RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296122.10

PPP1CB-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CB, Length 3,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-201ENST00000296122 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP1CB-201ENST00000296122 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP1CB-201ENST00000296122 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PPP1CB-201ENST00000296122 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.83■■□□□ 1.4
PPP1CB-201ENST00000296122 ABCC9O60706 1549 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP1CB-201ENST00000296122 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP1CB-201ENST00000296122 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PPP1CB-201ENST00000296122 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP1CB-201ENST00000296122 NACADO15069 1562 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP1CB-201ENST00000296122 SCRIBQ14160 1630 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP1CB-201ENST00000296122 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP1CB-201ENST00000296122 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CB-201ENST00000296122 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PPP1CB-201ENST00000296122 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.12■■□□□ 1.13
PPP1CB-201ENST00000296122 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP1CB-201ENST00000296122 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.97■■□□□ 1.11
PPP1CB-201ENST00000296122 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.97■■□□□ 1.11
PPP1CB-201ENST00000296122 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.92■■□□□ 1.1
PPP1CB-201ENST00000296122 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.83■■□□□ 1.08
PPP1CB-201ENST00000296122 SMARCA4P51532 1647 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-201ENST00000296122 WIZO95785 1651 aa21.75■■□□□ 1.07
PPP1CB-201ENST00000296122 TRIM41Q8WV44 630 aa21.74■■□□□ 1.07
PPP1CB-201ENST00000296122 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PPP1CB-201ENST00000296122 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP1CB-201ENST00000296122 SMARCA2P51531 1590 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP1CB-201ENST00000296122 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PPP1CB-201ENST00000296122 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.32■■□□□ 1
PPP1CB-201ENST00000296122 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.27■■□□□ 1
PPP1CB-201ENST00000296122 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.24■□□□□ 0.99
PPP1CB-201ENST00000296122 NCAPD3P42695 1498 aa21.23■□□□□ 0.99
PPP1CB-201ENST00000296122 HMGXB3Q12766 1538 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CB-201ENST00000296122 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
PPP1CB-201ENST00000296122 ABCC8Q09428 1581 aa21.05■□□□□ 0.96
PPP1CB-201ENST00000296122 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.01■□□□□ 0.95
PPP1CB-201ENST00000296122 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PPP1CB-201ENST00000296122 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CB-201ENST00000296122 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CB-201ENST00000296122 EEA1Q15075 1411 aa20.85■□□□□ 0.93
PPP1CB-201ENST00000296122 CFTRP13569 1480 aa20.81■□□□□ 0.92
PPP1CB-201ENST00000296122 SOGA1O94964 1423 aa20.77■□□□□ 0.92
PPP1CB-201ENST00000296122 SYNJ1O43426 1573 aa20.68■□□□□ 0.9
PPP1CB-201ENST00000296122 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.65■□□□□ 0.9
PPP1CB-201ENST00000296122 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.62■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 GOLGA3Q08378 1498 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 KIF27Q86VH2 1401 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 TOP2BQ02880 1626 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CB-201ENST00000296122 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.56■□□□□ 0.88
PPP1CB-201ENST00000296122 APLP2Q06481 763 aa20.53■□□□□ 0.88
PPP1CB-201ENST00000296122 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.53■□□□□ 0.88
PPP1CB-201ENST00000296122 NESP48681 1621 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CB-201ENST00000296122 CUX1P39880 1505 aa20.52■□□□□ 0.88
PPP1CB-201ENST00000296122 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CB-201ENST00000296122 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPP1CB-201ENST00000296122 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP1CB-201ENST00000296122 CUX2O14529 1486 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP1CB-201ENST00000296122 CEP162Q5TB80 1403 aa20.46■□□□□ 0.87
PPP1CB-201ENST00000296122 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.45■□□□□ 0.86
PPP1CB-201ENST00000296122 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PPP1CB-201ENST00000296122 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.41■□□□□ 0.86
PPP1CB-201ENST00000296122 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PPP1CB-201ENST00000296122 PRDM2Q13029 1718 aa20.39■□□□□ 0.85
PPP1CB-201ENST00000296122 CLIP1P30622 1438 aa20.34■□□□□ 0.85
PPP1CB-201ENST00000296122 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CB-201ENST00000296122 TOPBP1Q92547 1522 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CB-201ENST00000296122 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.32■□□□□ 0.84
PPP1CB-201ENST00000296122 ERCC6Q03468 1493 aa20.31■□□□□ 0.84
PPP1CB-201ENST00000296122 KIF21BO75037 1637 aa20.31■□□□□ 0.84
PPP1CB-201ENST00000296122 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CB-201ENST00000296122 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CB-201ENST00000296122 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PPP1CB-201ENST00000296122 IGF1RP08069 1367 aa20.23■□□□□ 0.83
PPP1CB-201ENST00000296122 PRXQ9BXM0 1461 aa20.21■□□□□ 0.83
PPP1CB-201ENST00000296122 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PPP1CB-201ENST00000296122 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.19■□□□□ 0.82
PPP1CB-201ENST00000296122 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PPP1CB-201ENST00000296122 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PPP1CB-201ENST00000296122 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.16■□□□□ 0.82
PPP1CB-201ENST00000296122 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.14■□□□□ 0.82
PPP1CB-201ENST00000296122 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.08■□□□□ 0.81
PPP1CB-201ENST00000296122 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.08■□□□□ 0.8
PPP1CB-201ENST00000296122 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.07■□□□□ 0.8
PPP1CB-201ENST00000296122 P3H3Q8IVL6 736 aa20.06■□□□□ 0.8
PPP1CB-201ENST00000296122 HRCP23327 699 aa20.02■□□□□ 0.8
PPP1CB-201ENST00000296122 FBLN2P98095 1184 aa20■□□□□ 0.79
PPP1CB-201ENST00000296122 IFT140Q96RY7 1462 aa19.96■□□□□ 0.79
PPP1CB-201ENST00000296122 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.783e-8■■■■□ 22.1
PPP1CB-201ENST00000296122 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PPP1CB-201ENST00000296122 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PPP1CB-201ENST00000296122 CUL7Q14999 1698 aa19.91■□□□□ 0.78
PPP1CB-201ENST00000296122 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
PPP1CB-201ENST00000296122 GRIN2BQ13224 1484 aa19.89■□□□□ 0.77
PPP1CB-201ENST00000296122 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.88■□□□□ 0.77
PPP1CB-201ENST00000296122 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms