RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.37■■■□□ 2.77
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.71■■■□□ 2.19
MSMO1-201ENST00000261507 ABCC9O60706 1549 aa27.51■■■□□ 2
MSMO1-201ENST00000261507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
MSMO1-201ENST00000261507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.9■■□□□ 1.9
MSMO1-201ENST00000261507 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.88■■□□□ 1.89
MSMO1-201ENST00000261507 NACADO15069 1562 aa26.88■■□□□ 1.89
MSMO1-201ENST00000261507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.79■■□□□ 1.88
MSMO1-201ENST00000261507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.79■■□□□ 1.88
MSMO1-201ENST00000261507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.11■■□□□ 1.77
MSMO1-201ENST00000261507 SCRIBQ14160 1630 aa26.08■■□□□ 1.77
MSMO1-201ENST00000261507 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.86■■□□□ 1.73
MSMO1-201ENST00000261507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.82■■□□□ 1.72
MSMO1-201ENST00000261507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
MSMO1-201ENST00000261507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MSMO1-201ENST00000261507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
MSMO1-201ENST00000261507 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.07■■□□□ 1.6
MSMO1-201ENST00000261507 SMARCA4P51532 1647 aa25.04■■□□□ 1.6
MSMO1-201ENST00000261507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.96■■□□□ 1.59
MSMO1-201ENST00000261507 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.89■■□□□ 1.57
MSMO1-201ENST00000261507 SMARCA2P51531 1590 aa24.85■■□□□ 1.57
MSMO1-201ENST00000261507 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.83■■□□□ 1.56
MSMO1-201ENST00000261507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.78■■□□□ 1.56
MSMO1-201ENST00000261507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.77■■□□□ 1.56
MSMO1-201ENST00000261507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
MSMO1-201ENST00000261507 NCAPD3P42695 1498 aa24.74■■□□□ 1.55
MSMO1-201ENST00000261507 HMGXB3Q12766 1538 aa24.69■■□□□ 1.54
MSMO1-201ENST00000261507 WIZO95785 1651 aa24.65■■□□□ 1.54
MSMO1-201ENST00000261507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
MSMO1-201ENST00000261507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
MSMO1-201ENST00000261507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MSMO1-201ENST00000261507 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.14■■□□□ 1.46
MSMO1-201ENST00000261507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.06■■□□□ 1.44
MSMO1-201ENST00000261507 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.03■■□□□ 1.44
MSMO1-201ENST00000261507 CFTRP13569 1480 aa23.97■■□□□ 1.43
MSMO1-201ENST00000261507 PRDM2Q13029 1718 aa23.92■■□□□ 1.42
MSMO1-201ENST00000261507 NESP48681 1621 aa23.89■■□□□ 1.42
MSMO1-201ENST00000261507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.88■■□□□ 1.41
MSMO1-201ENST00000261507 ERCC6Q03468 1493 aa23.77■■□□□ 1.4
MSMO1-201ENST00000261507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.73■■□□□ 1.39
MSMO1-201ENST00000261507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.71■■□□□ 1.39
MSMO1-201ENST00000261507 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.7■■□□□ 1.38
MSMO1-201ENST00000261507 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.7■■□□□ 1.38
MSMO1-201ENST00000261507 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.58■■□□□ 1.37
MSMO1-201ENST00000261507 ABCC8Q09428 1581 aa23.55■■□□□ 1.36
MSMO1-201ENST00000261507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MSMO1-201ENST00000261507 WDR62O43379 1518 aa23.48■■□□□ 1.35
MSMO1-201ENST00000261507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.46■■□□□ 1.35
MSMO1-201ENST00000261507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MSMO1-201ENST00000261507 CUX2O14529 1486 aa23.42■■□□□ 1.34
MSMO1-201ENST00000261507 TOPBP1Q92547 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
MSMO1-201ENST00000261507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
MSMO1-201ENST00000261507 CUX1P39880 1505 aa23.34■■□□□ 1.33
MSMO1-201ENST00000261507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.32■■□□□ 1.32
MSMO1-201ENST00000261507 TOP2BQ02880 1626 aa23.32■■□□□ 1.32
MSMO1-201ENST00000261507 SYNJ1O43426 1573 aa23.26■■□□□ 1.31
MSMO1-201ENST00000261507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.22■■□□□ 1.31
MSMO1-201ENST00000261507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
MSMO1-201ENST00000261507 IFT140Q96RY7 1462 aa23.21■■□□□ 1.31
MSMO1-201ENST00000261507 SOGA1O94964 1423 aa23.15■■□□□ 1.3
MSMO1-201ENST00000261507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
MSMO1-201ENST00000261507 WDR97A6NE52 1622 aa23.11■■□□□ 1.29
MSMO1-201ENST00000261507 TRIM41Q8WV44 630 aa23.11■■□□□ 1.29
MSMO1-201ENST00000261507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.06■■□□□ 1.28
MSMO1-201ENST00000261507 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.06■■□□□ 1.28
MSMO1-201ENST00000261507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.05■■□□□ 1.28
MSMO1-201ENST00000261507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MSMO1-201ENST00000261507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.92■■□□□ 1.26
MSMO1-201ENST00000261507 KIF27Q86VH2 1401 aa22.91■■□□□ 1.26
MSMO1-201ENST00000261507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MSMO1-201ENST00000261507 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
MSMO1-201ENST00000261507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.252e-7■■■■□ 23.9
MSMO1-201ENST00000261507 GRIN2BQ13224 1484 aa22.87■■□□□ 1.25
MSMO1-201ENST00000261507 PBRM1Q86U86 1689 aa22.85■■□□□ 1.25
MSMO1-201ENST00000261507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.82■■□□□ 1.24
MSMO1-201ENST00000261507 EEA1Q15075 1411 aa22.82■■□□□ 1.24
MSMO1-201ENST00000261507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
MSMO1-201ENST00000261507 CUL7Q14999 1698 aa22.73■■□□□ 1.23
MSMO1-201ENST00000261507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.72■■□□□ 1.23
MSMO1-201ENST00000261507 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MSMO1-201ENST00000261507 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.7■■□□□ 1.22
MSMO1-201ENST00000261507 IGF1RP08069 1367 aa22.69■■□□□ 1.22
MSMO1-201ENST00000261507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.68■■□□□ 1.22
MSMO1-201ENST00000261507 ADAMTS12P58397 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
MSMO1-201ENST00000261507 SYNJ2O15056 1496 aa22.66■■□□□ 1.22
MSMO1-201ENST00000261507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.66■■□□□ 1.22
MSMO1-201ENST00000261507 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.62■■□□□ 1.21
MSMO1-201ENST00000261507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MSMO1-201ENST00000261507 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.6■■□□□ 1.21
MSMO1-201ENST00000261507 CHD1O14646 1710 aa22.59■■□□□ 1.21
MSMO1-201ENST00000261507 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.59■■□□□ 1.21
MSMO1-201ENST00000261507 GRIN2AQ12879 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
MSMO1-201ENST00000261507 FBLN2P98095 1184 aa22.54■■□□□ 1.2
MSMO1-201ENST00000261507 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.54■■□□□ 1.2
MSMO1-201ENST00000261507 PRXQ9BXM0 1461 aa22.52■■□□□ 1.2
MSMO1-201ENST00000261507 OSCARQ8IYS5 282 aa22.48■■□□□ 1.19
MSMO1-201ENST00000261507 KIF21BO75037 1637 aa22.48■■□□□ 1.19
MSMO1-201ENST00000261507 HRCP23327 699 aa22.45■■□□□ 1.18
MSMO1-201ENST00000261507 NUP160Q12769 1436 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms