RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232424.3

HES1-201, Transcript of hes family bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HES1, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES1-201ENST00000232424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.3■■■■■ 4.36
HES1-201ENST00000232424 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.37■■■■□ 3.57
HES1-201ENST00000232424 ABCC9O60706 1549 aa36.46■■■■□ 3.43
HES1-201ENST00000232424 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.31■■■■□ 3.24
HES1-201ENST00000232424 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
HES1-201ENST00000232424 NACADO15069 1562 aa35.14■■■■□ 3.22
HES1-201ENST00000232424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.11■■■■□ 3.21
HES1-201ENST00000232424 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.02■■■■□ 3.2
HES1-201ENST00000232424 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.98■■■■□ 3.19
HES1-201ENST00000232424 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.27■■■■□ 3.08
HES1-201ENST00000232424 SCRIBQ14160 1630 aa34.21■■■■□ 3.07
HES1-201ENST00000232424 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
HES1-201ENST00000232424 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.09■■■■□ 3.05
HES1-201ENST00000232424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.67■■■□□ 2.98
HES1-201ENST00000232424 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.34■■■□□ 2.93
HES1-201ENST00000232424 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
HES1-201ENST00000232424 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.98■■■□□ 2.87
HES1-201ENST00000232424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.95■■■□□ 2.86
HES1-201ENST00000232424 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
HES1-201ENST00000232424 SMARCA4P51532 1647 aa32.72■■■□□ 2.83
HES1-201ENST00000232424 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.63■■■□□ 2.81
HES1-201ENST00000232424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
HES1-201ENST00000232424 NCAPD3P42695 1498 aa32.48■■■□□ 2.79
HES1-201ENST00000232424 SMARCA2P51531 1590 aa32.45■■■□□ 2.79
HES1-201ENST00000232424 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.41■■■□□ 2.78
HES1-201ENST00000232424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
HES1-201ENST00000232424 HMGXB3Q12766 1538 aa32.28■■■□□ 2.76
HES1-201ENST00000232424 WIZO95785 1651 aa32.25■■■□□ 2.75
HES1-201ENST00000232424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
HES1-201ENST00000232424 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
HES1-201ENST00000232424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
HES1-201ENST00000232424 NESP48681 1621 aa31.64■■■□□ 2.66
HES1-201ENST00000232424 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.59■■■□□ 2.65
HES1-201ENST00000232424 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.56■■■□□ 2.64
HES1-201ENST00000232424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.51■■■□□ 2.64
HES1-201ENST00000232424 CFTRP13569 1480 aa31.42■■■□□ 2.62
HES1-201ENST00000232424 ERCC6Q03468 1493 aa31.36■■■□□ 2.61
HES1-201ENST00000232424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.34■■■□□ 2.61
HES1-201ENST00000232424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.18■■■□□ 2.58
HES1-201ENST00000232424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.17■■■□□ 2.58
HES1-201ENST00000232424 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.08■■■□□ 2.57
HES1-201ENST00000232424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
HES1-201ENST00000232424 PRDM2Q13029 1718 aa31.02■■■□□ 2.56
HES1-201ENST00000232424 MRC2Q9UBG0 1479 aa31■■■□□ 2.55
HES1-201ENST00000232424 CUX2O14529 1486 aa30.92■■■□□ 2.54
HES1-201ENST00000232424 WDR62O43379 1518 aa30.88■■■□□ 2.53
HES1-201ENST00000232424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HES1-201ENST00000232424 TOPBP1Q92547 1522 aa30.7■■■□□ 2.51
HES1-201ENST00000232424 ABCC8Q09428 1581 aa30.67■■■□□ 2.5
HES1-201ENST00000232424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.65■■■□□ 2.5
HES1-201ENST00000232424 CUX1P39880 1505 aa30.59■■■□□ 2.49
HES1-201ENST00000232424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
HES1-201ENST00000232424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
HES1-201ENST00000232424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.43■■■□□ 2.46
HES1-201ENST00000232424 IFT140Q96RY7 1462 aa30.43■■■□□ 2.46
HES1-201ENST00000232424 SYNJ1O43426 1573 aa30.38■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 SOGA1O94964 1423 aa30.37■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.37■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 TOP2BQ02880 1626 aa30.34■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.31■■■□□ 2.44
HES1-201ENST00000232424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.434e-7■■■■■ 39.2
HES1-201ENST00000232424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HES1-201ENST00000232424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.14■■■□□ 2.42
HES1-201ENST00000232424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
HES1-201ENST00000232424 WDR97A6NE52 1622 aa30.08■■■□□ 2.41
HES1-201ENST00000232424 GAPVD1Q14C86 1478 aa30■■■□□ 2.39
HES1-201ENST00000232424 TRIM41Q8WV44 630 aa29.98■■■□□ 2.39
HES1-201ENST00000232424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.96■■■□□ 2.39
HES1-201ENST00000232424 GRIN2BQ13224 1484 aa29.95■■■□□ 2.38
HES1-201ENST00000232424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.89■■■□□ 2.37
HES1-201ENST00000232424 PBRM1Q86U86 1689 aa29.82■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.81■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 KIF27Q86VH2 1401 aa29.81■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 FBLN2P98095 1184 aa29.78■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 OSCARQ8IYS5 282 aa29.77■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.77■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.76■■■□□ 2.35
HES1-201ENST00000232424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
HES1-201ENST00000232424 IGF1RP08069 1367 aa29.73■■■□□ 2.35
HES1-201ENST00000232424 SYNJ2O15056 1496 aa29.72■■■□□ 2.35
HES1-201ENST00000232424 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.69■■■□□ 2.34
HES1-201ENST00000232424 CHD1O14646 1710 aa29.67■■■□□ 2.34
HES1-201ENST00000232424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.66■■■□□ 2.34
HES1-201ENST00000232424 ADAMTS12P58397 1594 aa29.66■■■□□ 2.34
HES1-201ENST00000232424 GRIN2AQ12879 1464 aa29.56■■■□□ 2.32
HES1-201ENST00000232424 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.53■■■□□ 2.32
HES1-201ENST00000232424 CUL7Q14999 1698 aa29.49■■■□□ 2.31
HES1-201ENST00000232424 NUP160Q12769 1436 aa29.44■■■□□ 2.3
HES1-201ENST00000232424 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
HES1-201ENST00000232424 CEP170Q5SW79 1584 aa29.4■■■□□ 2.3
HES1-201ENST00000232424 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.4■■■□□ 2.3
HES1-201ENST00000232424 EEA1Q15075 1411 aa29.39■■■□□ 2.3
HES1-201ENST00000232424 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
HES1-201ENST00000232424 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.35■■■□□ 2.29
HES1-201ENST00000232424 PRXQ9BXM0 1461 aa29.33■■■□□ 2.29
HES1-201ENST00000232424 ARHGEF11O15085 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
HES1-201ENST00000232424 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms