RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590496.1

P3H4-207, Transcript of prolyl 3-hydroxylase family member 4 (non-enzymatic), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene P3H4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4-207ENST00000590496 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.93■■■■■ 7.82
P3H4-207ENST00000590496 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.1■■■■■ 6.73
P3H4-207ENST00000590496 ABCC9O60706 1549 aa56.68■■■■■ 6.66
P3H4-207ENST00000590496 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.14■■■■■ 6.26
P3H4-207ENST00000590496 NACADO15069 1562 aa53.91■■■■■ 6.22
P3H4-207ENST00000590496 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.81■■■■■ 6.2
P3H4-207ENST00000590496 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.32■■■■■ 6.13
P3H4-207ENST00000590496 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.06■■■■■ 6.08
P3H4-207ENST00000590496 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.96■■■■■ 6.07
P3H4-207ENST00000590496 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.89■■■■■ 6.06
P3H4-207ENST00000590496 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.82■■■■■ 6.05
P3H4-207ENST00000590496 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.82■■■■■ 6.05
P3H4-207ENST00000590496 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.58■■■■■ 6.01
P3H4-207ENST00000590496 SCRIBQ14160 1630 aa52.07■■■■■ 5.93
P3H4-207ENST00000590496 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.86■■■■■ 5.89
P3H4-207ENST00000590496 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.22■■■■■ 5.79
P3H4-207ENST00000590496 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
P3H4-207ENST00000590496 CECR2Q9BXF3 1484 aa51■■■■■ 5.75
P3H4-207ENST00000590496 NCAPD3P42695 1498 aa49.79■■■■■ 5.56
P3H4-207ENST00000590496 SMARCA4P51532 1647 aa49.74■■■■■ 5.55
P3H4-207ENST00000590496 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.69■■■■■ 5.55
P3H4-207ENST00000590496 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.57■■■■■ 5.53
P3H4-207ENST00000590496 SMARCA2P51531 1590 aa49.55■■■■■ 5.52
P3H4-207ENST00000590496 HMGXB3Q12766 1538 aa49.4■■■■■ 5.5
P3H4-207ENST00000590496 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.27■■■■■ 5.48
P3H4-207ENST00000590496 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.27■■■■■ 5.48
P3H4-207ENST00000590496 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
P3H4-207ENST00000590496 ERCC6Q03468 1493 aa48.86■■■■■ 5.41
P3H4-207ENST00000590496 NESP48681 1621 aa48.83■■■■■ 5.41
P3H4-207ENST00000590496 WIZO95785 1651 aa48.7■■■■■ 5.39
P3H4-207ENST00000590496 CUX2O14529 1486 aa48.61■■■■■ 5.37
P3H4-207ENST00000590496 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.55■■■■■ 5.36
P3H4-207ENST00000590496 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.44■■■■■ 5.35
P3H4-207ENST00000590496 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.3■■■■■ 5.32
P3H4-207ENST00000590496 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.27■■■■■ 5.32
P3H4-207ENST00000590496 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
P3H4-207ENST00000590496 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.2■■■■■ 5.31
P3H4-207ENST00000590496 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.13■■■■■ 5.3
P3H4-207ENST00000590496 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
P3H4-207ENST00000590496 CFTRP13569 1480 aa47.84■■■■■ 5.25
P3H4-207ENST00000590496 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.8■■■■■ 5.24
P3H4-207ENST00000590496 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.72■■■■■ 5.23
P3H4-207ENST00000590496 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.71■■■■■ 5.23
P3H4-207ENST00000590496 WDR62O43379 1518 aa47.66■■■■■ 5.22
P3H4-207ENST00000590496 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.59■■■■■ 5.21
P3H4-207ENST00000590496 PRDM2Q13029 1718 aa47.37■■■■■ 5.17
P3H4-207ENST00000590496 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
