RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371725.7

SDCCAG3-204, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-204ENST00000371725 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.07■■■■■ 7.69
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SDCCAG3-204ENST00000371725 CUX2O14529 1486 aa44.85■■■■■ 4.77
SDCCAG3-204ENST00000371725 KIF21BO75037 1637 aa44.79■■■■■ 4.76
SDCCAG3-204ENST00000371725 GOLGA3Q08378 1498 aa44.79■■■■■ 4.76
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SDCCAG3-204ENST00000371725 WDR97A6NE52 1622 aa44.53■■■■■ 4.72
SDCCAG3-204ENST00000371725 CEP162Q5TB80 1403 aa44.51■■■■■ 4.72
SDCCAG3-204ENST00000371725 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.44■■■■■ 4.7
SDCCAG3-204ENST00000371725 WDR62O43379 1518 aa44.44■■■■■ 4.7
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SDCCAG3-204ENST00000371725 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.3■■■■■ 4.68
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SDCCAG3-204ENST00000371725 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.13■■■■■ 4.654e-7■■■■□ 22
SDCCAG3-204ENST00000371725 IFT140Q96RY7 1462 aa44.1■■■■■ 4.65
SDCCAG3-204ENST00000371725 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
SDCCAG3-204ENST00000371725 CUL7Q14999 1698 aa44.07■■■■■ 4.65
SDCCAG3-204ENST00000371725 PBRM1Q86U86 1689 aa44■■■■■ 4.63
SDCCAG3-204ENST00000371725 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
SDCCAG3-204ENST00000371725 GRIN2BQ13224 1484 aa43.82■■■■■ 4.6
SDCCAG3-204ENST00000371725 ARAP1Q96P48 1450 aa43.75■■■■■ 4.59
SDCCAG3-204ENST00000371725 ADAMTS12P58397 1594 aa43.73■■■■■ 4.59
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