RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496725.1

KIDINS220-211, Transcript of kinase D interacting substrate 220, humanhuman

TSL 4

Gene KIDINS220, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIDINS220-211ENST00000496725 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.67■■■■■ 4.1
KIDINS220-211ENST00000496725 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.29■■■■□ 3.4
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCC9O60706 1549 aa35.51■■■■□ 3.27
KIDINS220-211ENST00000496725 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.19■■■■□ 3.06
KIDINS220-211ENST00000496725 NACADO15069 1562 aa34.15■■■■□ 3.06
KIDINS220-211ENST00000496725 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
KIDINS220-211ENST00000496725 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.84■■■■□ 3.01
KIDINS220-211ENST00000496725 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
KIDINS220-211ENST00000496725 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.74■■■□□ 2.99
KIDINS220-211ENST00000496725 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.41■■■□□ 2.94
KIDINS220-211ENST00000496725 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.17■■■□□ 2.9
KIDINS220-211ENST00000496725 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.12■■■□□ 2.89
KIDINS220-211ENST00000496725 SCRIBQ14160 1630 aa32.94■■■□□ 2.86
KIDINS220-211ENST00000496725 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
KIDINS220-211ENST00000496725 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.79■■■□□ 2.84
KIDINS220-211ENST00000496725 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
KIDINS220-211ENST00000496725 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.18■■■□□ 2.74
KIDINS220-211ENST00000496725 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.97■■■□□ 2.71
KIDINS220-211ENST00000496725 SMARCA4P51532 1647 aa31.58■■■□□ 2.65
KIDINS220-211ENST00000496725 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
KIDINS220-211ENST00000496725 NCAPD3P42695 1498 aa31.52■■■□□ 2.64
KIDINS220-211ENST00000496725 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.46■■■□□ 2.63
KIDINS220-211ENST00000496725 SMARCA2P51531 1590 aa31.43■■■□□ 2.62
KIDINS220-211ENST00000496725 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.35■■■□□ 2.61
KIDINS220-211ENST00000496725 HMGXB3Q12766 1538 aa31.34■■■□□ 2.61
KIDINS220-211ENST00000496725 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.29■■■□□ 2.6
KIDINS220-211ENST00000496725 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
KIDINS220-211ENST00000496725 WIZO95785 1651 aa30.93■■■□□ 2.54
KIDINS220-211ENST00000496725 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.53
KIDINS220-211ENST00000496725 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.71■■■□□ 2.51
KIDINS220-211ENST00000496725 NESP48681 1621 aa30.69■■■□□ 2.5
KIDINS220-211ENST00000496725 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
KIDINS220-211ENST00000496725 ERCC6Q03468 1493 aa30.63■■■□□ 2.49
KIDINS220-211ENST00000496725 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.54■■■□□ 2.48
KIDINS220-211ENST00000496725 CUX2O14529 1486 aa30.49■■■□□ 2.47
KIDINS220-211ENST00000496725 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.47■■■□□ 2.47
KIDINS220-211ENST00000496725 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.36■■■□□ 2.45
KIDINS220-211ENST00000496725 CFTRP13569 1480 aa30.35■■■□□ 2.45
KIDINS220-211ENST00000496725 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
KIDINS220-211ENST00000496725 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.25■■■□□ 2.43
KIDINS220-211ENST00000496725 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.16■■■□□ 2.42
KIDINS220-211ENST00000496725 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.14■■■□□ 2.42
KIDINS220-211ENST00000496725 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.14■■■□□ 2.42
KIDINS220-211ENST00000496725 PRDM2Q13029 1718 aa30.12■■■□□ 2.41
KIDINS220-211ENST00000496725 WDR62O43379 1518 aa30.09■■■□□ 2.41
KIDINS220-211ENST00000496725 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
