Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)24.27■■□□□ 1.489e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.299e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.23e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.19e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 221.42■■□□□ 1.023e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)20.85■□□□□ 0.939e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 520.42■□□□□ 0.863e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 519.35■□□□□ 0.693e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.617e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.599e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 218.08■□□□□ 0.489e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 A1BG-205ENST00000600966 917 ntTSL 517.13■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 213.87□□□□□ -0.193e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 212.93□□□□□ -0.343e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-207ENST00000554439 2982 ntTSL 53.03□□□□□ -1.923e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-206ENST00000554429 2977 ntTSL 53.02□□□□□ -1.933e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-205ENST00000554081 3223 ntTSL 52.47□□□□□ -2.013e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 PRPF39-208ENST00000554785 2121 ntTSL 21.73□□□□□ -2.133e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.233e-10■■■■□ 19.3
NOL12Q9UGY1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 218.58■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 315.13■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 19.2
NOL12Q9UGY1 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 313.02□□□□□ -0.333e-9■■■□□ 19.1
NOL12Q9UGY1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.753e-6■■■□□ 19.1
NOL12Q9UGY1 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 19.1
NOL12Q9UGY1 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 326.28■■□□□ 1.88e-12■■■□□ 19
NOL12Q9UGY1 FANCA-224ENST00000567510 461 ntTSL 36.58□□□□□ -1.365e-8■■■□□ 19
NOL12Q9UGY1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 18.9
NOL12Q9UGY1 ICAM1-205ENST00000592686 571 ntTSL 214.23□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 18.9
NOL12Q9UGY1 PHKA2-206ENST00000473739 751 ntTSL 313.78□□□□□ -0.27e-16■■■□□ 18.9
NOL12Q9UGY1 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-7■■■□□ 18.9
NOL12Q9UGY1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 18.8
NOL12Q9UGY1 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.334e-6■■■□□ 18.8
NOL12Q9UGY1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.861e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-203ENST00000517535 3067 ntTSL 223.47■■□□□ 1.351e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 P3H4-207ENST00000590496 505 ntAPPRIS ALT2 TSL 423.28■■□□□ 1.321e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.171e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-202ENST00000517500 1228 ntTSL 219.66■□□□□ 0.741e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 518.16■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-205ENST00000518512 755 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 NPEPL1-209ENST00000533788 899 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 P3H3-208ENST00000544813 573 ntTSL 515.15■□□□□ 0.021e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 VARS2-203ENST00000428017 1103 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-217ENST00000523402 889 ntTSL 314.57□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 P3H3-203ENST00000538102 710 ntTSL 313.58□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-222ENST00000524057 564 ntTSL 310.23□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 SORBS3-209ENST00000520563 456 ntTSL 49.37□□□□□ -0.911e-7■■■□□ 18.6
NOL12Q9UGY1 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-7■■■□□ 18.5
NOL12Q9UGY1 TMEM94-217ENST00000581085 5432 ntTSL 214.36□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 18.5
NOL12Q9UGY1 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-7■■■□□ 18.5
NOL12Q9UGY1 TMEM94-213ENST00000580416 430 ntTSL 413.46□□□□□ -0.253e-7■■■□□ 18.5
NOL12Q9UGY1 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 511.19□□□□□ -0.623e-7■■■□□ 18.5
NOL12Q9UGY1 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-7■■■□□ 18.4
NOL12Q9UGY1 BCAM-208ENST00000590196 518 ntTSL 514.15□□□□□ -0.143e-10■■■□□ 18.4
NOL12Q9UGY1 FANCA-223ENST00000567284 479 ntTSL 39.54□□□□□ -0.883e-8■■■□□ 18.4
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.384e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-203ENST00000429585 769 ntTSL 523.28■■□□□ 1.324e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-204ENST00000439372 604 ntTSL 422.81■■□□□ 1.244e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-209ENST00000491569 2079 ntTSL 221.84■■□□□ 1.094e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 PRNP-204ENST00000457586 855 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.034e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-205ENST00000446552 571 ntTSL 421.17■□□□□ 0.984e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-206ENST00000449556 720 ntTSL 520.89■□□□□ 0.934e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-202ENST00000422890 867 ntTSL 518.48■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.474e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 217.72■□□□□ 0.434e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 PRNP-202ENST00000424424 806 ntTSL 1 (best)17.56■□□□□ 0.44e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.254e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-7■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.355e-6■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.315e-6■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 COL27A1-203ENST00000468565 1946 ntTSL 215.07■□□□□ 02e-10■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.41e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.021e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LTBP3-210ENST00000528516 3935 ntTSL 1 (best)21.2■□□□□ 0.981e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 220.74■□□□□ 0.911e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LTBP3-207ENST00000526927 2750 ntTSL 219.55■□□□□ 0.721e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 PPP6R1-207ENST00000591602 520 ntTSL 515.52■□□□□ 0.081e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 214.85□□□□□ -0.031e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 314.5□□□□□ -0.091e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 LTBP3-206ENST00000526825 1002 ntTSL 513.72□□□□□ -0.211e-9■■■□□ 18.3
NOL12Q9UGY1 ACADVL-216ENST00000578824 720 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-7■■■□□ 18.2
NOL12Q9UGY1 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 517.71■□□□□ 0.431e-9■■■□□ 18.1
NOL12Q9UGY1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 18.1
NOL12Q9UGY1 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.331e-323■■■□□ 18.1
NOL12Q9UGY1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.511e-323■■■□□ 18.1
NOL12Q9UGY1 LAMB2-209ENST00000480640 563 ntTSL 315.2■□□□□ 0.025e-6■■■□□ 18
NOL12Q9UGY1 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 213.9□□□□□ -0.183e-29■■■□□ 18
NOL12Q9UGY1 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 315.31■□□□□ 0.047e-23■■■□□ 18
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 270.2 ms