RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393766.6

MSMO1-202, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSMO1, Length 1,789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-202ENST00000393766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.58■■■■□ 3.61
MSMO1-202ENST00000393766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.87■■■□□ 2.85
MSMO1-202ENST00000393766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
MSMO1-202ENST00000393766 ABCC9O60706 1549 aa31.26■■■□□ 2.59
MSMO1-202ENST00000393766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.22■■■□□ 2.59
MSMO1-202ENST00000393766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.02■■■□□ 2.56
MSMO1-202ENST00000393766 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.7■■■□□ 2.51
MSMO1-202ENST00000393766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.66■■■□□ 2.5
MSMO1-202ENST00000393766 NACADO15069 1562 aa30.63■■■□□ 2.49
MSMO1-202ENST00000393766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.44■■■□□ 2.46
MSMO1-202ENST00000393766 SCRIBQ14160 1630 aa30.26■■■□□ 2.43
MSMO1-202ENST00000393766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.85■■■□□ 2.37
MSMO1-202ENST00000393766 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.48■■■□□ 2.31
MSMO1-202ENST00000393766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
MSMO1-202ENST00000393766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
MSMO1-202ENST00000393766 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.22■■■□□ 2.27
MSMO1-202ENST00000393766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
MSMO1-202ENST00000393766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
MSMO1-202ENST00000393766 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.04■■■□□ 2.24
MSMO1-202ENST00000393766 SMARCA4P51532 1647 aa28.95■■■□□ 2.23
MSMO1-202ENST00000393766 WIZO95785 1651 aa28.84■■■□□ 2.21
MSMO1-202ENST00000393766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
MSMO1-202ENST00000393766 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.55■■■□□ 2.16
MSMO1-202ENST00000393766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
MSMO1-202ENST00000393766 SMARCA2P51531 1590 aa28.49■■■□□ 2.15
MSMO1-202ENST00000393766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.48■■■□□ 2.15
MSMO1-202ENST00000393766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
MSMO1-202ENST00000393766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.27■■■□□ 2.12
MSMO1-202ENST00000393766 NCAPD3P42695 1498 aa28.23■■■□□ 2.11
MSMO1-202ENST00000393766 HMGXB3Q12766 1538 aa28.22■■■□□ 2.11
MSMO1-202ENST00000393766 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.2■■■□□ 2.11
MSMO1-202ENST00000393766 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.01■■■□□ 2.07
MSMO1-202ENST00000393766 TRIM41Q8WV44 630 aa27.65■■■□□ 2.02
MSMO1-202ENST00000393766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.63■■■□□ 2.01
MSMO1-202ENST00000393766 ABCC8Q09428 1581 aa27.61■■■□□ 2.01
MSMO1-202ENST00000393766 CFTRP13569 1480 aa27.58■■■□□ 2.01
MSMO1-202ENST00000393766 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.53■■■□□ 2
MSMO1-202ENST00000393766 PRDM2Q13029 1718 aa27.53■■■□□ 2
MSMO1-202ENST00000393766 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
MSMO1-202ENST00000393766 NESP48681 1621 aa27.38■■□□□ 1.97
MSMO1-202ENST00000393766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.35■■□□□ 1.97
MSMO1-202ENST00000393766 SYNJ1O43426 1573 aa27.32■■□□□ 1.96
MSMO1-202ENST00000393766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.26■■□□□ 1.95
MSMO1-202ENST00000393766 TOP2BQ02880 1626 aa27.21■■□□□ 1.95
MSMO1-202ENST00000393766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.19■■□□□ 1.94
MSMO1-202ENST00000393766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
MSMO1-202ENST00000393766 CUX1P39880 1505 aa27.17■■□□□ 1.94
MSMO1-202ENST00000393766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
MSMO1-202ENST00000393766 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.12■■□□□ 1.93
