Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.557e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-206ENST00000564476 890 ntTSL 318.43■□□□□ 0.547e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 518.27■□□□□ 0.527e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.57e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RFFL-211ENST00000584541 563 ntTSL 418■□□□□ 0.477e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-208ENST00000566059 1615 ntTSL 517.68■□□□□ 0.427e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.397e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.397e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.37e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-211ENST00000568829 780 ntTSL 516.63■□□□□ 0.257e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 AC004223.3-202ENST00000591723 676 ntTSL 516.55■□□□□ 0.247e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.237e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.227e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.187e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNHG17-205ENST00000424235 764 ntTSL 216.1■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.157e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.127e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.117e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.17e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPNS1-205ENST00000561868 441 ntTSL 515.45■□□□□ 0.067e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.047e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 AC004223.3-203ENST00000592181 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.04■□□□□ -07e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.057e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-210ENST00000584968 908 ntTSL 514.72□□□□□ -0.057e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.117e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 FAM45A-209ENST00000497903 699 ntTSL 214.18□□□□□ -0.147e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.247e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 313.45□□□□□ -0.267e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.317e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FAM45A-204ENST00000472379 984 ntTSL 213.11□□□□□ -0.317e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNHG17-202ENST00000414142 2102 ntTSL 213.09□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.347e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.377e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.557e-10■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.567e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.67e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RFFL-204ENST00000414419 559 ntTSL 411.17□□□□□ -0.627e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPAG9-213ENST00000511987 1298 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.627e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.77e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RFFL-209ENST00000581265 596 ntTSL 410.59□□□□□ -0.717e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 RFFL-212ENST00000584655 4039 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.847e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.887e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNRPN-204ENST00000400098 525 ntTSL 48.81□□□□□ -17e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 MCEE-203ENST00000462609 633 ntTSL 38.73□□□□□ -1.017e-10■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.147e-7■■□□□ 13.2
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ILF3Q12906 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.177e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 37.45□□□□□ -1.227e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 NHSL1-208ENST00000533765 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.11□□□□□ -1.278e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 26.7□□□□□ -1.347e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 TTC17-206ENST00000525135 1048 ntTSL 26.57□□□□□ -1.367e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.387e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 56.31□□□□□ -1.47e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 WWP1-203ENST00000518683 2002 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.517e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 TTC17-203ENST00000418561 575 ntTSL 35.36□□□□□ -1.557e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 MCEE-202ENST00000413592 523 ntTSL 25.05□□□□□ -1.67e-10■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 TTC17-207ENST00000525543 3142 ntTSL 24.97□□□□□ -1.617e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.657e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-212ENST00000529760 1153 ntTSL 54.48□□□□□ -1.697e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPAG9-203ENST00000502329 528 ntTSL 24.35□□□□□ -1.717e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-220ENST00000532603 566 ntTSL 44.28□□□□□ -1.727e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-205ENST00000526548 738 ntTSL 1 (best)4.14□□□□□ -1.757e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 24.11□□□□□ -1.757e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 BZW1-201ENST00000359893 779 ntTSL 33.91□□□□□ -1.787e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-214ENST00000530692 963 ntTSL 53.81□□□□□ -1.87e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 WWP1-204ENST00000520374 681 ntTSL 53.8□□□□□ -1.87e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 33.76□□□□□ -1.817e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-207ENST00000526961 802 ntTSL 53.68□□□□□ -1.827e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SPAG9-221ENST00000576492 554 ntTSL 53.38□□□□□ -1.877e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.97e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 WWP1-208ENST00000521079 519 ntTSL 52.83□□□□□ -1.967e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.097e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SEPT9-245ENST00000592481 1291 ntTSL 520.44■□□□□ 0.862e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 217.73■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 412.18□□□□□ -0.463e-7■■□□□ 13.2
ILF3Q12906 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.953e-9■■□□□ 13.2
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