RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.58■■■■■ 7.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.7■■■■■ 6.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC9O60706 1549 aa54.35■■■■■ 6.29
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.08■■■■■ 6.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.61■■■■■ 6.17
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.38■■■■■ 6.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.05■■■■■ 6.08
TRAPPC10-202ENST00000380221 NACADO15069 1562 aa52.99■■■■■ 6.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.74■■■■■ 6.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.11■■■■■ 5.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCRIBQ14160 1630 aa52.04■■■■■ 5.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.68■■■■■ 5.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.17■■■■■ 5.78
TRAPPC10-202ENST00000380221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.09■■■■■ 5.77
TRAPPC10-202ENST00000380221 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.26■■■■■ 5.64
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.93■■■■■ 5.58
TRAPPC10-202ENST00000380221 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.87■■■■■ 5.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMARCA4P51532 1647 aa49.82■■■■■ 5.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.78■■■■■ 5.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.73■■■■■ 5.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.55
TRAPPC10-202ENST00000380221 WIZO95785 1651 aa49.43■■■■■ 5.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.24■■■■■ 5.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.2■■■■■ 5.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.18■■■■■ 5.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMARCA2P51531 1590 aa49.15■■■■■ 5.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCAPD3P42695 1498 aa48.91■■■■■ 5.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMGXB3Q12766 1538 aa48.77■■■■■ 5.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.69■■■■■ 5.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.37■■■■■ 5.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFTRP13569 1480 aa47.6■■■■■ 5.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.6■■■■■ 5.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 NESP48681 1621 aa47.47■■■■■ 5.19
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.39■■■■■ 5.18
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM2Q13029 1718 aa47.33■■■■■ 5.17
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.16■■■■■ 5.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC8Q09428 1581 aa47.1■■■■■ 5.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.08■■■■■ 5.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.04■■■■■ 5.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.91■■■■■ 5.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.88■■■■■ 5.09
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.87■■■■■ 5.09
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM41Q8WV44 630 aa46.81■■■■■ 5.08
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNJ1O43426 1573 aa46.73■■■■■ 5.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUX1P39880 1505 aa46.68■■■■■ 5.06
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERCC6Q03468 1493 aa46.67■■■■■ 5.06
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOP2BQ02880 1626 aa46.6■■■■■ 5.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.58■■■■■ 5.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.51■■■■■ 5.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.49■■■■■ 5.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOPBP1Q92547 1522 aa46.48■■■■■ 5.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.3■■■■■ 5
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR62O43379 1518 aa46.28■■■■■ 5
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.05■■■■■ 4.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOGA1O94964 1423 aa46.04■■■■■ 4.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUX2O14529 1486 aa45.95■■■■■ 4.95
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.95
TRAPPC10-202ENST00000380221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.93■■■■■ 4.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.86■■■■■ 4.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR97A6NE52 1622 aa45.81■■■■■ 4.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFT140Q96RY7 1462 aa45.79■■■■■ 4.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF27Q86VH2 1401 aa45.75■■■■■ 4.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 EEA1Q15075 1411 aa45.74■■■■■ 4.91
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.61■■■■■ 4.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.57■■■■■ 4.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.51■■■■■ 4.889e-7■■□□□ 12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.51■■■■■ 4.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGF1RP08069 1367 aa45.45■■■■■ 4.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.35■■■■■ 4.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.34■■■■■ 4.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PBRM1Q86U86 1689 aa45.34■■■■■ 4.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.32■■■■■ 4.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIN2BQ13224 1484 aa45.28■■■■■ 4.84
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRXQ9BXM0 1461 aa45.25■■■■■ 4.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF21BO75037 1637 aa45.22■■■■■ 4.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.21■■■■■ 4.83
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUL7Q14999 1698 aa45.17■■■■■ 4.82
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.14■■■■■ 4.82
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOLGA3Q08378 1498 aa45.1■■■■■ 4.81
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.08■■■■■ 4.81
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAMTS12P58397 1594 aa45.03■■■■■ 4.8
TRAPPC10-202ENST00000380221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45■■■■■ 4.79
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNJ2O15056 1496 aa44.82■■■■■ 4.77
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.79■■■■■ 4.76
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBLN2P98095 1184 aa44.75■■■■■ 4.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIN2AQ12879 1464 aa44.72■■■■■ 4.75
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHD1O14646 1710 aa44.6■■■■■ 4.73
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.57■■■■■ 4.73
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