215.4■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-215ENST00000565745 440 ntTSL 515.11■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 HSPG2-201ENST00000374673 538 ntTSL 314.51□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 GALNT11-204ENST00000423337 580 ntTSL 313.64□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-226ENST00000569047 648 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-209ENST00000563520 839 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-205ENST00000462797 2000 ntTSL 512.78□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-212ENST00000492612 983 ntTSL 512.57□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-213ENST00000564441 1011 ntTSL 311.95□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SEC16A-207ENST00000453963 4834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-215ENST00000541099 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-218ENST00000566341 562 ntTSL 410.83□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-213ENST00000495175 1156 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-211ENST00000491865 738 ntTSL 59.55□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-203ENST00000441669 1851 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-210ENST00000563562 487 ntTSL 58.92□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 SEC16A-201ENST00000277537 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-207ENST00000562456 344 ntTSL 38.16□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TRIT1-210ENST00000489945 861 ntTSL 57.81□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-204ENST00000561806 543 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 57□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 USP33-208ENST00000477949 663 ntTSL 26.91□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 46.75□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 PRMT7-219ENST00000566430 382 ntTSL 24.48□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.079e-16■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 27.84□□□□□ -1.159e-16■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.319e-16■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 KPNB1-209ENST00000580158 603 ntTSL 26.52□□□□□ -1.379e-16■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 317.3■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 35.81□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 RPRD1B-209ENST00000622494 469 ntTSL 34.98□□□□□ -1.612e-16■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TMEM164-207ENST00000471255 418 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 27.7
TARDBPQ13148 AC069277.1-203ENST00000414603 517 ntTSL 39.32□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.761e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 27.6
TARDBPQ13148 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)24.94■■□□□ 1.585e-7■■■■■ 27.6
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 660.5 ms