RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357365.7

SDCCAG3-202, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

APPRIS P4 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-202ENST00000357365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62,77■■■■■ 7,64
SDCCAG3-202ENST00000357365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54,11■■■■■ 6,25
SDCCAG3-202ENST00000357365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52,86■■■■■ 6,05
SDCCAG3-202ENST00000357365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52,31■■■■■ 5,97
SDCCAG3-202ENST00000357365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52,08■■■■■ 5,93
SDCCAG3-202ENST00000357365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51,61■■■■■ 5,85
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCC9O60706 1549 aa50,97■■■■■ 5,75
SDCCAG3-202ENST00000357365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50,67■■■■■ 5,7
SDCCAG3-202ENST00000357365 MYO15BQ96JP2 1530 aa50,62■■■■■ 5,69
SDCCAG3-202ENST00000357365 SCRIBQ14160 1630 aa50,32■■■■■ 5,65
SDCCAG3-202ENST00000357365 NACADO15069 1562 aa50,25■■■■■ 5,63
SDCCAG3-202ENST00000357365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49,69■■■■■ 5,54
SDCCAG3-202ENST00000357365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49,12■■■■■ 5,45
SDCCAG3-202ENST00000357365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48,99■■■■■ 5,43
SDCCAG3-202ENST00000357365 CECR2Q9BXF3 1484 aa48,97■■■■■ 5,43
SDCCAG3-202ENST00000357365 CHIC1Q5VXU3 224 aa48,75■■■■■ 5,39
SDCCAG3-202ENST00000357365 MROH2BQ7Z745 1585 aa48,69■■■■■ 5,39
SDCCAG3-202ENST00000357365 BICRAQ9NZM4 1560 aa48,39■■■■■ 5,34
SDCCAG3-202ENST00000357365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48,39■■■■■ 5,341e-6■■■■■ 35,7
SDCCAG3-202ENST00000357365 WIZO95785 1651 aa48,38■■■■■ 5,34
SDCCAG3-202ENST00000357365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48,31■■■■■ 5,32
SDCCAG3-202ENST00000357365 SMARCA4P51532 1647 aa48,1■■■■■ 5,29
SDCCAG3-202ENST00000357365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47,65■■■■■ 5,22
SDCCAG3-202ENST00000357365 TRIM41Q8WV44 630 aa47,35■■■■■ 5,17
SDCCAG3-202ENST00000357365 CCDC88BA6NC98 1476 aa47,35■■■■■ 5,17
SDCCAG3-202ENST00000357365 SMARCA2P51531 1590 aa47,34■■■■■ 5,17
SDCCAG3-202ENST00000357365 PEG3Q9GZU2 1588 aa47,3■■■■■ 5,16
SDCCAG3-202ENST00000357365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47,25■■■■■ 5,15
SDCCAG3-202ENST00000357365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47,17■■■■■ 5,14
SDCCAG3-202ENST00000357365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47,13■■■■■ 5,13
SDCCAG3-202ENST00000357365 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46,9■■■■■ 5,1
SDCCAG3-202ENST00000357365 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46,83■■■■■ 5,09
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCC8Q09428 1581 aa46,79■■■■■ 5,08
SDCCAG3-202ENST00000357365 NCAPD3P42695 1498 aa46,46■■■■■ 5,03
SDCCAG3-202ENST00000357365 HMGXB3Q12766 1538 aa46,4■■■■■ 5,02
SDCCAG3-202ENST00000357365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46,39■■■■■ 5,02
SDCCAG3-202ENST00000357365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46,16■■■■■ 4,98
SDCCAG3-202ENST00000357365 SOGA1O94964 1423 aa46,05■■■■■ 4,96
SDCCAG3-202ENST00000357365 SYNJ1O43426 1573 aa46,04■■■■■ 4,96
SDCCAG3-202ENST00000357365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46■■■■■ 4,95
SDCCAG3-202ENST00000357365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45,91■■■■■ 4,94
SDCCAG3-202ENST00000357365 PCGF6Q9BYE7 350 aa45,8■■■■■ 4,92
SDCCAG3-202ENST00000357365 CFTRP13569 1480 aa45,72■■■■■ 4,91
SDCCAG3-202ENST00000357365 EEA1Q15075 1411 aa45,66■■■■■ 4,9
SDCCAG3-202ENST00000357365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45,64■■■■■ 4,9
SDCCAG3-202ENST00000357365 TOP2BQ02880 1626 aa45,61■■■■■ 4,89
SDCCAG3-202ENST00000357365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45,51■■■■■ 4,88
SDCCAG3-202ENST00000357365 CUX1P39880 1505 aa45,44■■■■■ 4,86
SDCCAG3-202ENST00000357365 PRDM2Q13029 1718 aa45,43■■■■■ 4,86
