RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541134.5

HIVEP1-208, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-208ENST00000541134 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.96■■□□□ 1.11
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HIVEP1-208ENST00000541134 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HIVEP1-208ENST00000541134 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.16■□□□□ 0.82
HIVEP1-208ENST00000541134 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.01■□□□□ 0.79
HIVEP1-208ENST00000541134 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
HIVEP1-208ENST00000541134 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
HIVEP1-208ENST00000541134 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
HIVEP1-208ENST00000541134 APLP2Q06481 763 aa18.89■□□□□ 0.61
HIVEP1-208ENST00000541134 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
HIVEP1-208ENST00000541134 TRIM41Q8WV44 630 aa18.56■□□□□ 0.56
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HIVEP1-208ENST00000541134 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
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HIVEP1-208ENST00000541134 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HIVEP1-208ENST00000541134 ABCC9O60706 1549 aa18.33■□□□□ 0.52
HIVEP1-208ENST00000541134 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.28■□□□□ 0.52
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HIVEP1-208ENST00000541134 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.13■□□□□ 0.49
HIVEP1-208ENST00000541134 ITGAEP38570 1179 aa18.05■□□□□ 0.48
HIVEP1-208ENST00000541134 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HIVEP1-208ENST00000541134 FBLN2P98095 1184 aa17.86■□□□□ 0.45
HIVEP1-208ENST00000541134 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.81■□□□□ 0.44
HIVEP1-208ENST00000541134 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.81■□□□□ 0.44
HIVEP1-208ENST00000541134 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
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HIVEP1-208ENST00000541134 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
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HIVEP1-208ENST00000541134 P3H3Q8IVL6 736 aa17.48■□□□□ 0.39
HIVEP1-208ENST00000541134 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.44■□□□□ 0.38
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HIVEP1-208ENST00000541134 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
HIVEP1-208ENST00000541134 BCANQ96GW7 911 aa17.26■□□□□ 0.35
HIVEP1-208ENST00000541134 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
HIVEP1-208ENST00000541134 NEUROD1Q13562 356 aa17.23■□□□□ 0.35
HIVEP1-208ENST00000541134 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
HIVEP1-208ENST00000541134 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HIVEP1-208ENST00000541134 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.21■□□□□ 0.35
HIVEP1-208ENST00000541134 SCRIBQ14160 1630 aa17.17■□□□□ 0.34
HIVEP1-208ENST00000541134 NEFLP07196 543 aa17.17■□□□□ 0.34
HIVEP1-208ENST00000541134 SLC24A1O60721 1099 aa17.01■□□□□ 0.31
HIVEP1-208ENST00000541134 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
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HIVEP1-208ENST00000541134 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.93■□□□□ 0.3
HIVEP1-208ENST00000541134 BCL11AQ9H165 835 aa16.9■□□□□ 0.3
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HIVEP1-208ENST00000541134 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
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HIVEP1-208ENST00000541134 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HIVEP1-208ENST00000541134 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HIVEP1-208ENST00000541134 A0A0G2JS52 829 aa16.58■□□□□ 0.24
HIVEP1-208ENST00000541134 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.57■□□□□ 0.24
HIVEP1-208ENST00000541134 ERCC6Q03468 1493 aa16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1-208ENST00000541134 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1-208ENST00000541134 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.56■□□□□ 0.24
HIVEP1-208ENST00000541134 ANP32CO43423 234 aa16.53■□□□□ 0.24
HIVEP1-208ENST00000541134 NEFMP07197 916 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-208ENST00000541134 TSPY4P0CV99 314 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-208ENST00000541134 TSPY10P0CW01 314 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-208ENST00000541134 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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HIVEP1-208ENST00000541134 C14orf37Q86TY3 774 aa16.44■□□□□ 0.22
HIVEP1-208ENST00000541134 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HIVEP1-208ENST00000541134 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.41■□□□□ 0.22
HIVEP1-208ENST00000541134 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.39■□□□□ 0.21
HIVEP1-208ENST00000541134 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HIVEP1-208ENST00000541134 MLECQ14165 292 aa16.39■□□□□ 0.21
HIVEP1-208ENST00000541134 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HIVEP1-208ENST00000541134 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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HIVEP1-208ENST00000541134 MYT1Q01538 1121 aa16.34■□□□□ 0.21
HIVEP1-208ENST00000541134 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.33■□□□□ 0.2
HIVEP1-208ENST00000541134 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HIVEP1-208ENST00000541134 TONSLQ96HA7 1378 aa16.33■□□□□ 0.2
HIVEP1-208ENST00000541134 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HIVEP1-208ENST00000541134 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.25■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.25■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.24■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 NACADO15069 1562 aa16.22■□□□□ 0.19
HIVEP1-208ENST00000541134 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.21■□□□□ 0.19
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