RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.31■■■■■ 4.2
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.4■■■■□ 3.26
SPNS1-201ENST00000311008 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
SPNS1-201ENST00000311008 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.61■■■■□ 3.13
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.13■■■■□ 3.05
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.91■■■■□ 3.02
SPNS1-201ENST00000311008 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
SPNS1-201ENST00000311008 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.29■■■□□ 2.92
SPNS1-201ENST00000311008 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.02■■■□□ 2.88
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC9O60706 1549 aa32.89■■■□□ 2.86
SPNS1-201ENST00000311008 SCRIBQ14160 1630 aa32.8■■■□□ 2.84
SPNS1-201ENST00000311008 NACADO15069 1562 aa32.76■■■□□ 2.83
SPNS1-201ENST00000311008 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
SPNS1-201ENST00000311008 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.24■■■□□ 2.75
SPNS1-201ENST00000311008 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.03■■■□□ 2.72
SPNS1-201ENST00000311008 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.97■■■□□ 2.71
SPNS1-201ENST00000311008 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.83■■■□□ 2.69
SPNS1-201ENST00000311008 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM41Q8WV44 630 aa31.79■■■□□ 2.68
SPNS1-201ENST00000311008 WIZO95785 1651 aa31.75■■■□□ 2.67
SPNS1-201ENST00000311008 HRCP23327 699 aa31.64■■■□□ 2.66
SPNS1-201ENST00000311008 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.63■■■□□ 2.65
SPNS1-201ENST00000311008 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-201ENST00000311008 SMARCA4P51532 1647 aa31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-201ENST00000311008 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
SPNS1-201ENST00000311008 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
SPNS1-201ENST00000311008 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.21■■■□□ 2.59
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.19■■■□□ 2.58
SPNS1-201ENST00000311008 SMARCA2P51531 1590 aa31.19■■■□□ 2.58
SPNS1-201ENST00000311008 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.04■■■□□ 2.56
SPNS1-201ENST00000311008 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC8Q09428 1581 aa30.89■■■□□ 2.54
SPNS1-201ENST00000311008 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.78■■■□□ 2.52
SPNS1-201ENST00000311008 EEA1Q15075 1411 aa30.76■■■□□ 2.52
SPNS1-201ENST00000311008 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.73■■■□□ 2.51
SPNS1-201ENST00000311008 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SPNS1-201ENST00000311008 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
SPNS1-201ENST00000311008 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SPNS1-201ENST00000311008 SOGA1O94964 1423 aa30.59■■■□□ 2.49
SPNS1-201ENST00000311008 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
SPNS1-201ENST00000311008 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.53■■■□□ 2.48
SPNS1-201ENST00000311008 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.53■■■□□ 2.48
SPNS1-201ENST00000311008 CEP162Q5TB80 1403 aa30.45■■■□□ 2.46
SPNS1-201ENST00000311008 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.38■■■□□ 2.45
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA3Q08378 1498 aa30.38■■■□□ 2.45
SPNS1-201ENST00000311008 SYNJ1O43426 1573 aa30.37■■■□□ 2.45
SPNS1-201ENST00000311008 HMGXB3Q12766 1538 aa30.28■■■□□ 2.44
SPNS1-201ENST00000311008 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SPNS1-201ENST00000311008 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.26■■■□□ 2.44
SPNS1-201ENST00000311008 NCAPD3P42695 1498 aa30.26■■■□□ 2.43
SPNS1-201ENST00000311008 KIF21BO75037 1637 aa30.25■■■□□ 2.43
SPNS1-201ENST00000311008 TOP2BQ02880 1626 aa30.16■■■□□ 2.42
SPNS1-201ENST00000311008 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.07■■■□□ 2.4
SPNS1-201ENST00000311008 CLIP1P30622 1438 aa29.96■■■□□ 2.39
SPNS1-201ENST00000311008 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SPNS1-201ENST00000311008 CFTRP13569 1480 aa29.91■■■□□ 2.38
SPNS1-201ENST00000311008 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.9■■■□□ 2.38
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SPNS1-201ENST00000311008 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-201ENST00000311008 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-201ENST00000311008 CUX1P39880 1505 aa29.81■■■□□ 2.36
SPNS1-201ENST00000311008 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
SPNS1-201ENST00000311008 PRXQ9BXM0 1461 aa29.78■■■□□ 2.36
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM2Q13029 1718 aa29.73■■■□□ 2.35
SPNS1-201ENST00000311008 KIF27Q86VH2 1401 aa29.72■■■□□ 2.35
SPNS1-201ENST00000311008 APLP2Q06481 763 aa29.68■■■□□ 2.34
SPNS1-201ENST00000311008 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.6■■■□□ 2.33
SPNS1-201ENST00000311008 ARAP1Q96P48 1450 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-201ENST00000311008 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-201ENST00000311008 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-201ENST00000311008 CUX2O14529 1486 aa29.38■■■□□ 2.29
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SPNS1-201ENST00000311008 IGF1RP08069 1367 aa29.34■■■□□ 2.29
SPNS1-201ENST00000311008 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.27■■■□□ 2.28
SPNS1-201ENST00000311008 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.26■■■□□ 2.28
SPNS1-201ENST00000311008 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.22■■■□□ 2.27
SPNS1-201ENST00000311008 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SPNS1-201ENST00000311008 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.18■■■□□ 2.26
SPNS1-201ENST00000311008 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SPNS1-201ENST00000311008 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-201ENST00000311008 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K1Q13233 1512 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.09■■■□□ 2.25
SPNS1-201ENST00000311008 TOPBP1Q92547 1522 aa29.06■■■□□ 2.24
SPNS1-201ENST00000311008 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-201ENST00000311008 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-201ENST00000311008 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-201ENST00000311008 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-201ENST00000311008 TIAM1Q13009 1591 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS1-201ENST00000311008 CUL7Q14999 1698 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-201ENST00000311008 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-201ENST00000311008 NESP48681 1621 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-201ENST00000311008 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SPNS1-201ENST00000311008 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.88■■■□□ 2.21
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.85■■■□□ 2.21
SPNS1-201ENST00000311008 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
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