Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SC5D-209ENST00000534455 921 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-7■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 SC5D-205ENST00000527762 589 ntTSL 415.24■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 SC5D-207ENST00000531140 767 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-7■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.096e-17■■□□□ 12.2
PRPF4O43172 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 ARPC3-208ENST00000548878 532 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-6■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 GLYCTK-208ENST00000486393 2019 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12.2
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PRPF4O43172 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.783e-7■■□□□ 12.1
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PRPF4O43172 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.068e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 ERCC2-210ENST00000587376 817 ntTSL 514.76□□□□□ -0.058e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.058e-7■■□□□ 12.1
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PRPF4O43172 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.278e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.338e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.338e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.438e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.628e-7■■□□□ 12.1
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PRPF4O43172 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 28.73□□□□□ -1.018e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 58.04□□□□□ -1.128e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 ITFG2-205ENST00000537710 878 ntTSL 36.28□□□□□ -1.48e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 FN3K-205ENST00000574496 594 ntTSL 319.09■□□□□ 0.652e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 FN3K-204ENST00000573841 513 ntTSL 218.67■□□□□ 0.582e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 GAA-205ENST00000572080 723 ntTSL 315.91■□□□□ 0.143e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.493e-7■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-7■■□□□ 12.1
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