SDCCAG3-202ENST00000357365 CADPSQ9ULU8 1353 aa45,42■■■■■ 4,86
SDCCAG3-202ENST00000357365 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45,3■■■■■ 4,84
SDCCAG3-202ENST00000357365 TNIKQ9UKE5 1360 aa45,28■■■■■ 4,84
SDCCAG3-202ENST00000357365 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45,27■■■■■ 4,84
SDCCAG3-202ENST00000357365 GOLGA3Q08378 1498 aa45,26■■■■■ 4,84
SDCCAG3-202ENST00000357365 CEP162Q5TB80 1403 aa45,23■■■■■ 4,83
SDCCAG3-202ENST00000357365 KIF21BO75037 1637 aa45,16■■■■■ 4,82
SDCCAG3-202ENST00000357365 CEP164Q9UPV0 1460 aa45,15■■■■■ 4,82
SDCCAG3-202ENST00000357365 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45,07■■■■■ 4,81
SDCCAG3-202ENST00000357365 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45,06■■■■■ 4,8
SDCCAG3-202ENST00000357365 NESP48681 1621 aa45,05■■■■■ 4,8
SDCCAG3-202ENST00000357365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45,02■■■■■ 4,8
SDCCAG3-202ENST00000357365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44,98■■■■■ 4,79
SDCCAG3-202ENST00000357365 HRCP23327 699 aa44,94■■■■■ 4,78
SDCCAG3-202ENST00000357365 KIF27Q86VH2 1401 aa44,85■■■■■ 4,77
SDCCAG3-202ENST00000357365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44,8■■■■■ 4,76
SDCCAG3-202ENST00000357365 PRXQ9BXM0 1461 aa44,78■■■■■ 4,76
SDCCAG3-202ENST00000357365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44,71■■■■■ 4,75
SDCCAG3-202ENST00000357365 CUX2O14529 1486 aa44,69■■■■■ 4,74
SDCCAG3-202ENST00000357365 CLIP1P30622 1438 aa44,67■■■■■ 4,74
SDCCAG3-202ENST00000357365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44,66■■■■■ 4,74
SDCCAG3-202ENST00000357365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44,63■■■■■ 4,73
SDCCAG3-202ENST00000357365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44,61■■■■■ 4,73
SDCCAG3-202ENST00000357365 TOPBP1Q92547 1522 aa44,58■■■■■ 4,73
SDCCAG3-202ENST00000357365 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44,56■■■■■ 4,72
SDCCAG3-202ENST00000357365 IGF1RP08069 1367 aa44,48■■■■■ 4,71
SDCCAG3-202ENST00000357365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44,47■■■■■ 4,71
SDCCAG3-202ENST00000357365 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44,46■■■■■ 4,71
SDCCAG3-202ENST00000357365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44,43■■■■■ 4,7
SDCCAG3-202ENST00000357365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44,39■■■■■ 4,7
SDCCAG3-202ENST00000357365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44,37■■■■■ 4,69
SDCCAG3-202ENST00000357365 VPS8Q8N3P4 1428 aa44,33■■■■■ 4,69
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44,29■■■■■ 4,68
SDCCAG3-202ENST00000357365 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44,26■■■■■ 4,68
SDCCAG3-202ENST00000357365 ARAP1Q96P48 1450 aa44,17■■■■■ 4,66
SDCCAG3-202ENST00000357365 WDR97A6NE52 1622 aa44,09■■■■■ 4,65
SDCCAG3-202ENST00000357365 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44■■■■■ 4,63
SDCCAG3-202ENST00000357365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43,98■■■■■ 4,63
SDCCAG3-202ENST00000357365 APLP2Q06481 763 aa43,93■■■■■ 4,62
SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43,89■■■■■ 4,62
SDCCAG3-202ENST00000357365 CUL7Q14999 1698 aa43,86■■■■■ 4,61
SDCCAG3-202ENST00000357365 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43,82■■■■■ 4,61
SDCCAG3-202ENST00000357365 GAPVD1Q14C86 1478 aa43,81■■■■■ 4,6
SDCCAG3-202ENST00000357365 MRC2Q9UBG0 1479 aa43,81■■■■■ 4,6
SDCCAG3-202ENST00000357365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43,74■■■■■ 4,59
SDCCAG3-202ENST00000357365 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43,67■■■■■ 4,58
SDCCAG3-202ENST00000357365 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43,66■■■■■ 4,58
SDCCAG3-202ENST00000357365 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43,59■■■■■ 4,57
SDCCAG3-202ENST00000357365 P3H3Q8IVL6 736 aa43,59■■■■■ 4,57
SDCCAG3-202ENST00000357365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43,55■■■■■ 4,564e-7■■■■□ 22
SDCCAG3-202ENST00000357365 WDR62O43379 1518 aa43,53■■■■■ 4,56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10,5 ms