P3H4-207ENST00000590496 TOPBP1Q92547 1522 aa46.88■■■■■ 5.09
P3H4-207ENST00000590496 ABCC8Q09428 1581 aa46.81■■■■■ 5.08
P3H4-207ENST00000590496 IFT140Q96RY7 1462 aa46.75■■■■■ 5.07
P3H4-207ENST00000590496 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.73■■■■■ 5.07
P3H4-207ENST00000590496 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
P3H4-207ENST00000590496 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
P3H4-207ENST00000590496 OSCARQ8IYS5 282 aa46.56■■■■■ 5.04
P3H4-207ENST00000590496 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
P3H4-207ENST00000590496 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
P3H4-207ENST00000590496 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
P3H4-207ENST00000590496 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.31■■■■■ 5
P3H4-207ENST00000590496 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.27■■■■■ 5
P3H4-207ENST00000590496 SOGA1O94964 1423 aa46.26■■■■■ 5
P3H4-207ENST00000590496 CUX1P39880 1505 aa46.25■■■■■ 4.99
P3H4-207ENST00000590496 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.2■■■■■ 4.99
P3H4-207ENST00000590496 TRIM41Q8WV44 630 aa46.18■■■■■ 4.98
P3H4-207ENST00000590496 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
P3H4-207ENST00000590496 CHD1O14646 1710 aa45.96■■■■■ 4.95
P3H4-207ENST00000590496 WDR97A6NE52 1622 aa45.95■■■■■ 4.95
P3H4-207ENST00000590496 FBLN2P98095 1184 aa45.91■■■■■ 4.94
P3H4-207ENST00000590496 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.84■■■■■ 4.93
P3H4-207ENST00000590496 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.84■■■■■ 4.93
P3H4-207ENST00000590496 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.84■■■■■ 4.93
P3H4-207ENST00000590496 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.8■■■■■ 4.92
P3H4-207ENST00000590496 GRIN2BQ13224 1484 aa45.77■■■■■ 4.92
P3H4-207ENST00000590496 ARHGEF11O15085 1522 aa45.74■■■■■ 4.91
P3H4-207ENST00000590496 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.72■■■■■ 4.91
P3H4-207ENST00000590496 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
P3H4-207ENST00000590496 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.68■■■■■ 4.9
P3H4-207ENST00000590496 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.67■■■■■ 4.9
P3H4-207ENST00000590496 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
P3H4-207ENST00000590496 TOP2BQ02880 1626 aa45.63■■■■■ 4.9
P3H4-207ENST00000590496 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.63■■■■■ 4.89
P3H4-207ENST00000590496 PBRM1Q86U86 1689 aa45.6■■■■■ 4.89
P3H4-207ENST00000590496 SYNJ1O43426 1573 aa45.58■■■■■ 4.89
P3H4-207ENST00000590496 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.58■■■■■ 4.89
P3H4-207ENST00000590496 SYNJ2O15056 1496 aa45.55■■■■■ 4.88
P3H4-207ENST00000590496 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.45■■■■■ 4.87
P3H4-207ENST00000590496 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.44■■■■■ 4.86
P3H4-207ENST00000590496 ARAP1Q96P48 1450 aa45.33■■■■■ 4.85
P3H4-207ENST00000590496 ADAMTS12P58397 1594 aa45.18■■■■■ 4.82
P3H4-207ENST00000590496 GRIN2AQ12879 1464 aa45.17■■■■■ 4.82
P3H4-207ENST00000590496 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.14■■■■■ 4.82
P3H4-207ENST00000590496 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.12■■■■■ 4.81
P3H4-207ENST00000590496 NUP160Q12769 1436 aa45.01■■■■■ 4.8
P3H4-207ENST00000590496 CEP170Q5SW79 1584 aa44.99■■■■■ 4.79
P3H4-207ENST00000590496 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.79■■■■■ 4.76
P3H4-207ENST00000590496 KIF27Q86VH2 1401 aa44.77■■■■■ 4.76
P3H4-207ENST00000590496 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
P3H4-207ENST00000590496 SHROOM2Q13796 1616 aa44.75■■■■■ 4.75
P3H4-207ENST00000590496 IGF1RP08069 1367 aa44.75■■■■■ 4.75
P3H4-207ENST00000590496 JPH4Q96JJ6 628 aa44.63■■■■■ 4.74
P3H4-207ENST00000590496 CUL7Q14999 1698 aa44.56■■■■■ 4.72
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