RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420282.5

PPP1CB-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-205ENST00000420282 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.88■■■■■ 5.74
PPP1CB-205ENST00000420282 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.32■■■■■ 4.85
PPP1CB-205ENST00000420282 ABCC9O60706 1549 aa44.92■■■■■ 4.78
PPP1CB-205ENST00000420282 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.94■■■■■ 4.46
PPP1CB-205ENST00000420282 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.92■■■■■ 4.46
PPP1CB-205ENST00000420282 NACADO15069 1562 aa42.75■■■■■ 4.43
PPP1CB-205ENST00000420282 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.29■■■■■ 4.36
PPP1CB-205ENST00000420282 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
PPP1CB-205ENST00000420282 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
PPP1CB-205ENST00000420282 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.98■■■■■ 4.31
PPP1CB-205ENST00000420282 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.98■■■■■ 4.31
PPP1CB-205ENST00000420282 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.7■■■■■ 4.27
PPP1CB-205ENST00000420282 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.67■■■■■ 4.26
PPP1CB-205ENST00000420282 SCRIBQ14160 1630 aa41.45■■■■■ 4.23
PPP1CB-205ENST00000420282 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.02■■■■■ 4.16
PPP1CB-205ENST00000420282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
PPP1CB-205ENST00000420282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.56■■■■■ 4.08
PPP1CB-205ENST00000420282 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.37■■■■■ 4.05
PPP1CB-205ENST00000420282 SMARCA4P51532 1647 aa39.55■■■■□ 3.92
PPP1CB-205ENST00000420282 NCAPD3P42695 1498 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP1CB-205ENST00000420282 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP1CB-205ENST00000420282 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
PPP1CB-205ENST00000420282 SMARCA2P51531 1590 aa39.36■■■■□ 3.89
PPP1CB-205ENST00000420282 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP1CB-205ENST00000420282 HMGXB3Q12766 1538 aa39.19■■■■□ 3.86
PPP1CB-205ENST00000420282 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
PPP1CB-205ENST00000420282 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.11■■■■□ 3.85
PPP1CB-205ENST00000420282 WIZO95785 1651 aa38.82■■■■□ 3.81
PPP1CB-205ENST00000420282 NESP48681 1621 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP1CB-205ENST00000420282 ERCC6Q03468 1493 aa38.73■■■■□ 3.79
PPP1CB-205ENST00000420282 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
PPP1CB-205ENST00000420282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.48■■■■□ 3.75
PPP1CB-205ENST00000420282 CUX2O14529 1486 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP1CB-205ENST00000420282 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.35■■■■□ 3.73
PPP1CB-205ENST00000420282 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
PPP1CB-205ENST00000420282 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
PPP1CB-205ENST00000420282 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.23■■■■□ 3.71
PPP1CB-205ENST00000420282 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
PPP1CB-205ENST00000420282 CFTRP13569 1480 aa38.01■■■■□ 3.67
PPP1CB-205ENST00000420282 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.94■■■■□ 3.66
PPP1CB-205ENST00000420282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP1CB-205ENST00000420282 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.9■■■■□ 3.66
PPP1CB-205ENST00000420282 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP1CB-205ENST00000420282 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.82■■■■□ 3.64
PPP1CB-205ENST00000420282 WDR62O43379 1518 aa37.76■■■■□ 3.63
PPP1CB-205ENST00000420282 PRDM2Q13029 1718 aa37.63■■■■□ 3.61
PPP1CB-205ENST00000420282 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
PPP1CB-205ENST00000420282 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
PPP1CB-205ENST00000420282 TOPBP1Q92547 1522 aa37.26■■■■□ 3.55
PPP1CB-205ENST00000420282 ABCC8Q09428 1581 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP1CB-205ENST00000420282 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP1CB-205ENST00000420282 IFT140Q96RY7 1462 aa37.09■■■■□ 3.53
PPP1CB-205ENST00000420282 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
PPP1CB-205ENST00000420282 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
PPP1CB-205ENST00000420282 OSCARQ8IYS5 282 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP1CB-205ENST00000420282 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PPP1CB-205ENST00000420282 CUX1P39880 1505 aa36.83■■■■□ 3.49
PPP1CB-205ENST00000420282 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.82■■■■□ 3.49
PPP1CB-205ENST00000420282 SOGA1O94964 1423 aa36.81■■■■□ 3.48
PPP1CB-205ENST00000420282 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.483e-8■■■■□ 22.3
PPP1CB-205ENST00000420282 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
PPP1CB-205ENST00000420282 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.77■■■■□ 3.48
PPP1CB-205ENST00000420282 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
PPP1CB-205ENST00000420282 FBLN2P98095 1184 aa36.53■■■■□ 3.44
PPP1CB-205ENST00000420282 TRIM41Q8WV44 630 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP1CB-205ENST00000420282 CHD1O14646 1710 aa36.45■■■■□ 3.43
PPP1CB-205ENST00000420282 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
PPP1CB-205ENST00000420282 WDR97A6NE52 1622 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP1CB-205ENST00000420282 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.38■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 SYNJ1O43426 1573 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 GRIN2BQ13224 1484 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 TOP2BQ02880 1626 aa36.36■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.35■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.35■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.34■■■■□ 3.41
PPP1CB-205ENST00000420282 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
PPP1CB-205ENST00000420282 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
PPP1CB-205ENST00000420282 PBRM1Q86U86 1689 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP1CB-205ENST00000420282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP1CB-205ENST00000420282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP1CB-205ENST00000420282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP1CB-205ENST00000420282 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.22■■■■□ 3.39
PPP1CB-205ENST00000420282 ARHGEF11O15085 1522 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP1CB-205ENST00000420282 SYNJ2O15056 1496 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP1CB-205ENST00000420282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.01■■■■□ 3.36
PPP1CB-205ENST00000420282 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP1CB-205ENST00000420282 ADAMTS12P58397 1594 aa35.9■■■■□ 3.34
PPP1CB-205ENST00000420282 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP1CB-205ENST00000420282 GRIN2AQ12879 1464 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP1CB-205ENST00000420282 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.88■■■■□ 3.33
PPP1CB-205ENST00000420282 ARAP1Q96P48 1450 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP1CB-205ENST00000420282 CEP170Q5SW79 1584 aa35.74■■■■□ 3.31
PPP1CB-205ENST00000420282 NUP160Q12769 1436 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP1CB-205ENST00000420282 KIF27Q86VH2 1401 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CB-205ENST00000420282 IGF1RP08069 1367 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CB-205ENST00000420282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CB-205ENST00000420282 JPH4Q96JJ6 628 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CB-205ENST00000420282 SHROOM2Q13796 1616 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CB-205ENST00000420282 CUL7Q14999 1698 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CB-205ENST00000420282 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.45■■■■□ 3.27
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