RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357365.7

SDCCAG3-202, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

APPRIS P4 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-202ENST00000357365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.77■■■■■ 7.64
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SDCCAG3-202ENST00000357365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.08■■■■■ 5.93
SDCCAG3-202ENST00000357365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.61■■■■■ 5.85
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCC9O60706 1549 aa50.97■■■■■ 5.75
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SDCCAG3-202ENST00000357365 SCRIBQ14160 1630 aa50.32■■■■■ 5.65
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SDCCAG3-202ENST00000357365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.69■■■■■ 5.54
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.97■■■■■ 5.43
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SDCCAG3-202ENST00000357365 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.69■■■■■ 5.39
SDCCAG3-202ENST00000357365 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.39■■■■■ 5.34
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.35■■■■■ 5.17
SDCCAG3-202ENST00000357365 SMARCA2P51531 1590 aa47.34■■■■■ 5.17
SDCCAG3-202ENST00000357365 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.3■■■■■ 5.16
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SDCCAG3-202ENST00000357365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.17■■■■■ 5.14
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SDCCAG3-202ENST00000357365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.39■■■■■ 5.02
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SDCCAG3-202ENST00000357365 SYNJ1O43426 1573 aa46.04■■■■■ 4.96
SDCCAG3-202ENST00000357365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46■■■■■ 4.95
SDCCAG3-202ENST00000357365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.91■■■■■ 4.94
SDCCAG3-202ENST00000357365 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.8■■■■■ 4.92
SDCCAG3-202ENST00000357365 CFTRP13569 1480 aa45.72■■■■■ 4.91
SDCCAG3-202ENST00000357365 EEA1Q15075 1411 aa45.66■■■■■ 4.9
SDCCAG3-202ENST00000357365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.64■■■■■ 4.9
SDCCAG3-202ENST00000357365 TOP2BQ02880 1626 aa45.61■■■■■ 4.89
SDCCAG3-202ENST00000357365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.51■■■■■ 4.88
SDCCAG3-202ENST00000357365 CUX1P39880 1505 aa45.44■■■■■ 4.86
SDCCAG3-202ENST00000357365 PRDM2Q13029 1718 aa45.43■■■■■ 4.86
SDCCAG3-202ENST00000357365 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.42■■■■■ 4.86
SDCCAG3-202ENST00000357365 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
SDCCAG3-202ENST00000357365 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.28■■■■■ 4.84
SDCCAG3-202ENST00000357365 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CEP162Q5TB80 1403 aa45.23■■■■■ 4.83
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.15■■■■■ 4.82
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SDCCAG3-202ENST00000357365 HRCP23327 699 aa44.94■■■■■ 4.78
SDCCAG3-202ENST00000357365 KIF27Q86VH2 1401 aa44.85■■■■■ 4.77
SDCCAG3-202ENST00000357365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.8■■■■■ 4.76
SDCCAG3-202ENST00000357365 PRXQ9BXM0 1461 aa44.78■■■■■ 4.76
SDCCAG3-202ENST00000357365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.71■■■■■ 4.75
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SDCCAG3-202ENST00000357365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.66■■■■■ 4.74
SDCCAG3-202ENST00000357365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
SDCCAG3-202ENST00000357365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.61■■■■■ 4.73
SDCCAG3-202ENST00000357365 TOPBP1Q92547 1522 aa44.58■■■■■ 4.73
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SDCCAG3-202ENST00000357365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.47■■■■■ 4.71
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SDCCAG3-202ENST00000357365 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.33■■■■■ 4.69
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.29■■■■■ 4.68
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SDCCAG3-202ENST00000357365 ARAP1Q96P48 1450 aa44.17■■■■■ 4.66
SDCCAG3-202ENST00000357365 WDR97A6NE52 1622 aa44.09■■■■■ 4.65
SDCCAG3-202ENST00000357365 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44■■■■■ 4.63
SDCCAG3-202ENST00000357365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
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SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.89■■■■■ 4.62
SDCCAG3-202ENST00000357365 CUL7Q14999 1698 aa43.86■■■■■ 4.61
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SDCCAG3-202ENST00000357365 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.81■■■■■ 4.6
SDCCAG3-202ENST00000357365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
SDCCAG3-202ENST00000357365 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
SDCCAG3-202ENST00000357365 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
SDCCAG3-202ENST00000357365 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.59■■■■■ 4.57
SDCCAG3-202ENST00000357365 P3H3Q8IVL6 736 aa43.59■■■■■ 4.57
SDCCAG3-202ENST00000357365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.564e-7■■■■□ 22
SDCCAG3-202ENST00000357365 WDR62O43379 1518 aa43.53■■■■■ 4.56
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