RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393928.5

P3H4-202, Transcript of prolyl 3-hydroxylase family member 4 (non-enzymatic), humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H4, Length 2,601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4-202ENST00000393928 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.69■■■■■ 4.42
P3H4-202ENST00000393928 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.84■■■■□ 3.49
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P3H4-202ENST00000393928 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.7■■■■□ 3.31
P3H4-202ENST00000393928 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.52■■■■□ 3.28
P3H4-202ENST00000393928 ABCC9O60706 1549 aa35.08■■■■□ 3.21
P3H4-202ENST00000393928 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.05■■■■□ 3.2
P3H4-202ENST00000393928 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.46■■■■□ 3.11
P3H4-202ENST00000393928 NACADO15069 1562 aa34.33■■■■□ 3.09
P3H4-202ENST00000393928 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
P3H4-202ENST00000393928 SCRIBQ14160 1630 aa34.31■■■■□ 3.08
P3H4-202ENST00000393928 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.02■■■■□ 3.04
P3H4-202ENST00000393928 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.46■■■□□ 2.95
P3H4-202ENST00000393928 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.37■■■□□ 2.93
P3H4-202ENST00000393928 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
P3H4-202ENST00000393928 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.31■■■□□ 2.92
P3H4-202ENST00000393928 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.13■■■□□ 2.89
P3H4-202ENST00000393928 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.12■■■□□ 2.89
P3H4-202ENST00000393928 WIZO95785 1651 aa32.88■■■□□ 2.85
P3H4-202ENST00000393928 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
P3H4-202ENST00000393928 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.82■■■□□ 2.84
P3H4-202ENST00000393928 SMARCA4P51532 1647 aa32.74■■■□□ 2.83
P3H4-202ENST00000393928 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
P3H4-202ENST00000393928 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.2■■■□□ 2.75
P3H4-202ENST00000393928 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.19■■■□□ 2.74
P3H4-202ENST00000393928 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.18■■■□□ 2.74
P3H4-202ENST00000393928 SMARCA2P51531 1590 aa32.14■■■□□ 2.74
P3H4-202ENST00000393928 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
P3H4-202ENST00000393928 TRIM41Q8WV44 630 aa32.06■■■□□ 2.72
P3H4-202ENST00000393928 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
P3H4-202ENST00000393928 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.8■■■□□ 2.68
P3H4-202ENST00000393928 NCAPD3P42695 1498 aa31.77■■■□□ 2.68
P3H4-202ENST00000393928 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
P3H4-202ENST00000393928 ABCC8Q09428 1581 aa31.73■■■□□ 2.67
P3H4-202ENST00000393928 HMGXB3Q12766 1538 aa31.66■■■□□ 2.66
P3H4-202ENST00000393928 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.59■■■□□ 2.65
P3H4-202ENST00000393928 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.49■■■□□ 2.63
P3H4-202ENST00000393928 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
P3H4-202ENST00000393928 SYNJ1O43426 1573 aa31.23■■■□□ 2.59
P3H4-202ENST00000393928 SOGA1O94964 1423 aa31.21■■■□□ 2.59
P3H4-202ENST00000393928 CFTRP13569 1480 aa31.19■■■□□ 2.58
P3H4-202ENST00000393928 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.14■■■□□ 2.58
P3H4-202ENST00000393928 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.13■■■□□ 2.57
P3H4-202ENST00000393928 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.08■■■□□ 2.57
P3H4-202ENST00000393928 TOP2BQ02880 1626 aa30.95■■■□□ 2.54
P3H4-202ENST00000393928 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.94■■■□□ 2.54
P3H4-202ENST00000393928 CUX1P39880 1505 aa30.92■■■□□ 2.54
P3H4-202ENST00000393928 NESP48681 1621 aa30.91■■■□□ 2.54
P3H4-202ENST00000393928 PRDM2Q13029 1718 aa30.85■■■□□ 2.53
P3H4-202ENST00000393928 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.85■■■□□ 2.53
P3H4-202ENST00000393928 EEA1Q15075 1411 aa30.84■■■□□ 2.53
P3H4-202ENST00000393928 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.76■■■□□ 2.51
P3H4-202ENST00000393928 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
P3H4-202ENST00000393928 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.6■■■□□ 2.49
P3H4-202ENST00000393928 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.59■■■□□ 2.49
P3H4-202ENST00000393928 GOLGA3Q08378 1498 aa30.57■■■□□ 2.48
P3H4-202ENST00000393928 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.55■■■□□ 2.48
P3H4-202ENST00000393928 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.54■■■□□ 2.48
P3H4-202ENST00000393928 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.53■■■□□ 2.48
P3H4-202ENST00000393928 CEP162Q5TB80 1403 aa30.51■■■□□ 2.47
P3H4-202ENST00000393928 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.5■■■□□ 2.47
P3H4-202ENST00000393928 KIF27Q86VH2 1401 aa30.48■■■□□ 2.47
P3H4-202ENST00000393928 KIF21BO75037 1637 aa30.47■■■□□ 2.47
P3H4-202ENST00000393928 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
P3H4-202ENST00000393928 TOPBP1Q92547 1522 aa30.44■■■□□ 2.46
P3H4-202ENST00000393928 CUX2O14529 1486 aa30.44■■■□□ 2.46
P3H4-202ENST00000393928 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.43■■■□□ 2.46
P3H4-202ENST00000393928 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.41■■■□□ 2.46
P3H4-202ENST00000393928 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
P3H4-202ENST00000393928 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.38■■■□□ 2.45
P3H4-202ENST00000393928 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
P3H4-202ENST00000393928 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.36■■■□□ 2.45
P3H4-202ENST00000393928 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
P3H4-202ENST00000393928 PRXQ9BXM0 1461 aa30.34■■■□□ 2.45
P3H4-202ENST00000393928 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
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P3H4-202ENST00000393928 CLIP1P30622 1438 aa30.2■■■□□ 2.42
P3H4-202ENST00000393928 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.19■■■□□ 2.42
P3H4-202ENST00000393928 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.16■■■□□ 2.42
P3H4-202ENST00000393928 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
P3H4-202ENST00000393928 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.12■■■□□ 2.41
P3H4-202ENST00000393928 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
P3H4-202ENST00000393928 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.02■■■□□ 2.4
P3H4-202ENST00000393928 WDR97A6NE52 1622 aa29.97■■■□□ 2.39
P3H4-202ENST00000393928 ERCC6Q03468 1493 aa29.95■■■□□ 2.38
P3H4-202ENST00000393928 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.91■■■□□ 2.38
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P3H4-202ENST00000393928 ARAP1Q96P48 1450 aa29.85■■■□□ 2.37
P3H4-202ENST00000393928 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.374e-7■■■□□ 17.2
P3H4-202ENST00000393928 WDR62O43379 1518 aa29.8■■■□□ 2.36
P3H4-202ENST00000393928 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.79■■■□□ 2.36
P3H4-202ENST00000393928 HRCP23327 699 aa29.78■■■□□ 2.36
P3H4-202ENST00000393928 CUL7Q14999 1698 aa29.77■■■□□ 2.36
P3H4-202ENST00000393928 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
P3H4-202ENST00000393928 APLP2Q06481 763 aa29.74■■■□□ 2.35
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P3H4-202ENST00000393928 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
P3H4-202ENST00000393928 IFT140Q96RY7 1462 aa29.68■■■□□ 2.34
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