Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 415.61■□□□□ 0.095e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-207ENST00000449811 567 ntTSL 412.58□□□□□ -0.45e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 512.06□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 511.04□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-221ENST00000543545 495 ntTSL 59.93□□□□□ -0.825e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.095e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 38.23□□□□□ -1.095e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-216ENST00000536548 598 ntTSL 47.56□□□□□ -1.25e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-224ENST00000544990 646 ntTSL 37.06□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-215ENST00000536145 546 ntTSL 46.88□□□□□ -1.315e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 46.73□□□□□ -1.335e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 36.43□□□□□ -1.385e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 26.15□□□□□ -1.425e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.455e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.515e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.545e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 55.39□□□□□ -1.555e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CCNL1-220ENST00000478454 580 ntTSL 44.71□□□□□ -1.668e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.835e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.135e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.455e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-226ENST00000561314 724 ntTSL 310.55□□□□□ -0.725e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-208ENST00000554627 1571 ntTSL 29.46□□□□□ -0.895e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-211ENST00000556744 1051 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.945e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.965e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-218ENST00000559274 1053 ntTSL 28.77□□□□□ -1.015e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.025e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MARK3-223ENST00000561071 746 ntTSL 36.72□□□□□ -1.335e-8■■■■□ 21
TIAL1Q01085 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.524e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.968e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.078e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.18e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.128e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.128e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.188e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.188e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.188e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.28e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.428e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■■■■□ 21
TIAL1Q01085 HERPUD1-207ENST00000563781 774 ntTSL 35.1□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.494e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AHCYL1-201ENST00000359172 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AHCYL1-206ENST00000481423 732 ntTSL 33.9□□□□□ -1.794e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 530.57■■■□□ 2.496e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.276e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.886e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.576e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.496e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.436e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.366e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 TFAP4-207ENST00000575672 1613 nt22■■□□□ 1.116e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.066e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.976e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.956e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 320.72■□□□□ 0.916e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.856e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.786e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.716e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CFL2-204ENST00000554470 1387 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.696e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CHDH-203ENST00000481668 631 ntTSL 219.23■□□□□ 0.676e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CHDH-202ENST00000467802 565 ntTSL 218.92■□□□□ 0.626e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.66e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AFG3L1P-215ENST00000457926 2919 ntTSL 218.54■□□□□ 0.566e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.566e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AFG3L1P-211ENST00000436447 3003 ntTSL 518.5■□□□□ 0.556e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MATR3-221ENST00000513121 573 ntTSL 218.34■□□□□ 0.536e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.486e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.486e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 MYO19-215ENST00000616159 963 ntTSL 218.01■□□□□ 0.476e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 217.94■□□□□ 0.466e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.386e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 517.29■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AFG3L1P-204ENST00000421164 1706 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.356e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 517.2■□□□□ 0.346e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CADM1-220ENST00000546000 734 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.286e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AMPD2-216ENST00000527846 585 ntTSL 416.81■□□□□ 0.286e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.256e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AMPD2-222ENST00000531203 575 ntTSL 416.5■□□□□ 0.236e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.26e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.176e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 216.1■□□□□ 0.176e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AMPD2-217ENST00000528270 588 ntTSL 415.97■□□□□ 0.156e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AMPD2-212ENST00000486282 582 ntTSL 415.96■□□□□ 0.156e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 PTDSS2-209ENST00000530029 579 ntTSL 215.57■□□□□ 0.086e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.086e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.066e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 AMPD2-223ENST00000531734 572 ntTSL 415.38■□□□□ 0.056e-6■■■■□ 21
TIAL1Q01085 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.056e-6■■■■□ 21
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 118.7 ms