RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469403.1

AGRN-205, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-205ENST00000469403 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63■■■■■ 7.68
AGRN-205ENST00000469403 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.72■■■■■ 6.51
AGRN-205ENST00000469403 ABCC9O60706 1549 aa53.58■■■■■ 6.17
AGRN-205ENST00000469403 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.66■■■■■ 6.02
AGRN-205ENST00000469403 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.25■■■■■ 5.96
AGRN-205ENST00000469403 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.2■■■■■ 5.95
AGRN-205ENST00000469403 NACADO15069 1562 aa52.17■■■■■ 5.94
AGRN-205ENST00000469403 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.09■■■■■ 5.93
AGRN-205ENST00000469403 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52■■■■■ 5.92
AGRN-205ENST00000469403 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.84■■■■■ 5.73
AGRN-205ENST00000469403 SCRIBQ14160 1630 aa50.76■■■■■ 5.72
AGRN-205ENST00000469403 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.42■■■■■ 5.66
AGRN-205ENST00000469403 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.16■■■■■ 5.62
AGRN-205ENST00000469403 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.06■■■■■ 5.6
AGRN-205ENST00000469403 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
AGRN-205ENST00000469403 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.93■■■■■ 5.42
AGRN-205ENST00000469403 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
AGRN-205ENST00000469403 SMARCA4P51532 1647 aa48.72■■■■■ 5.39
AGRN-205ENST00000469403 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.57■■■■■ 5.37
AGRN-205ENST00000469403 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.53■■■■■ 5.36
AGRN-205ENST00000469403 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.46■■■■■ 5.35
AGRN-205ENST00000469403 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.29■■■■■ 5.32
AGRN-205ENST00000469403 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
AGRN-205ENST00000469403 SMARCA2P51531 1590 aa48.24■■■■■ 5.31
AGRN-205ENST00000469403 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.23■■■■■ 5.31
AGRN-205ENST00000469403 NCAPD3P42695 1498 aa48.13■■■■■ 5.3
AGRN-205ENST00000469403 WIZO95785 1651 aa48.04■■■■■ 5.28
AGRN-205ENST00000469403 HMGXB3Q12766 1538 aa47.97■■■■■ 5.27
AGRN-205ENST00000469403 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
AGRN-205ENST00000469403 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
AGRN-205ENST00000469403 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
AGRN-205ENST00000469403 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.03■■■■■ 5.12
AGRN-205ENST00000469403 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.73■■■■■ 5.07
AGRN-205ENST00000469403 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.72■■■■■ 5.07
AGRN-205ENST00000469403 CFTRP13569 1480 aa46.64■■■■■ 5.06
AGRN-205ENST00000469403 NESP48681 1621 aa46.62■■■■■ 5.05
AGRN-205ENST00000469403 PRDM2Q13029 1718 aa46.39■■■■■ 5.02
AGRN-205ENST00000469403 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.34■■■■■ 5.01
AGRN-205ENST00000469403 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.16■■■■■ 4.98
AGRN-205ENST00000469403 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.14■■■■■ 4.98
AGRN-205ENST00000469403 ERCC6Q03468 1493 aa46.12■■■■■ 4.97
AGRN-205ENST00000469403 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.03■■■■■ 4.96
AGRN-205ENST00000469403 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
AGRN-205ENST00000469403 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.81■■■■■ 4.92
AGRN-205ENST00000469403 WDR62O43379 1518 aa45.67■■■■■ 4.9
AGRN-205ENST00000469403 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
AGRN-205ENST00000469403 ABCC8Q09428 1581 aa45.62■■■■■ 4.89
AGRN-205ENST00000469403 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.58■■■■■ 4.89
