RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429723.6

EEF1E1-202, Transcript of eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene EEF1E1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-202ENST00000429723 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.9■■■■■ 4.62
EEF1E1-202ENST00000429723 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.23■■■■□ 3.87
EEF1E1-202ENST00000429723 ABCC9O60706 1549 aa39.02■■■■□ 3.84
EEF1E1-202ENST00000429723 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.23■■■■□ 3.55
EEF1E1-202ENST00000429723 NACADO15069 1562 aa37.05■■■■□ 3.52
EEF1E1-202ENST00000429723 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.02■■■■□ 3.52
EEF1E1-202ENST00000429723 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.62■■■■□ 3.45
EEF1E1-202ENST00000429723 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.42■■■■□ 3.42
EEF1E1-202ENST00000429723 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
EEF1E1-202ENST00000429723 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
EEF1E1-202ENST00000429723 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.41■■■■□ 3.42
EEF1E1-202ENST00000429723 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.26■■■■□ 3.4
EEF1E1-202ENST00000429723 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.15■■■■□ 3.38
EEF1E1-202ENST00000429723 SCRIBQ14160 1630 aa35.79■■■■□ 3.32
EEF1E1-202ENST00000429723 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.64■■■■□ 3.3
EEF1E1-202ENST00000429723 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.24■■■■□ 3.23
EEF1E1-202ENST00000429723 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
EEF1E1-202ENST00000429723 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.1■■■■□ 3.21
EEF1E1-202ENST00000429723 NCAPD3P42695 1498 aa34.22■■■■□ 3.07
EEF1E1-202ENST00000429723 SMARCA4P51532 1647 aa34.17■■■■□ 3.06
EEF1E1-202ENST00000429723 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.15■■■■□ 3.06
EEF1E1-202ENST00000429723 SMARCA2P51531 1590 aa34.05■■■■□ 3.04
EEF1E1-202ENST00000429723 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
EEF1E1-202ENST00000429723 HMGXB3Q12766 1538 aa33.95■■■■□ 3.03
EEF1E1-202ENST00000429723 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.84■■■■□ 3.01
EEF1E1-202ENST00000429723 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.83■■■■□ 3.01
EEF1E1-202ENST00000429723 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3.01
EEF1E1-202ENST00000429723 ERCC6Q03468 1493 aa33.64■■■□□ 2.98
EEF1E1-202ENST00000429723 NESP48681 1621 aa33.61■■■□□ 2.97
EEF1E1-202ENST00000429723 CUX2O14529 1486 aa33.48■■■□□ 2.95
EEF1E1-202ENST00000429723 WIZO95785 1651 aa33.45■■■□□ 2.94
EEF1E1-202ENST00000429723 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.38■■■□□ 2.93
EEF1E1-202ENST00000429723 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
EEF1E1-202ENST00000429723 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.23■■■□□ 2.91
EEF1E1-202ENST00000429723 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.21■■■□□ 2.91
EEF1E1-202ENST00000429723 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.19■■■□□ 2.9
EEF1E1-202ENST00000429723 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
EEF1E1-202ENST00000429723 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.15■■■□□ 2.9
EEF1E1-202ENST00000429723 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
EEF1E1-202ENST00000429723 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.88■■■□□ 2.85
EEF1E1-202ENST00000429723 CFTRP13569 1480 aa32.86■■■□□ 2.85
EEF1E1-202ENST00000429723 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.81■■■□□ 2.84
EEF1E1-202ENST00000429723 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.8■■■□□ 2.84
EEF1E1-202ENST00000429723 WDR62O43379 1518 aa32.77■■■□□ 2.84
EEF1E1-202ENST00000429723 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.67■■■□□ 2.82
EEF1E1-202ENST00000429723 PRDM2Q13029 1718 aa32.54■■■□□ 2.8
EEF1E1-202ENST00000429723 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