KIDINS220-211ENST00000496725 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCC8Q09428 1581 aa29.74■■■□□ 2.35
KIDINS220-211ENST00000496725 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.74■■■□□ 2.35
KIDINS220-211ENST00000496725 TOPBP1Q92547 1522 aa29.67■■■□□ 2.34
KIDINS220-211ENST00000496725 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.64■■■□□ 2.33
KIDINS220-211ENST00000496725 IFT140Q96RY7 1462 aa29.55■■■□□ 2.32
KIDINS220-211ENST00000496725 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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KIDINS220-211ENST00000496725 CUX1P39880 1505 aa29.37■■■□□ 2.29
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
KIDINS220-211ENST00000496725 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.28■■■□□ 2.28
KIDINS220-211ENST00000496725 SOGA1O94964 1423 aa29.28■■■□□ 2.28
KIDINS220-211ENST00000496725 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
KIDINS220-211ENST00000496725 WDR97A6NE52 1622 aa29.23■■■□□ 2.27
KIDINS220-211ENST00000496725 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.23■■■□□ 2.27
KIDINS220-211ENST00000496725 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
KIDINS220-211ENST00000496725 OSCARQ8IYS5 282 aa29.14■■■□□ 2.26
KIDINS220-211ENST00000496725 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.12■■■□□ 2.25
KIDINS220-211ENST00000496725 TOP2BQ02880 1626 aa29.11■■■□□ 2.25
KIDINS220-211ENST00000496725 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
KIDINS220-211ENST00000496725 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.05■■■□□ 2.24
KIDINS220-211ENST00000496725 SYNJ1O43426 1573 aa29.03■■■□□ 2.24
KIDINS220-211ENST00000496725 GRIN2BQ13224 1484 aa28.97■■■□□ 2.23
KIDINS220-211ENST00000496725 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.94■■■□□ 2.22
KIDINS220-211ENST00000496725 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.94■■■□□ 2.22
KIDINS220-211ENST00000496725 CHD1O14646 1710 aa28.93■■■□□ 2.22
KIDINS220-211ENST00000496725 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.91■■■□□ 2.22
KIDINS220-211ENST00000496725 PBRM1Q86U86 1689 aa28.88■■■□□ 2.21
KIDINS220-211ENST00000496725 SYNJ2O15056 1496 aa28.81■■■□□ 2.2
KIDINS220-211ENST00000496725 FBLN2P98095 1184 aa28.78■■■□□ 2.2
KIDINS220-211ENST00000496725 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
KIDINS220-211ENST00000496725 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.71■■■□□ 2.19
KIDINS220-211ENST00000496725 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
KIDINS220-211ENST00000496725 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
KIDINS220-211ENST00000496725 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
KIDINS220-211ENST00000496725 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.67■■■□□ 2.18
KIDINS220-211ENST00000496725 ARHGEF11O15085 1522 aa28.66■■■□□ 2.18
KIDINS220-211ENST00000496725 ADAMTS12P58397 1594 aa28.66■■■□□ 2.18
KIDINS220-211ENST00000496725 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.62■■■□□ 2.17
KIDINS220-211ENST00000496725 GRIN2AQ12879 1464 aa28.59■■■□□ 2.17
KIDINS220-211ENST00000496725 KIF27Q86VH2 1401 aa28.52■■■□□ 2.16
KIDINS220-211ENST00000496725 TRIM41Q8WV44 630 aa28.51■■■□□ 2.15
KIDINS220-211ENST00000496725 NUP160Q12769 1436 aa28.51■■■□□ 2.15
KIDINS220-211ENST00000496725 IGF1RP08069 1367 aa28.45■■■□□ 2.14
KIDINS220-211ENST00000496725 CEP170Q5SW79 1584 aa28.44■■■□□ 2.14
KIDINS220-211ENST00000496725 ARAP1Q96P48 1450 aa28.41■■■□□ 2.14
KIDINS220-211ENST00000496725 CUL7Q14999 1698 aa28.41■■■□□ 2.14
KIDINS220-211ENST00000496725 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.34■■■□□ 2.13
KIDINS220-211ENST00000496725 SHROOM2Q13796 1616 aa28.33■■■□□ 2.13
KIDINS220-211ENST00000496725 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.25■■■□□ 2.11
KIDINS220-211ENST00000496725 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.23■■■□□ 2.11
KIDINS220-211ENST00000496725 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.18■■■□□ 2.1
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