Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ZNHIT3-212ENST00000622312 567 ntTSL 46.92□□□□□ -1.31e-9■■■■■ 33.5
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PRPF4O43172 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.441e-9■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 FBXW4-202ENST00000457105 630 ntTSL 516.81■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 33.5
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PRPF4O43172 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 520.19■□□□□ 0.829e-11■■■■■ 33.4
PRPF4O43172 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 313.75□□□□□ -0.219e-11■■■■■ 33.4
PRPF4O43172 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 213.15□□□□□ -0.39e-11■■■■■ 33.4
PRPF4O43172 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 311.76□□□□□ -0.539e-11■■■■■ 33.4
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PRPF4O43172 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 33.3
PRPF4O43172 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 33.3
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PRPF4O43172 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 33.3
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PRPF4O43172 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 33.3
PRPF4O43172 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 33.3
PRPF4O43172 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 33.3
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PRPF4O43172 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 32.9
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PRPF4O43172 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.735e-10■■■■■ 32.9
PRPF4O43172 HMBOX1-207ENST00000519662 811 ntTSL 410.42□□□□□ -0.745e-10■■■■■ 32.9
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PRPF4O43172 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.445e-10■■■■■ 32.9
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PRPF4O43172 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 32.9
PRPF4O43172 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 32.9
PRPF4O43172 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-8■■■■■ 32.9
PRPF4O43172 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 32.9
PRPF4O43172 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.336e-15■■■■■ 32.9
PRPF4O43172 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 419.88■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 32.9
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