EEF1E1-202ENST00000429723 TOPBP1Q92547 1522 aa32.22■■■□□ 2.75
EEF1E1-202ENST00000429723 ABCC8Q09428 1581 aa32.17■■■□□ 2.74
EEF1E1-202ENST00000429723 IFT140Q96RY7 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
EEF1E1-202ENST00000429723 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.11■■■□□ 2.73
EEF1E1-202ENST00000429723 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
EEF1E1-202ENST00000429723 OSCARQ8IYS5 282 aa32.08■■■□□ 2.73
EEF1E1-202ENST00000429723 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
EEF1E1-202ENST00000429723 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
EEF1E1-202ENST00000429723 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
EEF1E1-202ENST00000429723 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
EEF1E1-202ENST00000429723 TRIM41Q8WV44 630 aa31.87■■■□□ 2.69
EEF1E1-202ENST00000429723 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.84■■■□□ 2.699e-7■■□□□ 12.4
EEF1E1-202ENST00000429723 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.81■■■□□ 2.68
EEF1E1-202ENST00000429723 SOGA1O94964 1423 aa31.8■■■□□ 2.68
EEF1E1-202ENST00000429723 CUX1P39880 1505 aa31.77■■■□□ 2.68
EEF1E1-202ENST00000429723 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.75■■■□□ 2.67
EEF1E1-202ENST00000429723 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
EEF1E1-202ENST00000429723 CHD1O14646 1710 aa31.62■■■□□ 2.65
EEF1E1-202ENST00000429723 FBLN2P98095 1184 aa31.61■■■□□ 2.65
EEF1E1-202ENST00000429723 WDR97A6NE52 1622 aa31.57■■■□□ 2.64
EEF1E1-202ENST00000429723 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
EEF1E1-202ENST00000429723 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
EEF1E1-202ENST00000429723 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
EEF1E1-202ENST00000429723 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.5■■■□□ 2.63
EEF1E1-202ENST00000429723 ARHGEF11O15085 1522 aa31.49■■■□□ 2.63
EEF1E1-202ENST00000429723 GRIN2BQ13224 1484 aa31.46■■■□□ 2.63
EEF1E1-202ENST00000429723 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
EEF1E1-202ENST00000429723 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
EEF1E1-202ENST00000429723 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.4■■■□□ 2.62
EEF1E1-202ENST00000429723 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.4■■■□□ 2.62
EEF1E1-202ENST00000429723 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
EEF1E1-202ENST00000429723 PBRM1Q86U86 1689 aa31.33■■■□□ 2.61
EEF1E1-202ENST00000429723 TOP2BQ02880 1626 aa31.32■■■□□ 2.6
EEF1E1-202ENST00000429723 SYNJ2O15056 1496 aa31.32■■■□□ 2.6
EEF1E1-202ENST00000429723 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.31■■■□□ 2.6
EEF1E1-202ENST00000429723 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.31■■■□□ 2.6
EEF1E1-202ENST00000429723 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.31■■■□□ 2.6
EEF1E1-202ENST00000429723 SYNJ1O43426 1573 aa31.3■■■□□ 2.6
EEF1E1-202ENST00000429723 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.25■■■□□ 2.59
EEF1E1-202ENST00000429723 ARAP1Q96P48 1450 aa31.21■■■□□ 2.59
EEF1E1-202ENST00000429723 GRIN2AQ12879 1464 aa31.05■■■□□ 2.56
EEF1E1-202ENST00000429723 ADAMTS12P58397 1594 aa31.05■■■□□ 2.56
EEF1E1-202ENST00000429723 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.01■■■□□ 2.55
EEF1E1-202ENST00000429723 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31■■■□□ 2.55
EEF1E1-202ENST00000429723 NUP160Q12769 1436 aa30.94■■■□□ 2.54
EEF1E1-202ENST00000429723 CEP170Q5SW79 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
EEF1E1-202ENST00000429723 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
EEF1E1-202ENST00000429723 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.81■■■□□ 2.52
EEF1E1-202ENST00000429723 SHROOM2Q13796 1616 aa30.76■■■□□ 2.51
EEF1E1-202ENST00000429723 KIF27Q86VH2 1401 aa30.74■■■□□ 2.51
EEF1E1-202ENST00000429723 IGF1RP08069 1367 aa30.73■■■□□ 2.51
EEF1E1-202ENST00000429723 JPH4Q96JJ6 628 aa30.69■■■□□ 2.5
EEF1E1-202ENST00000429723 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms