RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.2■■□□□ 1.3
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TRAPPC10-201ENST00000291574 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-201ENST00000291574 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NEFLP07196 543 aa20.4■□□□□ 0.86
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-201ENST00000291574 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.79■□□□□ 0.76
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NEUROD1Q13562 356 aa19.33■□□□□ 0.68
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.31■□□□□ 0.68
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ANP32CO43423 234 aa19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM52Q96A61 297 aa19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC10-201ENST00000291574 FKBP8Q14318 412 aa18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ARID3CA6NKF2 412 aa18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC10-201ENST00000291574 MIER1Q8N108 512 aa18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC10-201ENST00000291574 NBR1Q14596 966 aa18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCC9O60706 1549 aa18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC10-201ENST00000291574 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC10-201ENST00000291574 TONSLQ96HA7 1378 aa18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC10-201ENST00000291574 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBLN2P98095 1184 aa18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC24A1O60721 1099 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARXQ96QS3 562 aa18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 NEFMP07197 916 aa18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRS2Q9HD23 443 aa18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMC1Q8TDI8 760 aa18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC10-201ENST00000291574 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC10-201ENST00000291574 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC10-201ENST00000291574 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 29.3
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLIP1P30622 1438 aa18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC10-201ENST00000291574 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCRIBQ14160 1630 aa18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC10-201ENST00000291574 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC10-201ENST00000291574 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC10-201ENST00000291574 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEP162Q5TB80 1403 aa18.05■□□□□ 0.48
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