Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-18■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 HECTD1-216ENST00000557321 571 ntTSL 37.76□□□□□ -1.171e-9■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DEPDC5-221ENST00000497340 288 ntTSL 55.58□□□□□ -1.524e-18■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 ERCC6L2-202ENST00000320486 2936 ntTSL 1 (best)5.58□□□□□ -1.521e-9■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-212ENST00000576180 2288 ntTSL 212.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-209ENST00000574393 577 ntTSL 311.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.183e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.193e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.588e-9■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.598e-9■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.598e-9■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-22■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-206ENST00000527902 619 ntTSL 316.61■□□□□ 0.258e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-216ENST00000533499 936 ntTSL 516.35■□□□□ 0.218e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.158e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-214ENST00000533048 922 ntTSL 514.07□□□□□ -0.168e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.688e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-205ENST00000527497 529 ntTSL 27.37□□□□□ -1.238e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-207ENST00000546636 2125 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-225ENST00000551215 609 ntTSL 58.02□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 61.8
PUM2Q8TB72 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 61.8
PUM2Q8TB72 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
PUM2Q8TB72 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 61.7
PUM2Q8TB72 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 61.6
PUM2Q8TB72 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 61.6
PUM2Q8TB72 SNIP1-204ENST00000638725 2761 ntTSL 210.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 61.6
PUM2Q8TB72 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-10■■■■■ 61.5
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PUM2Q8TB72 CCDC162P-215ENST00000640771 4195 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 EIF4ENIF1-209ENST00000441289 597 ntTSL 39.5□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-12■■■■■ 61.4
PUM2Q8TB72 SLU7-207ENST00000521320 492 ntTSL 24.92□□□□□ -1.621e-12■■■■■ 61.4
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PUM2Q8TB72 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 61.3
PUM2Q8TB72 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-323■■■■■ 61.3
PUM2Q8TB72 NR1D2-205ENST00000492552 1981 ntTSL 222.1■■□□□ 1.135e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NR1D2-202ENST00000383773 3129 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.385e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.655e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 C6orf136-205ENST00000460172 253 ntTSL 210.82□□□□□ -0.685e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NIN-210ENST00000476352 10225 ntTSL 55.37□□□□□ -1.555e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 CCDC186-204ENST00000428953 1576 ntTSL 24.4□□□□□ -1.75e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 ZNF639-203ENST00000466663 814 ntTSL 37.91□□□□□ -1.144e-27■■■■■ 61.1
PUM2Q8TB72 ATP13A3-202ENST00000429136 3729 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.596e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.666e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.86e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.16e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 220.2■□□□□ 0.821e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 60.7
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PUM2Q8TB72 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 60.6
PUM2Q8TB72 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 60.6
PUM2Q8TB72 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 320.05■□□□□ 0.83e-74■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-74■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-202ENST00000545307 1602 ntTSL 518.54■□□□□ 0.564e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-204ENST00000554402 1544 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.54e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-207ENST00000555229 1517 ntTSL 517.42■□□□□ 0.384e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.274e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-203ENST00000553907 780 ntTSL 310.4□□□□□ -0.744e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-205ENST00000554642 687 ntTSL 38.34□□□□□ -1.074e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-216ENST00000557711 1584 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.494e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-214ENST00000542027 1841 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-223ENST00000566850 1016 ntTSL 210.82□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.692e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.412e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-18■■■■■ 60.1
PUM2Q8TB72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.232e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 MED17-220ENST00000639596 2108 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 MED17-219ENST00000639523 2137 ntTSL 59.71□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 MED17-223ENST00000640077 2210 ntTSL 55.44□□□□□ -1.542e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-17■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.712e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-201ENST00000219084 8739 ntTSL 1 (best)4.21□□□□□ -1.732e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.912e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.952e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.972e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.992e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.981e-17■■■■■ 59.7
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 441.8 ms