RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563520.5

PRMT7-209, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, humanhuman

TSL 3

Gene PRMT7, Length 839 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT7-209ENST00000563520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.73■■■□□ 2.67
PRMT7-209ENST00000563520 ABCC9O60706 1549 aa29.06■■■□□ 2.24
PRMT7-209ENST00000563520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.54■■■□□ 2.16
PRMT7-209ENST00000563520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.76■■■□□ 2.03
PRMT7-209ENST00000563520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.4■■□□□ 1.98
PRMT7-209ENST00000563520 NACADO15069 1562 aa27.14■■□□□ 1.94
PRMT7-209ENST00000563520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
PRMT7-209ENST00000563520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.91■■□□□ 1.9
PRMT7-209ENST00000563520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.72■■□□□ 1.87
PRMT7-209ENST00000563520 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.71■■□□□ 1.87
PRMT7-209ENST00000563520 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.68■■□□□ 1.86
PRMT7-209ENST00000563520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.27■■□□□ 1.8
PRMT7-209ENST00000563520 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.23■■□□□ 1.79
PRMT7-209ENST00000563520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PRMT7-209ENST00000563520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.2■■□□□ 1.78
PRMT7-209ENST00000563520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.18■■□□□ 1.78
PRMT7-209ENST00000563520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PRMT7-209ENST00000563520 SCRIBQ14160 1630 aa26.03■■□□□ 1.76
PRMT7-209ENST00000563520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.74■■□□□ 1.71
PRMT7-209ENST00000563520 CUX2O14529 1486 aa25.21■■□□□ 1.63
PRMT7-209ENST00000563520 NCAPD3P42695 1498 aa25.14■■□□□ 1.61
PRMT7-209ENST00000563520 ERCC6Q03468 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
PRMT7-209ENST00000563520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25■■□□□ 1.59
PRMT7-209ENST00000563520 NESP48681 1621 aa24.87■■□□□ 1.57
PRMT7-209ENST00000563520 HMGXB3Q12766 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
PRMT7-209ENST00000563520 SMARCA2P51531 1590 aa24.82■■□□□ 1.56
PRMT7-209ENST00000563520 SMARCA4P51532 1647 aa24.79■■□□□ 1.56
PRMT7-209ENST00000563520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PRMT7-209ENST00000563520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PRMT7-209ENST00000563520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PRMT7-209ENST00000563520 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.59■■□□□ 1.53
PRMT7-209ENST00000563520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.55■■□□□ 1.52
PRMT7-209ENST00000563520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.46■■□□□ 1.51
PRMT7-209ENST00000563520 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.46■■□□□ 1.51
PRMT7-209ENST00000563520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.42■■□□□ 1.5
PRMT7-209ENST00000563520 TRIM41Q8WV44 630 aa24.37■■□□□ 1.49
PRMT7-209ENST00000563520 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.34■■□□□ 1.49
PRMT7-209ENST00000563520 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.28■■□□□ 1.48
PRMT7-209ENST00000563520 WDR62O43379 1518 aa24.25■■□□□ 1.47
PRMT7-209ENST00000563520 WIZO95785 1651 aa24.08■■□□□ 1.44
PRMT7-209ENST00000563520 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.07■■□□□ 1.44
PRMT7-209ENST00000563520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.04■■□□□ 1.44
PRMT7-209ENST00000563520 OSCARQ8IYS5 282 aa23.99■■□□□ 1.43
PRMT7-209ENST00000563520 CFTRP13569 1480 aa23.99■■□□□ 1.43
PRMT7-209ENST00000563520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PRMT7-209ENST00000563520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PRMT7-209ENST00000563520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PRMT7-209ENST00000563520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRMT7-209ENST00000563520 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.69■■□□□ 1.38
PRMT7-209ENST00000563520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.69■■□□□ 1.38
PRMT7-209ENST00000563520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.69■■□□□ 1.38
PRMT7-209ENST00000563520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PRMT7-209ENST00000563520 IFT140Q96RY7 1462 aa23.63■■□□□ 1.37
PRMT7-209ENST00000563520 ARHGEF11O15085 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
PRMT7-209ENST00000563520 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.54■■□□□ 1.36
PRMT7-209ENST00000563520 TOPBP1Q92547 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
PRMT7-209ENST00000563520 PRDM2Q13029 1718 aa23.49■■□□□ 1.35
PRMT7-209ENST00000563520 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.48■■□□□ 1.35
PRMT7-209ENST00000563520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PRMT7-209ENST00000563520 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 30.5
PRMT7-209ENST00000563520 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
PRMT7-209ENST00000563520 ARAP1Q96P48 1450 aa23.39■■□□□ 1.34
PRMT7-209ENST00000563520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.38■■□□□ 1.33
PRMT7-209ENST00000563520 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PRMT7-209ENST00000563520 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRMT7-209ENST00000563520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PRMT7-209ENST00000563520 CHD1O14646 1710 aa23.29■■□□□ 1.32
PRMT7-209ENST00000563520 FBLN2P98095 1184 aa23.27■■□□□ 1.32
PRMT7-209ENST00000563520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.22■■□□□ 1.31
PRMT7-209ENST00000563520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PRMT7-209ENST00000563520 SOGA1O94964 1423 aa23.16■■□□□ 1.3
PRMT7-209ENST00000563520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.13■■□□□ 1.29
PRMT7-209ENST00000563520 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.13■■□□□ 1.29
PRMT7-209ENST00000563520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.06■■□□□ 1.28
PRMT7-209ENST00000563520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PRMT7-209ENST00000563520 WDR97A6NE52 1622 aa23.03■■□□□ 1.28
PRMT7-209ENST00000563520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PRMT7-209ENST00000563520 SYNJ1O43426 1573 aa23■■□□□ 1.27
PRMT7-209ENST00000563520 GRIN2BQ13224 1484 aa22.99■■□□□ 1.27
PRMT7-209ENST00000563520 CUX1P39880 1505 aa22.99■■□□□ 1.27
PRMT7-209ENST00000563520 SYNJ2O15056 1496 aa22.98■■□□□ 1.27
PRMT7-209ENST00000563520 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
PRMT7-209ENST00000563520 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PRMT7-209ENST00000563520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.78■■□□□ 1.24
PRMT7-209ENST00000563520 PBRM1Q86U86 1689 aa22.77■■□□□ 1.24
PRMT7-209ENST00000563520 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.76■■□□□ 1.23
PRMT7-209ENST00000563520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.76■■□□□ 1.23
PRMT7-209ENST00000563520 GRIN2AQ12879 1464 aa22.71■■□□□ 1.23
PRMT7-209ENST00000563520 NUP160Q12769 1436 aa22.69■■□□□ 1.22
PRMT7-209ENST00000563520 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.68■■□□□ 1.22
PRMT7-209ENST00000563520 CEP170Q5SW79 1584 aa22.65■■□□□ 1.22
PRMT7-209ENST00000563520 ADAMTS12P58397 1594 aa22.62■■□□□ 1.21
PRMT7-209ENST00000563520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
PRMT7-209ENST00000563520 SHROOM2Q13796 1616 aa22.57■■□□□ 1.2
PRMT7-209ENST00000563520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.56■■□□□ 1.2
PRMT7-209ENST00000563520 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PRMT7-209ENST00000563520 TOP2BQ02880 1626 aa22.46■■□□□ 1.19
PRMT7-209ENST00000563520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.46■■□□□ 1.19
PRMT7-209ENST00000563520 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.43■■□□□ 1.18
PRMT7-209ENST00000563520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 191.1 ms