RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.95■■■■□ 3.67
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.65■■■□□ 2.82
SPNS1-202ENST00000323081 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
SPNS1-202ENST00000323081 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.69■■■□□ 2.66
SPNS1-202ENST00000323081 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.27■■■□□ 2.6
SPNS1-202ENST00000323081 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.26■■■□□ 2.6
SPNS1-202ENST00000323081 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
SPNS1-202ENST00000323081 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.58■■■□□ 2.49
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC9O60706 1549 aa30.43■■■□□ 2.46
SPNS1-202ENST00000323081 SCRIBQ14160 1630 aa30.32■■■□□ 2.44
SPNS1-202ENST00000323081 NACADO15069 1562 aa30.24■■■□□ 2.43
SPNS1-202ENST00000323081 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.85■■■□□ 2.37
SPNS1-202ENST00000323081 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.84■■■□□ 2.37
SPNS1-202ENST00000323081 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SPNS1-202ENST00000323081 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.55■■■□□ 2.32
SPNS1-202ENST00000323081 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.43■■■□□ 2.3
SPNS1-202ENST00000323081 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.43■■■□□ 2.3
SPNS1-202ENST00000323081 WIZO95785 1651 aa29.26■■■□□ 2.27
SPNS1-202ENST00000323081 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SPNS1-202ENST00000323081 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-202ENST00000323081 SMARCA4P51532 1647 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-202ENST00000323081 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
SPNS1-202ENST00000323081 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.9■■■□□ 2.22
SPNS1-202ENST00000323081 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM41Q8WV44 630 aa28.82■■■□□ 2.2
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
SPNS1-202ENST00000323081 SMARCA2P51531 1590 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.64■■■□□ 2.18
SPNS1-202ENST00000323081 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.58■■■□□ 2.17
SPNS1-202ENST00000323081 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.52■■■□□ 2.16
SPNS1-202ENST00000323081 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SPNS1-202ENST00000323081 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC8Q09428 1581 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS1-202ENST00000323081 HRCP23327 699 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-202ENST00000323081 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-202ENST00000323081 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.18■■■□□ 2.1
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SPNS1-202ENST00000323081 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
SPNS1-202ENST00000323081 SOGA1O94964 1423 aa27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-202ENST00000323081 HMGXB3Q12766 1538 aa27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-202ENST00000323081 NCAPD3P42695 1498 aa27.95■■■□□ 2.07
SPNS1-202ENST00000323081 SYNJ1O43426 1573 aa27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-202ENST00000323081 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-202ENST00000323081 EEA1Q15075 1411 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-202ENST00000323081 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.74■■■□□ 2.03
SPNS1-202ENST00000323081 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SPNS1-202ENST00000323081 TOP2BQ02880 1626 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS1-202ENST00000323081 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-202ENST00000323081 CEP162Q5TB80 1403 aa27.6■■■□□ 2.01
SPNS1-202ENST00000323081 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.6■■■□□ 2.01
SPNS1-202ENST00000323081 GOLGA3Q08378 1498 aa27.58■■■□□ 2.01
SPNS1-202ENST00000323081 CFTRP13569 1480 aa27.57■■■□□ 2
SPNS1-202ENST00000323081 KIF21BO75037 1637 aa27.52■■■□□ 2
SPNS1-202ENST00000323081 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.51■■□□□ 1.99
SPNS1-202ENST00000323081 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-202ENST00000323081 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-202ENST00000323081 CUX1P39880 1505 aa27.45■■□□□ 1.98
SPNS1-202ENST00000323081 PRDM2Q13029 1718 aa27.44■■□□□ 1.98
SPNS1-202ENST00000323081 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-202ENST00000323081 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.34■■□□□ 1.97
SPNS1-202ENST00000323081 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-202ENST00000323081 CLIP1P30622 1438 aa27.2■■□□□ 1.94
SPNS1-202ENST00000323081 PRXQ9BXM0 1461 aa27.19■■□□□ 1.94
SPNS1-202ENST00000323081 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SPNS1-202ENST00000323081 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-202ENST00000323081 KIF27Q86VH2 1401 aa27.16■■□□□ 1.94
SPNS1-202ENST00000323081 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-202ENST00000323081 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-202ENST00000323081 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-202ENST00000323081 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.02■■□□□ 1.92
SPNS1-202ENST00000323081 CUX2O14529 1486 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS1-202ENST00000323081 NESP48681 1621 aa26.98■■□□□ 1.91
SPNS1-202ENST00000323081 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-202ENST00000323081 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SPNS1-202ENST00000323081 IGF1RP08069 1367 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-202ENST00000323081 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-202ENST00000323081 ARAP1Q96P48 1450 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS1-202ENST00000323081 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.87■■□□□ 1.89
SPNS1-202ENST00000323081 TOPBP1Q92547 1522 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-202ENST00000323081 APLP2Q06481 763 aa26.83■■□□□ 1.88
SPNS1-202ENST00000323081 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-202ENST00000323081 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-202ENST00000323081 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-202ENST00000323081 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-202ENST00000323081 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-202ENST00000323081 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-202ENST00000323081 WDR97A6NE52 1622 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-202ENST00000323081 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-202ENST00000323081 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-202ENST00000323081 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-202ENST00000323081 CUL7Q14999 1698 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-202ENST00000323081 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SPNS1-202ENST00000323081 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-202ENST00000323081 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-202ENST00000323081 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SPNS1-202ENST00000323081 TIAM1Q13009 1591 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-202ENST00000323081 MAP3K1Q13233 1512 aa26.37■■□□□ 1.81
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