AGRN-205ENST00000469403 TOPBP1Q92547 1522 aa45.54■■■■■ 4.88
AGRN-205ENST00000469403 CUX1P39880 1505 aa45.49■■■■■ 4.87
AGRN-205ENST00000469403 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.48■■■■■ 4.879e-7■■■□□ 18.8
AGRN-205ENST00000469403 CUX2O14529 1486 aa45.44■■■■■ 4.87
AGRN-205ENST00000469403 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.35■■■■■ 4.85
AGRN-205ENST00000469403 TOP2BQ02880 1626 aa45.34■■■■■ 4.85
AGRN-205ENST00000469403 SYNJ1O43426 1573 aa45.33■■■■■ 4.85
AGRN-205ENST00000469403 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
AGRN-205ENST00000469403 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.19■■■■■ 4.82
AGRN-205ENST00000469403 IFT140Q96RY7 1462 aa45.06■■■■■ 4.8
AGRN-205ENST00000469403 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
AGRN-205ENST00000469403 SOGA1O94964 1423 aa45.01■■■■■ 4.8
AGRN-205ENST00000469403 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.94■■■■■ 4.78
AGRN-205ENST00000469403 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.9■■■■■ 4.78
AGRN-205ENST00000469403 TRIM41Q8WV44 630 aa44.89■■■■■ 4.78
AGRN-205ENST00000469403 WDR97A6NE52 1622 aa44.85■■■■■ 4.77
AGRN-205ENST00000469403 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.84■■■■■ 4.77
AGRN-205ENST00000469403 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
AGRN-205ENST00000469403 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
AGRN-205ENST00000469403 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
AGRN-205ENST00000469403 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.6■■■■■ 4.73
AGRN-205ENST00000469403 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.58■■■■■ 4.731e-7■■■□□ 19
AGRN-205ENST00000469403 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.52■■■■■ 4.72
AGRN-205ENST00000469403 KIF27Q86VH2 1401 aa44.48■■■■■ 4.71
AGRN-205ENST00000469403 GRIN2BQ13224 1484 aa44.41■■■■■ 4.7
AGRN-205ENST00000469403 PBRM1Q86U86 1689 aa44.39■■■■■ 4.7
AGRN-205ENST00000469403 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.33■■■■■ 4.69
AGRN-205ENST00000469403 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.28■■■■■ 4.68
AGRN-205ENST00000469403 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
AGRN-205ENST00000469403 EEA1Q15075 1411 aa44.22■■■■■ 4.67
AGRN-205ENST00000469403 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.21■■■■■ 4.67
AGRN-205ENST00000469403 IGF1RP08069 1367 aa44.2■■■■■ 4.67
AGRN-205ENST00000469403 ADAMTS12P58397 1594 aa44.09■■■■■ 4.65
AGRN-205ENST00000469403 CUL7Q14999 1698 aa44.08■■■■■ 4.65
AGRN-205ENST00000469403 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.05■■■■■ 4.64
AGRN-205ENST00000469403 SYNJ2O15056 1496 aa44.03■■■■■ 4.64
AGRN-205ENST00000469403 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.96■■■■■ 4.63
AGRN-205ENST00000469403 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.93■■■■■ 4.62
AGRN-205ENST00000469403 CHD1O14646 1710 aa43.91■■■■■ 4.62
AGRN-205ENST00000469403 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
AGRN-205ENST00000469403 PRXQ9BXM0 1461 aa43.86■■■■■ 4.61
AGRN-205ENST00000469403 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
AGRN-205ENST00000469403 GRIN2AQ12879 1464 aa43.84■■■■■ 4.61
AGRN-205ENST00000469403 FBLN2P98095 1184 aa43.79■■■■■ 4.6
AGRN-205ENST00000469403 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.78■■■■■ 4.6
AGRN-205ENST00000469403 KIF21BO75037 1637 aa43.69■■■■■ 4.58
AGRN-205ENST00000469403 NUP160Q12769 1436 aa43.65■■■■■ 4.58
AGRN-205ENST00000469403 OSCARQ8IYS5 282 aa43.64■■■■■ 4.58
AGRN-205ENST00000469403 CEP170Q5SW79 1584 aa43.58■■■■■ 4.57
AGRN-205ENST00000469403 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.5■■■■■ 4.55
AGRN-205ENST00000469403 GOLGA3Q08378 1498 aa43.45■■■■■ 4.55
AGRN-205ENST00000469403 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.42■■■■■ 4.54
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