RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.25	■■■■■ 4.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.82	■■■■□ 3.32
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCC9	O60706	1549 aa		35.35	■■■■□ 3.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.98	■■■■□ 3.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.89	■■■■□ 3.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NACAD	O15069	1562 aa		33.79	■■■■□ 3
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.47	■■■□□ 2.95
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.26	■■■□□ 2.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.07	■■■□□ 2.88
JMJD1C-211	ENST00000633035	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.99	■■■□□ 2.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.77	■■■□□ 2.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.73	■■■□□ 2.83
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.6	■■■□□ 2.81
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.46	■■■□□ 2.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.91	■■■□□ 2.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.78	■■■□□ 2.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.25	■■■□□ 2.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.19	■■■□□ 2.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.17	■■■□□ 2.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.13	■■■□□ 2.57
JMJD1C-211	ENST00000633035	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31	■■■□□ 2.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.97	■■■□□ 2.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.95	■■■□□ 2.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.91	■■■□□ 2.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	WIZ	O95785	1651 aa		30.66	■■■□□ 2.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.61	■■■□□ 2.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.55	■■■□□ 2.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	NES	P48681	1621 aa		30.48	■■■□□ 2.47
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.39	■■■□□ 2.46
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.32	■■■□□ 2.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.31	■■■□□ 2.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.28	■■■□□ 2.44
JMJD1C-211	ENST00000633035	CUX2	O14529	1486 aa		30.21	■■■□□ 2.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.07	■■■□□ 2.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFTR	P13569	1480 aa		30.04	■■■□□ 2.4
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.01	■■■□□ 2.4
JMJD1C-211	ENST00000633035	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
JMJD1C-211	ENST00000633035	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.95	■■■□□ 2.39
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.93	■■■□□ 2.38
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.91	■■■□□ 2.38
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR62	O43379	1518 aa		29.76	■■■□□ 2.36
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.71	■■■□□ 2.35
JMJD1C-211	ENST00000633035	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.61	■■■□□ 2.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.59	■■■□□ 2.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.47	■■■□□ 2.31
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.42	■■■□□ 2.3
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.35	■■■□□ 2.29
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.31	■■■□□ 2.28
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	SOGA1	O94964	1423 aa		29.11	■■■□□ 2.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	CUX1	P39880	1505 aa		29.1	■■■□□ 2.25
JMJD1C-211	ENST00000633035	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.07	■■■□□ 2.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.06	■■■□□ 2.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.05	■■■□□ 2.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
JMJD1C-211	ENST00000633035	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
JMJD1C-211	ENST00000633035	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.92	■■■□□ 2.22
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBLN2	P98095	1184 aa		28.86	■■■□□ 2.21
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.83	■■■□□ 2.21
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.8	■■■□□ 2.2
JMJD1C-211	ENST00000633035	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.76	■■■□□ 2.2
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.76	■■■□□ 2.19
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.76	■■■□□ 2.19
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.76	■■■□□ 2.19
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.74	■■■□□ 2.19
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.72	■■■□□ 2.19
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHD1	O14646	1710 aa		28.67	■■■□□ 2.18
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.63	■■■□□ 2.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.61	■■■□□ 2.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.6	■■■□□ 2.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.58	■■■□□ 2.17
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.45	■■■□□ 2.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.43	■■■□□ 2.14
JMJD1C-211	ENST00000633035	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.4	■■■□□ 2.14
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.37	■■■□□ 2.13
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.36	■■■□□ 2.13
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.36	■■■□□ 2.13
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.35	■■■□□ 2.13
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.34	■■■□□ 2.13
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGF1R	P08069	1367 aa		28.23	■■■□□ 2.11
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUP160	Q12769	1436 aa		28.22	■■■□□ 2.11
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.18	■■■□□ 2.1
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.17	■■■□□ 2.1
JMJD1C-211	ENST00000633035	CUL7	Q14999	1698 aa		28.11	■■■□□ 2.09
JMJD1C-211	ENST00000633035	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.11	■■■□□ 2.09
JMJD1C-211	ENST00000633035	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.07	■■■□□ 2.08
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.97	■■■□□ 2.07
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07

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