RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520574.1

SORBS3-210, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SORBS3, Length 699 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3-210ENST00000520574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.3■■■■■ 6.76
SORBS3-210ENST00000520574 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.13■■■■■ 5.77
SORBS3-210ENST00000520574 ABCC9O60706 1549 aa50.22■■■■■ 5.63
SORBS3-210ENST00000520574 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.33■■■■■ 5.33
SORBS3-210ENST00000520574 NACADO15069 1562 aa48.22■■■■■ 5.31
SORBS3-210ENST00000520574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48■■■■■ 5.27
SORBS3-210ENST00000520574 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.9■■■■■ 5.26
SORBS3-210ENST00000520574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
SORBS3-210ENST00000520574 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.51■■■■■ 5.2
SORBS3-210ENST00000520574 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.97■■■■■ 5.11
SORBS3-210ENST00000520574 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.87■■■■■ 5.09
SORBS3-210ENST00000520574 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.77■■■■■ 5.08
SORBS3-210ENST00000520574 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.7■■■■■ 5.07
SORBS3-210ENST00000520574 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
SORBS3-210ENST00000520574 SCRIBQ14160 1630 aa46.44■■■■■ 5.03
SORBS3-210ENST00000520574 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
SORBS3-210ENST00000520574 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.44■■■■■ 4.86
SORBS3-210ENST00000520574 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.26■■■■■ 4.84
SORBS3-210ENST00000520574 NCAPD3P42695 1498 aa44.5■■■■■ 4.71
SORBS3-210ENST00000520574 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
SORBS3-210ENST00000520574 SMARCA4P51532 1647 aa44.47■■■■■ 4.71
SORBS3-210ENST00000520574 SMARCA2P51531 1590 aa44.39■■■■■ 4.7
SORBS3-210ENST00000520574 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.38■■■■■ 4.69
SORBS3-210ENST00000520574 HMGXB3Q12766 1538 aa44.2■■■■■ 4.67
SORBS3-210ENST00000520574 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.14■■■■■ 4.66
SORBS3-210ENST00000520574 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
SORBS3-210ENST00000520574 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
SORBS3-210ENST00000520574 WIZO95785 1651 aa43.51■■■■■ 4.56
SORBS3-210ENST00000520574 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
SORBS3-210ENST00000520574 ERCC6Q03468 1493 aa43.44■■■■■ 4.54
SORBS3-210ENST00000520574 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.36■■■■■ 4.53
SORBS3-210ENST00000520574 NESP48681 1621 aa43.3■■■■■ 4.52
SORBS3-210ENST00000520574 CUX2O14529 1486 aa43.19■■■■■ 4.5
SORBS3-210ENST00000520574 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.18■■■■■ 4.5
SORBS3-210ENST00000520574 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.17■■■■■ 4.5
SORBS3-210ENST00000520574 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
SORBS3-210ENST00000520574 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.15■■■■■ 4.5
SORBS3-210ENST00000520574 CFTRP13569 1480 aa42.81■■■■■ 4.44
SORBS3-210ENST00000520574 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.77■■■■■ 4.44
SORBS3-210ENST00000520574 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
SORBS3-210ENST00000520574 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.62■■■■■ 4.41
SORBS3-210ENST00000520574 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.62■■■■■ 4.41
SORBS3-210ENST00000520574 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.61■■■■■ 4.41
SORBS3-210ENST00000520574 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.61■■■■■ 4.41
SORBS3-210ENST00000520574 WDR62O43379 1518 aa42.46■■■■■ 4.39
SORBS3-210ENST00000520574 PRDM2Q13029 1718 aa42.37■■■■■ 4.37
SORBS3-210ENST00000520574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
