RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298537.11

SDCCAG3-201, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-201ENST00000298537 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.21■■■■■ 6.75
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.42■■■■■ 5.5
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
SDCCAG3-201ENST00000298537 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.59■■■■■ 5.21
SDCCAG3-201ENST00000298537 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.46■■■■■ 5.19
SDCCAG3-201ENST00000298537 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.02■■■■■ 5.12
SDCCAG3-201ENST00000298537 ABCC9O60706 1549 aa46.93■■■■■ 5.1
SDCCAG3-201ENST00000298537 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.25■■■■■ 4.99
SDCCAG3-201ENST00000298537 NACADO15069 1562 aa46■■■■■ 4.96
SDCCAG3-201ENST00000298537 SCRIBQ14160 1630 aa45.94■■■■■ 4.95
SDCCAG3-201ENST00000298537 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
SDCCAG3-201ENST00000298537 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.57■■■■■ 4.89
SDCCAG3-201ENST00000298537 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.86■■■■■ 4.77
SDCCAG3-201ENST00000298537 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.69■■■■■ 4.74
SDCCAG3-201ENST00000298537 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
SDCCAG3-201ENST00000298537 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.5■■■■■ 4.711e-6■■■■■ 35.7
SDCCAG3-201ENST00000298537 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.41■■■■■ 4.7
SDCCAG3-201ENST00000298537 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.38■■■■■ 4.7
SDCCAG3-201ENST00000298537 WIZO95785 1651 aa44.05■■■■■ 4.64
SDCCAG3-201ENST00000298537 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
SDCCAG3-201ENST00000298537 SMARCA4P51532 1647 aa43.88■■■■■ 4.62
SDCCAG3-201ENST00000298537 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.88■■■■■ 4.62
SDCCAG3-201ENST00000298537 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
SDCCAG3-201ENST00000298537 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.18■■■■■ 4.5
SDCCAG3-201ENST00000298537 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.12■■■■■ 4.49
SDCCAG3-201ENST00000298537 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.12■■■■■ 4.49
SDCCAG3-201ENST00000298537 SMARCA2P51531 1590 aa43.09■■■■■ 4.49
SDCCAG3-201ENST00000298537 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
SDCCAG3-201ENST00000298537 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
SDCCAG3-201ENST00000298537 TRIM41Q8WV44 630 aa42.81■■■■■ 4.44
SDCCAG3-201ENST00000298537 NCAPD3P42695 1498 aa42.57■■■■■ 4.41
SDCCAG3-201ENST00000298537 ABCC8Q09428 1581 aa42.48■■■■■ 4.39
SDCCAG3-201ENST00000298537 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.46■■■■■ 4.39
SDCCAG3-201ENST00000298537 HMGXB3Q12766 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
SDCCAG3-201ENST00000298537 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
SDCCAG3-201ENST00000298537 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.31■■■■■ 4.36
SDCCAG3-201ENST00000298537 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.97■■■■■ 4.31
SDCCAG3-201ENST00000298537 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.31
SDCCAG3-201ENST00000298537 SYNJ1O43426 1573 aa41.85■■■■■ 4.29
SDCCAG3-201ENST00000298537 CFTRP13569 1480 aa41.79■■■■■ 4.28
SDCCAG3-201ENST00000298537 SOGA1O94964 1423 aa41.78■■■■■ 4.28
SDCCAG3-201ENST00000298537 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.67■■■■■ 4.26
SDCCAG3-201ENST00000298537 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.66■■■■■ 4.26
SDCCAG3-201ENST00000298537 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.6■■■■■ 4.25
SDCCAG3-201ENST00000298537 TOP2BQ02880 1626 aa41.47■■■■■ 4.23
SDCCAG3-201ENST00000298537 CUX1P39880 1505 aa41.42■■■■■ 4.22
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRDM2Q13029 1718 aa41.39■■■■■ 4.22
SDCCAG3-201ENST00000298537 NESP48681 1621 aa41.38■■■■■ 4.21
SDCCAG3-201ENST00000298537 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.38■■■■■ 4.21
