RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.05■■■■■ 4.48
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.08■■■■□ 3.69
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC9O60706 1549 aa37.1■■■■□ 3.53
SPNS1-208ENST00000566059 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.92■■■■□ 3.34
SPNS1-208ENST00000566059 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
SPNS1-208ENST00000566059 NACADO15069 1562 aa35.78■■■■□ 3.32
SPNS1-208ENST00000566059 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.75■■■■□ 3.31
SPNS1-208ENST00000566059 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.66■■■■□ 3.3
SPNS1-208ENST00000566059 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.61■■■■□ 3.29
SPNS1-208ENST00000566059 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.93■■■■□ 3.18
SPNS1-208ENST00000566059 SCRIBQ14160 1630 aa34.83■■■■□ 3.17
SPNS1-208ENST00000566059 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
SPNS1-208ENST00000566059 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.71■■■■□ 3.15
SPNS1-208ENST00000566059 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.3■■■■□ 3.08
SPNS1-208ENST00000566059 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.9■■■■□ 3.02
SPNS1-208ENST00000566059 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
SPNS1-208ENST00000566059 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.55■■■□□ 2.96
SPNS1-208ENST00000566059 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.55■■■□□ 2.96
SPNS1-208ENST00000566059 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
SPNS1-208ENST00000566059 SMARCA4P51532 1647 aa33.32■■■□□ 2.93
SPNS1-208ENST00000566059 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.21■■■□□ 2.91
SPNS1-208ENST00000566059 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.11■■■□□ 2.89
SPNS1-208ENST00000566059 NCAPD3P42695 1498 aa33.06■■■□□ 2.88
SPNS1-208ENST00000566059 SMARCA2P51531 1590 aa33.04■■■□□ 2.88
SPNS1-208ENST00000566059 PEG3Q9GZU2 1588 aa33■■■□□ 2.87
SPNS1-208ENST00000566059 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
SPNS1-208ENST00000566059 HMGXB3Q12766 1538 aa32.87■■■□□ 2.85
SPNS1-208ENST00000566059 WIZO95785 1651 aa32.84■■■□□ 2.85
SPNS1-208ENST00000566059 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
SPNS1-208ENST00000566059 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
SPNS1-208ENST00000566059 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
SPNS1-208ENST00000566059 NESP48681 1621 aa32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.15■■■□□ 2.74
SPNS1-208ENST00000566059 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.11■■■□□ 2.73
SPNS1-208ENST00000566059 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.09■■■□□ 2.73
SPNS1-208ENST00000566059 CFTRP13569 1480 aa31.97■■■□□ 2.71
SPNS1-208ENST00000566059 ERCC6Q03468 1493 aa31.93■■■□□ 2.7
SPNS1-208ENST00000566059 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.9■■■□□ 2.7
SPNS1-208ENST00000566059 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.76■■■□□ 2.68
SPNS1-208ENST00000566059 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.73■■■□□ 2.67
SPNS1-208ENST00000566059 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.65■■■□□ 2.66
SPNS1-208ENST00000566059 PRDM2Q13029 1718 aa31.64■■■□□ 2.66
SPNS1-208ENST00000566059 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
SPNS1-208ENST00000566059 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-208ENST00000566059 CUX2O14529 1486 aa31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-208ENST00000566059 WDR62O43379 1518 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-208ENST00000566059 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
SPNS1-208ENST00000566059 TOPBP1Q92547 1522 aa31.25■■■□□ 2.59
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC8Q09428 1581 aa31.23■■■□□ 2.59
SPNS1-208ENST00000566059 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.21■■■□□ 2.59
SPNS1-208ENST00000566059 CUX1P39880 1505 aa31.12■■■□□ 2.57
SPNS1-208ENST00000566059 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.02■■■□□ 2.56
SPNS1-208ENST00000566059 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
SPNS1-208ENST00000566059 IFT140Q96RY7 1462 aa30.98■■■□□ 2.55
SPNS1-208ENST00000566059 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.97■■■□□ 2.55
SPNS1-208ENST00000566059 SYNJ1O43426 1573 aa30.92■■■□□ 2.54
SPNS1-208ENST00000566059 SOGA1O94964 1423 aa30.9■■■□□ 2.54
SPNS1-208ENST00000566059 TOP2BQ02880 1626 aa30.9■■■□□ 2.54
SPNS1-208ENST00000566059 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.89■■■□□ 2.54
SPNS1-208ENST00000566059 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SPNS1-208ENST00000566059 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.87■■■□□ 2.53
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
SPNS1-208ENST00000566059 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
SPNS1-208ENST00000566059 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
SPNS1-208ENST00000566059 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
SPNS1-208ENST00000566059 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.67■■■□□ 2.5
SPNS1-208ENST00000566059 WDR97A6NE52 1622 aa30.65■■■□□ 2.5
SPNS1-208ENST00000566059 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.53■■■□□ 2.48
SPNS1-208ENST00000566059 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.51■■■□□ 2.47
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM41Q8WV44 630 aa30.5■■■□□ 2.47
SPNS1-208ENST00000566059 GRIN2BQ13224 1484 aa30.49■■■□□ 2.47
SPNS1-208ENST00000566059 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.41■■■□□ 2.46
SPNS1-208ENST00000566059 PBRM1Q86U86 1689 aa30.39■■■□□ 2.46
SPNS1-208ENST00000566059 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SPNS1-208ENST00000566059 KIF27Q86VH2 1401 aa30.34■■■□□ 2.45
SPNS1-208ENST00000566059 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.33■■■□□ 2.45
SPNS1-208ENST00000566059 FBLN2P98095 1184 aa30.3■■■□□ 2.44
SPNS1-208ENST00000566059 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.3■■■□□ 2.44
SPNS1-208ENST00000566059 OSCARQ8IYS5 282 aa30.29■■■□□ 2.44
SPNS1-208ENST00000566059 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.29■■■□□ 2.44
SPNS1-208ENST00000566059 SYNJ2O15056 1496 aa30.26■■■□□ 2.43
SPNS1-208ENST00000566059 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SPNS1-208ENST00000566059 CHD1O14646 1710 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS1-208ENST00000566059 IGF1RP08069 1367 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS1-208ENST00000566059 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.2■■■□□ 2.43
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTS12P58397 1594 aa30.2■■■□□ 2.42
SPNS1-208ENST00000566059 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.19■■■□□ 2.42
SPNS1-208ENST00000566059 GRIN2AQ12879 1464 aa30.09■■■□□ 2.41
SPNS1-208ENST00000566059 CUL7Q14999 1698 aa30.04■■■□□ 2.4
SPNS1-208ENST00000566059 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.04■■■□□ 2.4
SPNS1-208ENST00000566059 NUP160Q12769 1436 aa29.96■■■□□ 2.39
SPNS1-208ENST00000566059 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.95■■■□□ 2.38
SPNS1-208ENST00000566059 CEP170Q5SW79 1584 aa29.94■■■□□ 2.38
SPNS1-208ENST00000566059 EEA1Q15075 1411 aa29.91■■■□□ 2.38
SPNS1-208ENST00000566059 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.9■■■□□ 2.38
SPNS1-208ENST00000566059 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
SPNS1-208ENST00000566059 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.87■■■□□ 2.37
SPNS1-208ENST00000566059 PRXQ9BXM0 1461 aa29.84■■■□□ 2.37
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF11O15085 1522 aa29.76■■■□□ 2.35
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.74■■■□□ 2.35
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