SORBS3-210ENST00000520574 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
SORBS3-210ENST00000520574 ABCC8Q09428 1581 aa42.05■■■■■ 4.32
SORBS3-210ENST00000520574 TOPBP1Q92547 1522 aa41.86■■■■■ 4.29
SORBS3-210ENST00000520574 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
SORBS3-210ENST00000520574 IFT140Q96RY7 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
SORBS3-210ENST00000520574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SORBS3-210ENST00000520574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
SORBS3-210ENST00000520574 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
SORBS3-210ENST00000520574 SOGA1O94964 1423 aa41.38■■■■■ 4.22
SORBS3-210ENST00000520574 OSCARQ8IYS5 282 aa41.38■■■■■ 4.21
SORBS3-210ENST00000520574 CUX1P39880 1505 aa41.35■■■■■ 4.21
SORBS3-210ENST00000520574 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
SORBS3-210ENST00000520574 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
SORBS3-210ENST00000520574 WDR97A6NE52 1622 aa41.26■■■■■ 4.19
SORBS3-210ENST00000520574 TRIM41Q8WV44 630 aa41.23■■■■■ 4.19
SORBS3-210ENST00000520574 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.22■■■■■ 4.19
SORBS3-210ENST00000520574 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.21■■■■■ 4.191e-7■■□□□ 11.5
SORBS3-210ENST00000520574 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
SORBS3-210ENST00000520574 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.16
SORBS3-210ENST00000520574 TOP2BQ02880 1626 aa40.98■■■■■ 4.15
SORBS3-210ENST00000520574 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.98■■■■■ 4.15
SORBS3-210ENST00000520574 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
SORBS3-210ENST00000520574 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.95■■■■■ 4.15
SORBS3-210ENST00000520574 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
SORBS3-210ENST00000520574 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.87■■■■■ 4.13
SORBS3-210ENST00000520574 FBLN2P98095 1184 aa40.86■■■■■ 4.13
SORBS3-210ENST00000520574 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.83■■■■■ 4.13
SORBS3-210ENST00000520574 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.12
SORBS3-210ENST00000520574 CHD1O14646 1710 aa40.79■■■■■ 4.12
SORBS3-210ENST00000520574 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
SORBS3-210ENST00000520574 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.75■■■■■ 4.11
SORBS3-210ENST00000520574 SYNJ2O15056 1496 aa40.71■■■■■ 4.11
SORBS3-210ENST00000520574 PBRM1Q86U86 1689 aa40.68■■■■■ 4.1
SORBS3-210ENST00000520574 ARHGEF11O15085 1522 aa40.53■■■■■ 4.08
SORBS3-210ENST00000520574 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
SORBS3-210ENST00000520574 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
SORBS3-210ENST00000520574 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
SORBS3-210ENST00000520574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
SORBS3-210ENST00000520574 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.44■■■■■ 4.06
SORBS3-210ENST00000520574 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.42■■■■■ 4.06
SORBS3-210ENST00000520574 ADAMTS12P58397 1594 aa40.38■■■■■ 4.05
SORBS3-210ENST00000520574 GRIN2AQ12879 1464 aa40.36■■■■■ 4.05
SORBS3-210ENST00000520574 KIF27Q86VH2 1401 aa40.31■■■■■ 4.04
SORBS3-210ENST00000520574 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.23■■■■■ 4.03
SORBS3-210ENST00000520574 NUP160Q12769 1436 aa40.23■■■■■ 4.03
SORBS3-210ENST00000520574 ARAP1Q96P48 1450 aa40.15■■■■■ 4.02
SORBS3-210ENST00000520574 IGF1RP08069 1367 aa40.13■■■■■ 4.02
SORBS3-210ENST00000520574 CEP170Q5SW79 1584 aa40.08■■■■■ 4.01
SORBS3-210ENST00000520574 CUL7Q14999 1698 aa40.04■■■■■ 4
SORBS3-210ENST00000520574 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.91■■■■□ 3.98
SORBS3-210ENST00000520574 SHROOM2Q13796 1616 aa39.91■■■■□ 3.98
SORBS3-210ENST00000520574 JPH4Q96JJ6 628 aa39.88■■■■□ 3.97
SORBS3-210ENST00000520574 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.81■■■■□ 3.96
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