RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.72■■■■■ 5.39
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.59■■■■■ 4.57
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCC9O60706 1549 aa42.89■■■■■ 4.46
PPP1CB-206ENST00000427786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.13■■■■■ 4.18
PPP1CB-206ENST00000427786 NACADO15069 1562 aa41■■■■■ 4.15
PPP1CB-206ENST00000427786 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.69■■■■■ 4.1
PPP1CB-206ENST00000427786 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
PPP1CB-206ENST00000427786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP1CB-206ENST00000427786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.35■■■■■ 4.05
PPP1CB-206ENST00000427786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP1CB-206ENST00000427786 BICRAQ9NZM4 1560 aa40■■■■□ 3.99
PPP1CB-206ENST00000427786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.91■■■■□ 3.98
PPP1CB-206ENST00000427786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP1CB-206ENST00000427786 SCRIBQ14160 1630 aa39.65■■■■□ 3.94
PPP1CB-206ENST00000427786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.53■■■■□ 3.92
PPP1CB-206ENST00000427786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
PPP1CB-206ENST00000427786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.85■■■■□ 3.81
PPP1CB-206ENST00000427786 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.6■■■■□ 3.77
PPP1CB-206ENST00000427786 SMARCA4P51532 1647 aa37.93■■■■□ 3.66
PPP1CB-206ENST00000427786 NCAPD3P42695 1498 aa37.83■■■■□ 3.65
PPP1CB-206ENST00000427786 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
PPP1CB-206ENST00000427786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.78■■■■□ 3.64
PPP1CB-206ENST00000427786 SMARCA2P51531 1590 aa37.71■■■■□ 3.63
PPP1CB-206ENST00000427786 HMGXB3Q12766 1538 aa37.66■■■■□ 3.62
PPP1CB-206ENST00000427786 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.62■■■■□ 3.61
PPP1CB-206ENST00000427786 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.55■■■■□ 3.6
PPP1CB-206ENST00000427786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
PPP1CB-206ENST00000427786 WIZO95785 1651 aa37.12■■■■□ 3.53
PPP1CB-206ENST00000427786 NESP48681 1621 aa37.03■■■■□ 3.52
PPP1CB-206ENST00000427786 ERCC6Q03468 1493 aa36.95■■■■□ 3.51
PPP1CB-206ENST00000427786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
PPP1CB-206ENST00000427786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.92■■■■□ 3.5
PPP1CB-206ENST00000427786 CUX2O14529 1486 aa36.82■■■■□ 3.48
PPP1CB-206ENST00000427786 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
PPP1CB-206ENST00000427786 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.66■■■■□ 3.46
PPP1CB-206ENST00000427786 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CB-206ENST00000427786 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.58■■■■□ 3.45
PPP1CB-206ENST00000427786 CFTRP13569 1480 aa36.4■■■■□ 3.42
PPP1CB-206ENST00000427786 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.3■■■■□ 3.4
PPP1CB-206ENST00000427786 WDR62O43379 1518 aa36.26■■■■□ 3.4
PPP1CB-206ENST00000427786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP1CB-206ENST00000427786 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP1CB-206ENST00000427786 PRDM2Q13029 1718 aa36.2■■■■□ 3.38
PPP1CB-206ENST00000427786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.07■■■■□ 3.36
PPP1CB-206ENST00000427786 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
PPP1CB-206ENST00000427786 TOPBP1Q92547 1522 aa35.66■■■■□ 3.3
PPP1CB-206ENST00000427786 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.59■■■■□ 3.29
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCC8Q09428 1581 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP1CB-206ENST00000427786 IFT140Q96RY7 1462 aa35.51■■■■□ 3.28
PPP1CB-206ENST00000427786 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PPP1CB-206ENST00000427786 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
PPP1CB-206ENST00000427786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PPP1CB-206ENST00000427786 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PPP1CB-206ENST00000427786 CUX1P39880 1505 aa35.25■■■■□ 3.23
PPP1CB-206ENST00000427786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.16■■■■□ 3.22
PPP1CB-206ENST00000427786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.14■■■■□ 3.22
PPP1CB-206ENST00000427786 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.213e-8■■■■□ 22.3
PPP1CB-206ENST00000427786 SOGA1O94964 1423 aa35.07■■■■□ 3.21
PPP1CB-206ENST00000427786 WDR97A6NE52 1622 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP1CB-206ENST00000427786 OSCARQ8IYS5 282 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP1CB-206ENST00000427786 CHD1O14646 1710 aa34.94■■■■□ 3.18
PPP1CB-206ENST00000427786 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
PPP1CB-206ENST00000427786 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP1CB-206ENST00000427786 TOP2BQ02880 1626 aa34.85■■■■□ 3.17
PPP1CB-206ENST00000427786 SYNJ1O43426 1573 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP1CB-206ENST00000427786 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.8■■■■□ 3.16
PPP1CB-206ENST00000427786 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.8■■■■□ 3.16
PPP1CB-206ENST00000427786 GRIN2BQ13224 1484 aa34.78■■■■□ 3.16
PPP1CB-206ENST00000427786 PBRM1Q86U86 1689 aa34.77■■■■□ 3.16
PPP1CB-206ENST00000427786 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
PPP1CB-206ENST00000427786 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP1CB-206ENST00000427786 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP1CB-206ENST00000427786 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP1CB-206ENST00000427786 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP1CB-206ENST00000427786 ARHGEF11O15085 1522 aa34.65■■■■□ 3.14
PPP1CB-206ENST00000427786 SYNJ2O15056 1496 aa34.61■■■■□ 3.13
PPP1CB-206ENST00000427786 TRIM41Q8WV44 630 aa34.59■■■■□ 3.13
PPP1CB-206ENST00000427786 FBLN2P98095 1184 aa34.58■■■■□ 3.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.58■■■■□ 3.13
PPP1CB-206ENST00000427786 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PPP1CB-206ENST00000427786 ADAMTS12P58397 1594 aa34.47■■■■□ 3.11
PPP1CB-206ENST00000427786 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.4■■■■□ 3.1
PPP1CB-206ENST00000427786 ARAP1Q96P48 1450 aa34.36■■■■□ 3.09
PPP1CB-206ENST00000427786 GRIN2AQ12879 1464 aa34.35■■■■□ 3.09
PPP1CB-206ENST00000427786 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.3■■■■□ 3.08
PPP1CB-206ENST00000427786 CEP170Q5SW79 1584 aa34.25■■■■□ 3.07
PPP1CB-206ENST00000427786 NUP160Q12769 1436 aa34.25■■■■□ 3.07
PPP1CB-206ENST00000427786 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP1CB-206ENST00000427786 SHROOM2Q13796 1616 aa34.11■■■■□ 3.05
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF27Q86VH2 1401 aa34.07■■■■□ 3.04
PPP1CB-206ENST00000427786 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.03■■■■□ 3.04
PPP1CB-206ENST00000427786 CUL7Q14999 1698 aa34.03■■■■□ 3.04
PPP1CB-206ENST00000427786 IGF1RP08069 1367 aa34■■■■□ 3.03
PPP1CB-206ENST00000427786 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP1CB-206ENST00000427786 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
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