Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.736e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.816e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.46e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 DDIT3-206ENST00000623876 1151 nt6.21□□□□□ -1.426e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.24e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 SIPA1-204ENST00000528699 548 ntTSL 29.87□□□□□ -0.834e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-23■■■■■ 290.8
PUM2Q8TB72 NINJ1-204ENST00000489274 2026 ntTSL 214.02□□□□□ -0.173e-23■■■■■ 290.8
PUM2Q8TB72 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 243.9
PUM2Q8TB72 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt14.45□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 243.9
PUM2Q8TB72 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 243.9
PUM2Q8TB72 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 234.4
PUM2Q8TB72 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 234.4
PUM2Q8TB72 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-203ENST00000416215 2412 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-209ENST00000537533 673 ntTSL 311.54□□□□□ -0.561e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-212ENST00000539029 705 ntTSL 39.15□□□□□ -0.941e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.55□□□□□ -22e-9■■■■■ 203.7
PUM2Q8TB72 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.525e-11■■■■■ 192.2
PUM2Q8TB72 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.114e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.43e-22■■■■■ 187.1
PUM2Q8TB72 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.483e-22■■■■■ 187.1
PUM2Q8TB72 HIRIP3-202ENST00000563053 1686 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-16■■■■■ 175.9
PUM2Q8TB72 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-16■■■■■ 175.9
PUM2Q8TB72 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.594e-16■■■■■ 175.9
PUM2Q8TB72 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.9■□□□□ 0.944e-17■■■■■ 173.4
PUM2Q8TB72 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.57□□□□□ -1.364e-17■■■■■ 173.4
PUM2Q8TB72 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-17■■■■■ 166.7
PUM2Q8TB72 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 164.4
PUM2Q8TB72 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 164.4
PUM2Q8TB72 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.759e-9■■■■■ 161.4
PUM2Q8TB72 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 520.86■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 214.07□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 RGS14-202ENST00000425155 2329 ntTSL 218.69■□□□□ 0.585e-22■■■■■ 148.7
PUM2Q8TB72 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.275e-22■■■■■ 148.7
PUM2Q8TB72 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.155e-38■■■■■ 148.1
PUM2Q8TB72 BAP1-204ENST00000469613 1654 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.135e-38■■■■■ 148.1
PUM2Q8TB72 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.765e-38■■■■■ 148.1
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PUM2Q8TB72 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 513.21□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.634e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.764e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.578e-83■■■■■ 145.6
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PUM2Q8TB72 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 144.4
PUM2Q8TB72 SFSWAP-208ENST00000539506 3149 ntTSL 512□□□□□ -0.499e-8■■■■■ 144.4
PUM2Q8TB72 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.094e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.094e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.234e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 PRF1-204ENST00000639390 523 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.428e-15■■■■■ 141.3
PUM2Q8TB72 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.3□□□□□ -1.46e-28■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-208ENST00000557732 623 ntTSL 211.28□□□□□ -0.64e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-209ENST00000612614 3538 nt11.09□□□□□ -0.634e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.684e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.694e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.554e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-33■■■■■ 139.9
PUM2Q8TB72 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-33■■■■■ 139.9
PUM2Q8TB72 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.113e-12■■■■■ 138.8
PUM2Q8TB72 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-12■■■■■ 138.8
PUM2Q8TB72 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 223.29■■□□□ 1.321e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.941e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.91e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 216.14■□□□□ 0.171e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 DGKD-204ENST00000430834 5379 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.072e-32■■■■■ 136.3
PUM2Q8TB72 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-32■■■■■ 136.3
PUM2Q8TB72 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-32■■■■■ 136.3
PUM2Q8TB72 CASP8AP2-204ENST00000548224 1300 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 134.6
PUM2Q8TB72 CASP8AP2-201ENST00000237177 6719 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 134.6
PUM2Q8TB72 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 133.4
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