MSMO1-202ENST00000393766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.09■■□□□ 1.93
MSMO1-202ENST00000393766 SOGA1O94964 1423 aa27.03■■□□□ 1.92
MSMO1-202ENST00000393766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.99■■□□□ 1.91
MSMO1-202ENST00000393766 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.97■■□□□ 1.91
MSMO1-202ENST00000393766 TOPBP1Q92547 1522 aa26.94■■□□□ 1.9
MSMO1-202ENST00000393766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.93■■□□□ 1.9
MSMO1-202ENST00000393766 EEA1Q15075 1411 aa26.92■■□□□ 1.9
MSMO1-202ENST00000393766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.92■■□□□ 1.9
MSMO1-202ENST00000393766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
MSMO1-202ENST00000393766 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.86■■□□□ 1.89
MSMO1-202ENST00000393766 ERCC6Q03468 1493 aa26.84■■□□□ 1.89
MSMO1-202ENST00000393766 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.81■■□□□ 1.88
MSMO1-202ENST00000393766 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.81■■□□□ 1.88
MSMO1-202ENST00000393766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
MSMO1-202ENST00000393766 KIF27Q86VH2 1401 aa26.74■■□□□ 1.87
MSMO1-202ENST00000393766 CUX2O14529 1486 aa26.72■■□□□ 1.87
MSMO1-202ENST00000393766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.72■■□□□ 1.87
MSMO1-202ENST00000393766 WDR62O43379 1518 aa26.66■■□□□ 1.86
MSMO1-202ENST00000393766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.64■■□□□ 1.86
MSMO1-202ENST00000393766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
MSMO1-202ENST00000393766 KIF21BO75037 1637 aa26.61■■□□□ 1.85
MSMO1-202ENST00000393766 WDR97A6NE52 1622 aa26.6■■□□□ 1.85
MSMO1-202ENST00000393766 GOLGA3Q08378 1498 aa26.58■■□□□ 1.85
MSMO1-202ENST00000393766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
MSMO1-202ENST00000393766 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
MSMO1-202ENST00000393766 IGF1RP08069 1367 aa26.48■■□□□ 1.83
MSMO1-202ENST00000393766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
MSMO1-202ENST00000393766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
MSMO1-202ENST00000393766 PRXQ9BXM0 1461 aa26.48■■□□□ 1.83
MSMO1-202ENST00000393766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.46■■□□□ 1.83
MSMO1-202ENST00000393766 IFT140Q96RY7 1462 aa26.44■■□□□ 1.82
MSMO1-202ENST00000393766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.44■■□□□ 1.82
MSMO1-202ENST00000393766 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.44■■□□□ 1.82
MSMO1-202ENST00000393766 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
MSMO1-202ENST00000393766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.38■■□□□ 1.81
MSMO1-202ENST00000393766 CUL7Q14999 1698 aa26.35■■□□□ 1.81
MSMO1-202ENST00000393766 PBRM1Q86U86 1689 aa26.34■■□□□ 1.81
MSMO1-202ENST00000393766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.812e-7■■■■□ 23.9
MSMO1-202ENST00000393766 CEP162Q5TB80 1403 aa26.32■■□□□ 1.8
MSMO1-202ENST00000393766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
MSMO1-202ENST00000393766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
MSMO1-202ENST00000393766 GRIN2BQ13224 1484 aa26.23■■□□□ 1.79
MSMO1-202ENST00000393766 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
MSMO1-202ENST00000393766 CLIP1P30622 1438 aa26.15■■□□□ 1.78
MSMO1-202ENST00000393766 ADAMTS12P58397 1594 aa26.14■■□□□ 1.77
MSMO1-202ENST00000393766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.11■■□□□ 1.77
MSMO1-202ENST00000393766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.1■■□□□ 1.77
MSMO1-202ENST00000393766 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.07■■□□□ 1.76
MSMO1-202ENST00000393766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
MSMO1-202ENST00000393766 SYNJ2O15056 1496 aa25.92■■□□□ 1.74
MSMO1-202ENST00000393766 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.92■■□□□ 1.74
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