RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591436.5

TMC6-218, Transcript of transmembrane channel like 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMC6, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6-218ENST00000591436 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.15■■■■■ 6.58
TMC6-218ENST00000591436 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.21■■■■■ 5.63
TMC6-218ENST00000591436 ABCC9O60706 1549 aa49.85■■■■■ 5.57
TMC6-218ENST00000591436 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
TMC6-218ENST00000591436 NACADO15069 1562 aa47.38■■■■■ 5.18
TMC6-218ENST00000591436 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.32■■■■■ 5.17
TMC6-218ENST00000591436 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.82■■■■■ 5.09
TMC6-218ENST00000591436 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
TMC6-218ENST00000591436 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.56■■■■■ 5.04
TMC6-218ENST00000591436 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.49■■■■■ 5.035e-7■□□□□ 10.4
TMC6-218ENST00000591436 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.38■■■■■ 5.01
TMC6-218ENST00000591436 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.37■■■■■ 5.01
TMC6-218ENST00000591436 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.18■■■■■ 4.98
TMC6-218ENST00000591436 SCRIBQ14160 1630 aa45.82■■■■■ 4.93
TMC6-218ENST00000591436 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.6■■■■■ 4.89
TMC6-218ENST00000591436 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.04■■■■■ 4.8
TMC6-218ENST00000591436 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
TMC6-218ENST00000591436 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.85■■■■■ 4.77
TMC6-218ENST00000591436 SMARCA4P51532 1647 aa43.73■■■■■ 4.59
TMC6-218ENST00000591436 NCAPD3P42695 1498 aa43.71■■■■■ 4.59
TMC6-218ENST00000591436 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.65■■■■■ 4.58
TMC6-218ENST00000591436 SMARCA2P51531 1590 aa43.57■■■■■ 4.57
TMC6-218ENST00000591436 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
TMC6-218ENST00000591436 HMGXB3Q12766 1538 aa43.43■■■■■ 4.54
TMC6-218ENST00000591436 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
TMC6-218ENST00000591436 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.28■■■■■ 4.52
TMC6-218ENST00000591436 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.26■■■■■ 4.52
TMC6-218ENST00000591436 ERCC6Q03468 1493 aa43.04■■■■■ 4.48
TMC6-218ENST00000591436 NESP48681 1621 aa42.93■■■■■ 4.46
TMC6-218ENST00000591436 WIZO95785 1651 aa42.8■■■■■ 4.44
TMC6-218ENST00000591436 CUX2O14529 1486 aa42.77■■■■■ 4.44
TMC6-218ENST00000591436 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.69■■■■■ 4.42
TMC6-218ENST00000591436 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
TMC6-218ENST00000591436 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.45■■■■■ 4.39
TMC6-218ENST00000591436 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.43■■■■■ 4.38
TMC6-218ENST00000591436 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.41■■■■■ 4.38
TMC6-218ENST00000591436 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
TMC6-218ENST00000591436 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.29■■■■■ 4.36
TMC6-218ENST00000591436 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
TMC6-218ENST00000591436 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.04■■■■■ 4.32
TMC6-218ENST00000591436 CFTRP13569 1480 aa42.02■■■■■ 4.32
TMC6-218ENST00000591436 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.97■■■■■ 4.31
TMC6-218ENST00000591436 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.96■■■■■ 4.31
TMC6-218ENST00000591436 WDR62O43379 1518 aa41.91■■■■■ 4.3
TMC6-218ENST00000591436 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.79■■■■■ 4.28
TMC6-218ENST00000591436 PRDM2Q13029 1718 aa41.68■■■■■ 4.26
TMC6-218ENST00000591436 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
TMC6-218ENST00000591436 TOPBP1Q92547 1522 aa41.21■■■■■ 4.19
TMC6-218ENST00000591436 ABCC8Q09428 1581 aa41.14■■■■■ 4.18
TMC6-218ENST00000591436 IFT140Q96RY7 1462 aa41.11■■■■■ 4.17
TMC6-218ENST00000591436 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.09■■■■■ 4.17
TMC6-218ENST00000591436 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
TMC6-218ENST00000591436 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
TMC6-218ENST00000591436 OSCARQ8IYS5 282 aa40.92■■■■■ 4.14
TMC6-218ENST00000591436 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
TMC6-218ENST00000591436 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
TMC6-218ENST00000591436 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
TMC6-218ENST00000591436 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.7■■■■■ 4.119e-11■■■■■ 43.1
TMC6-218ENST00000591436 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.67■■■■■ 4.1
TMC6-218ENST00000591436 TRIM41Q8WV44 630 aa40.67■■■■■ 4.1
TMC6-218ENST00000591436 SOGA1O94964 1423 aa40.65■■■■■ 4.1
TMC6-218ENST00000591436 CUX1P39880 1505 aa40.64■■■■■ 4.1
TMC6-218ENST00000591436 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.62■■■■■ 4.09
TMC6-218ENST00000591436 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
TMC6-218ENST00000591436 CHD1O14646 1710 aa40.45■■■■■ 4.07
TMC6-218ENST00000591436 FBLN2P98095 1184 aa40.41■■■■■ 4.06
TMC6-218ENST00000591436 WDR97A6NE52 1622 aa40.41■■■■■ 4.06
TMC6-218ENST00000591436 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
TMC6-218ENST00000591436 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
TMC6-218ENST00000591436 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.34■■■■■ 4.05
TMC6-218ENST00000591436 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.3■■■■■ 4.04
TMC6-218ENST00000591436 ARHGEF11O15085 1522 aa40.24■■■■■ 4.03
TMC6-218ENST00000591436 GRIN2BQ13224 1484 aa40.24■■■■■ 4.03
TMC6-218ENST00000591436 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.03
TMC6-218ENST00000591436 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.17■■■■■ 4.02
TMC6-218ENST00000591436 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.16■■■■■ 4.02
TMC6-218ENST00000591436 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
TMC6-218ENST00000591436 PBRM1Q86U86 1689 aa40.13■■■■■ 4.01
TMC6-218ENST00000591436 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
TMC6-218ENST00000591436 TOP2BQ02880 1626 aa40.1■■■■■ 4.01
TMC6-218ENST00000591436 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.1■■■■■ 4.01
TMC6-218ENST00000591436 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
TMC6-218ENST00000591436 SYNJ1O43426 1573 aa40.07■■■■■ 4.01
TMC6-218ENST00000591436 SYNJ2O15056 1496 aa40.06■■■■■ 4
TMC6-218ENST00000591436 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.96■■■■□ 3.99
TMC6-218ENST00000591436 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.95■■■■□ 3.99
TMC6-218ENST00000591436 ARAP1Q96P48 1450 aa39.87■■■■□ 3.97
TMC6-218ENST00000591436 ADAMTS12P58397 1594 aa39.76■■■■□ 3.95
TMC6-218ENST00000591436 GRIN2AQ12879 1464 aa39.72■■■■□ 3.95
TMC6-218ENST00000591436 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.68■■■■□ 3.94
TMC6-218ENST00000591436 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.66■■■■□ 3.94
TMC6-218ENST00000591436 CEP170Q5SW79 1584 aa39.56■■■■□ 3.92
TMC6-218ENST00000591436 NUP160Q12769 1436 aa39.55■■■■□ 3.92
TMC6-218ENST00000591436 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
TMC6-218ENST00000591436 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.38■■■■□ 3.89
TMC6-218ENST00000591436 KIF27Q86VH2 1401 aa39.35■■■■□ 3.89
TMC6-218ENST00000591436 SHROOM2Q13796 1616 aa39.33■■■■□ 3.89
TMC6-218ENST00000591436 IGF1RP08069 1367 aa39.27■■■■□ 3.88
TMC6-218ENST00000591436 CUL7Q14999 1698 aa39.2■■■■□ 3.87
TMC6-218ENST00000591436 JPH4Q96JJ6 628 aa39.18■■■■□ 3.86
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