SDCCAG3-201ENST00000298537 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.35■■■■■ 4.21
SDCCAG3-201ENST00000298537 EEA1Q15075 1411 aa41.3■■■■■ 4.2
SDCCAG3-201ENST00000298537 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.18■■■■■ 4.18
SDCCAG3-201ENST00000298537 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.98■■■■■ 4.15
SDCCAG3-201ENST00000298537 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
SDCCAG3-201ENST00000298537 GOLGA3Q08378 1498 aa40.94■■■■■ 4.14
SDCCAG3-201ENST00000298537 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
SDCCAG3-201ENST00000298537 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.89■■■■■ 4.14
SDCCAG3-201ENST00000298537 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.88■■■■■ 4.13
SDCCAG3-201ENST00000298537 KIF21BO75037 1637 aa40.85■■■■■ 4.13
SDCCAG3-201ENST00000298537 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.84■■■■■ 4.13
SDCCAG3-201ENST00000298537 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.84■■■■■ 4.13
SDCCAG3-201ENST00000298537 CEP162Q5TB80 1403 aa40.83■■■■■ 4.13
SDCCAG3-201ENST00000298537 KIF27Q86VH2 1401 aa40.78■■■■■ 4.12
SDCCAG3-201ENST00000298537 TOPBP1Q92547 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
SDCCAG3-201ENST00000298537 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.76■■■■■ 4.12
SDCCAG3-201ENST00000298537 CUX2O14529 1486 aa40.73■■■■■ 4.11
SDCCAG3-201ENST00000298537 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.72■■■■■ 4.11
SDCCAG3-201ENST00000298537 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
SDCCAG3-201ENST00000298537 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.68■■■■■ 4.1
SDCCAG3-201ENST00000298537 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.67■■■■■ 4.1
SDCCAG3-201ENST00000298537 PRXQ9BXM0 1461 aa40.65■■■■■ 4.1
SDCCAG3-201ENST00000298537 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
SDCCAG3-201ENST00000298537 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
SDCCAG3-201ENST00000298537 IGF1RP08069 1367 aa40.52■■■■■ 4.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SDCCAG3-201ENST00000298537 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
SDCCAG3-201ENST00000298537 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
SDCCAG3-201ENST00000298537 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
SDCCAG3-201ENST00000298537 CLIP1P30622 1438 aa40.4■■■■■ 4.06
SDCCAG3-201ENST00000298537 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.29■■■■■ 4.04
SDCCAG3-201ENST00000298537 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SDCCAG3-201ENST00000298537 WDR97A6NE52 1622 aa40.22■■■■■ 4.03
SDCCAG3-201ENST00000298537 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.22■■■■■ 4.03
SDCCAG3-201ENST00000298537 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
SDCCAG3-201ENST00000298537 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
SDCCAG3-201ENST00000298537 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.06■■■■■ 4
SDCCAG3-201ENST00000298537 ERCC6Q03468 1493 aa40.04■■■■■ 4
SDCCAG3-201ENST00000298537 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.03■■■■■ 4
SDCCAG3-201ENST00000298537 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.03■■■■■ 4
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARAP1Q96P48 1450 aa40■■■■□ 3.99
SDCCAG3-201ENST00000298537 WDR62O43379 1518 aa39.97■■■■□ 3.99
SDCCAG3-201ENST00000298537 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.91■■■■□ 3.984e-7■■■■□ 22
SDCCAG3-201ENST00000298537 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
SDCCAG3-201ENST00000298537 CUL7Q14999 1698 aa39.91■■■■□ 3.98
SDCCAG3-201ENST00000298537 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
SDCCAG3-201ENST00000298537 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
SDCCAG3-201ENST00000298537 HRCP23327 699 aa39.8■■■■□ 3.96
SDCCAG3-201ENST00000298537 IFT140Q96RY7 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
SDCCAG3-201ENST00000298537 PBRM1Q86U86 1689 aa39.71■■■■□ 3.95
SDCCAG3-201ENST00000298537 P3H3Q8IVL6 736 aa39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms